WikiDer > EIF1

EIF1
EIF1
Белок EIF1 PDB 2if1.png
Доступные конструкции
PDBПоиск Human UniProt: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыEIF1, A121, EIF-1, EIF1A, ISO1, SUI1, эукариотический фактор инициации трансляции 1, эукариотический фактор инициации 1
Внешние идентификаторыГомолоГен: 130538 Генные карты: EIF1
Расположение гена (человек)
Хромосома 17 (человек)
Chr.Хромосома 17 (человек)[1]
Хромосома 17 (человек)
Геномное расположение EIF1
Геномное расположение EIF1
Группа17q21.2Начинать41,688,885 бп[1]
Конец41,692,668 бп[1]
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_005801

н / д

RefSeq (белок)

NP_005792

н / д

Расположение (UCSC)Chr 17: 41.69 - 41.69 Мбн / д
PubMed поиск[2]н / д
Викиданные
Просмотр / редактирование человека

Фактор инициации трансляции эукариот 1 (eIF1) это белок что у людей кодируется EIF1 ген. Это связано с дрожжами SUI1.[3][4][5]

eIF1 взаимодействует с эукариотическим малым (40S) субъединица рибосомы и eIF3, и является компонентом преинициативного комплекса 43S (PIC).[6] eIF1 и eIF1A кооперативно связываются с 40S, чтобы стабилизировать «открытую» конформацию преинициативного комплекса (PIC) во время эукариотический перевод инициация.[6] eIF1 связывается с областью около рибосомного Сайт в субъединице 40S и функционирует аналогично структурно родственному бактериальному аналогу IF1.[7]

Структура

eIF1 - это консервативный белок трансляции во всех эукариотических клетках, который отвечает за исследование несовпадений кодонов и антикодонов во время инициации трансляции. Для определения структуры человеческого eIF1 с помощью ЯМР-спектроскопии проводят эксперимент с N-концевой меткой His и eIF1. Ученые обнаружили сайт связывания, генерируя мутацию дрожжей, и изучили соседние консервативные остатки, расположенные в том же регионе. Эксперименты GST pull-down показали, что eIF1 связывается именно с субъединицей p110 eIF3, что объясняет рекрутирование eIF1. [8]

Функция

Функция eIf1 имеет несколько скрытых аспектов. Однако во всех эукариотических клетках инициация трансляции мРНК начинается со сканирования рибосомных преинициативных комплексов 43S, начиная с 5 ’конца мРНК. Далее, индукция через eIF1 и eIF1A необходима для выявления конформации субъединицы 40S, чтобы индуцировать DEAD-бокс-РНК-геликазу eIF4A, ее кофактор eIF4B и активность eIF4G.[9]   

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000173812 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  3. ^ Филдс С., Адамс, доктор медицины (январь 1994 г.). «Экспрессированные теги последовательностей идентифицируют человеческий изолог индивидуального фактора инициации трансляции». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 198 (1): 288–91. Дои:10.1006 / bbrc.1994.1040. PMID 7904817.
  4. ^ Шейх М.С., Фернандес-Салас Э., Ю М., Хуссейн А., Динман Дж. Д., Пельц С.В., Хуанг Ю., Форнас А.Дж. (июнь 1999 г.). «Клонирование и характеристика человеческой генотоксической и индуцируемой стрессом эндоплазматического ретикулума кДНК, которая кодирует фактор инициации трансляции 1 (eIF1 (A121 / SUI1))». Журнал биологической химии. 274 (23): 16487–93. Дои:10.1074 / jbc.274.23.16487. PMID 10347211.
  5. ^ «Ген Entrez: фактор инициации эукариотической трансляции 1 EIF1».
  6. ^ а б Эйткен К.Э., Лорш-младший (июнь 2012 г.). «Механистический обзор инициации трансляции у эукариот». Структурная и молекулярная биология природы. 19 (6): 568–76. Дои:10.1038 / nsmb.2303. PMID 22664984. S2CID 9201095.
  7. ^ Fraser CS (июль 2015 г.). «Количественные исследования рекрутирования мРНК на рибосому эукариот». Биохимия. 114: 58–71. Дои:10.1016 / j.biochi.2015.02.017. ЧВК 4458453. PMID 25742741.
  8. ^ Флетчер CM, Пестова Т.В., Hellen CU, Wagner G (май 1999 г.). «Структура и взаимодействие фактора инициации трансляции eIF1». Журнал EMBO. 18 (9): 2631–7. Дои:10.1093 / emboj / 18.9.2631. ЧВК 1171342. PMID 10228174.
  9. ^ Джексон Р.Дж., Хеллен К.Ю., Пестова Т.В. (февраль 2010 г.). «Механизм инициации эукариотической трансляции и принципы его регуляции». Обзоры природы. Молекулярная клеточная биология. 11 (2): 113–27. Дои:10.1038 / nrm2838. ЧВК 4461372. PMID 20094052.
  10. ^ «EIF1 - фактор инициации трансляции 1 эукариот - Homo sapiens (человек) - ген и белок EIF1». www.uniprot.org. Получено 2018-09-23.

дальнейшее чтение

внешняя ссылка