WikiDer > Ламинин, бета 2

Laminin, beta 2
LAMB2
Идентификаторы
ПсевдонимыLAMB2, LAMS, NPHS5, ламинин, бета 2, субъединица ламинина бета 2
Внешние идентификаторыOMIM: 150325 MGI: 99916 ГомолоГен: 1723 Генные карты: LAMB2
Расположение гена (человек)
Хромосома 3 (человек)
Chr.Хромосома 3 (человек)[1]
Хромосома 3 (человек)
Геномное расположение LAMB2
Геномное расположение LAMB2
Группа3п21.31Начните49,121,114 бп[1]
Конец49,133,118 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE LAMB2 216264 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_002292

NM_008483

RefSeq (белок)

NP_002283

NP_032509

Расположение (UCSC)Chr 3: 49.12 - 49.13 МбChr 9: 108,48 - 108,49 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Субъединица бета-2 ламинина это белок что у людей кодируется LAMB2 ген.[5][6][7]

Функция

Ламинины, семейство гликопротеинов внеклеточного матрикса, являются основным неколлагеновым компонентом базальных мембран. Они вовлечены в широкий спектр биологических процессов, включая клеточную адгезию, дифференциацию, миграцию, передачу сигналов, рост нейритов и метастазирование. Ламинины состоят из 3-х неидентичных цепей: ламинина альфа, бета и гамма (ранее A, B1 и B2 соответственно), и они образуют крестообразную структуру, состоящую из 3 коротких ветвей, каждое из которых образовано отдельной цепью, и длинной руки, состоящей из всех 3 цепей. Каждая цепь ламинина представляет собой мультидоменный белок, кодируемый отдельным геном. Было описано несколько изоформ каждой цепи. Различные изомеры альфа-, бета- и гамма-цепей объединяются с образованием разных гетеротримерных изоформ ламинина, которые ранее обозначались арабскими цифрами в порядке их открытия, например Гетеротример alpha1beta1gamma1 был известен как ламинин 1, но в настоящее время номенклатура требует использования номеров каждой отдельной изоформы субъединицы ламинина, например то, что раньше было Ламинин 1, теперь Ламинин 111, и то, что раньше было Laminin 5, теперь Laminin 332.[8] Биологические функции различных цепей и молекул тримеров в значительной степени неизвестны, но было показано, что некоторые из цепей различаются в отношении их тканевого распределения, предположительно отражая различные функции in vivo. Этот ген кодирует изоформу бета-цепи ламинина, бета 2. Цепь бета 2 содержит 7 структурных доменов, типичных для бета-цепей ламинина, включая короткую альфа-область. Однако, в отличие от цепи бета 1, бета 2 имеет более ограниченное распределение в тканях. Он обогащен базальной мембраной мышц нервно-мышечных соединений, почечных клубочков и гладких мышц сосудов. У трансгенных мышей, у которых ген бета-2 цепи был инактивирован путем гомологичной рекомбинации, обнаружены дефекты созревания нервно-мышечных соединений и нарушение клубочковой фильтрации. Сообщалось об альтернативном сплайсинге с участием неконсенсусного 5 'сайта сплайсинга (gc) в 5' UTR этого гена. Было высказано предположение, что неэффективный сплайсинг этого первого интрона, который не изменяет последовательность белка, приводит к большему количеству un[7]

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000172037 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000052911 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Хантер Д. Д., Шах В., Мерли Дж. П., Санес-младший (март 1989 г.). «Ламинин-подобный адгезивный белок, сконцентрированный в синаптической щели нервно-мышечного соединения». Природа. 338 (6212): 229–34. Дои:10.1038 / 338229a0. PMID 2922051. S2CID 4313384.
  6. ^ Дуркин М.Э., Егер А.С., Хурана Т.С., Нильсен ФК, Альбрехтсен Р., Вевер УМ (июль 1999 г.). «Характеристика локуса цепи бета2 ламинина человека (LAMB2): связь с геном, содержащим непроцессированный транскрибируемый псевдоген LAMB2-подобный (LAMB2L), и с геном, кодирующим глутаминил тРНК синтетазу (QARS)». Цитогенетика и клеточная генетика. 84 (3–4): 173–8. Дои:10.1159/000015249. PMID 10393422. S2CID 36315977.
  7. ^ а б «Ген Entrez: ламинин LAMB2, бета 2 (ламинин S)».
  8. ^ Aumailley M, Bruckner-Tuderman L, Carter WG, Deutzmann R, Edgar D, Ekblom P, Engel J, Engvall E, Hohenester E, Jones JC, Kleinman HK, Marinkovich MP, Martin GR, Mayer U, Meneguzzi G, Miner JH, Миядзаки К., Патарройо М., Полссон М., Кваранта В., Санес Дж. Р., Сасаки Т., Секигучи К., Сорокин Л. М., Тальтс Дж. Ф., Трюггвасон К., Уитто Дж., Виртанен И., фон дер Марк К., Вевер У. М., Ямада Ю., Юрченко П. Д. ( Август 2005 г.). «Упрощенная номенклатура ламинина». Матричная биология. 24 (5): 326–32. Дои:10.1016 / j.matbio.2005.05.006. PMID 15979864.

дальнейшее чтение