WikiDer > PRPF6

PRPF6
PRPF6
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыPRPF6, ANT-1, ANT1, C20orf14, Prp6, RP60, SNRNP102, TOM, U5-102K, hPrp6, фактор обработки пре-мРНК 6
Внешние идентификаторыOMIM: 613979 MGI: 1922946 ГомолоГен: 5368 Генные карты: PRPF6
Расположение гена (человек)
Хромосома 20 (человек)
Chr.Хромосома 20 (человек)[1]
Хромосома 20 (человек)
Геномное расположение PRPF6
Геномное расположение PRPF6
Группа20q13.33Начните63,981,132 бп[1]
Конец64,033,100 бп[1]
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_012469

NM_133701

RefSeq (белок)

NP_036601

NP_598462

Расположение (UCSC)Chr 20: 63.98 - 64.03 МбChr 2: 181,59 - 181,66 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Фактор пре-мРНК-процессинга 6 это белок что у людей кодируется PRPF6 ген.[5][6][7]

Белок, кодируемый этим геном, по-видимому, участвует в сплайсинге пре-мРНК, возможно, действуя как фактор связывания между мяРНП U5 и U4 / U6 при формировании сплайсосомы. Кодируемый белок также может связывать рецептор андрогена, обеспечивая связь между активацией транскрипции и сплайсингом.[7]

Взаимодействия

PRPF6 был показан взаимодействовать с участием TXNL4B,[8] ARAF[9][10] и Рецептор андрогенов.[11]

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000101161 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000002455 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Нишикими А., Мукаи Дж., Киока Н., Ямада М. (январь 2000 г.). «Новый ядерный белок млекопитающих, подобный факторам сплайсинга пре-мРНК Schizosaccharomyces pombe Prp1p / Zer1p и Saccharomyces cerevisiae Prp6p». Biochim Biophys Acta. 1435 (1–2): 147–52. Дои:10.1016 / s0167-4838 (99) 00203-4. PMID 10561546.
  6. ^ Макаров Е.М., Макарова О.В., Ахсель Т., Лурманн Р. (июнь 2000 г.). «Человеческий гомолог дрожжевого фактора сплайсинга prp6p содержит несколько элементов TPR и стабильно связан с snRNP U5 посредством белок-белковых взаимодействий». Дж Мол Биол. 298 (4): 567–75. Дои:10.1006 / jmbi.2000.3685. PMID 10788320.
  7. ^ а б «Ген Entrez: PRPF6 PRP6, гомолог фактора 6 процессинга пре-мРНК (S. cerevisiae)».
  8. ^ Сунь, Сяоцзин; Чжан Хуа; Ван Дань; Ма Далонг; Шен Ян; Шан Юнфэн (июль 2004 г.). «DLP, новый белок семейства Dim1, участвующий в сплайсинге пре-мРНК и прогрессировании клеточного цикла». J. Biol. Chem. Соединенные Штаты. 279 (31): 32839–47. Дои:10.1074 / jbc.M402522200. ISSN 0021-9258. PMID 15161931.
  9. ^ Юрьев, Антон; Венногл Лоуренс П. (февраль 2003 г.). «Новые белок-белковые взаимодействия киназы raf, обнаруженные исчерпывающим двухгибридным анализом дрожжей». Геномика. Соединенные Штаты. 81 (2): 112–25. Дои:10.1016 / S0888-7543 (02) 00008-3. ISSN 0888-7543. PMID 12620389.
  10. ^ Юрьев А; Ono M; Гофф С.А. Macaluso F; Венногле Л. П. (июль 2000 г.). «Изоформ-специфическая локализация A-RAF в митохондриях». Мол. Cell. Биол. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ. 20 (13): 4870–8. Дои:10.1128 / MCB.20.13.4870-4878.2000. ISSN 0270-7306. ЧВК 85938. PMID 10848612.
  11. ^ Чжао, Юэ; Гото Киминобу; Сайто Масаюки; Янасэ Тошихико; Номура Масатоши; Окабе Тайджиро; Такаянаги Рёичи; Навата Хадзиме (август 2002 г.). «Домен функции активации-1 рецептора андрогена способствует взаимодействию между компартментом субядерного фактора сплайсинга и компартментом ядерного рецептора. Идентификация белка, связывающего частицу небольшого ядерного рибонуклеопротеина p102 U5, в качестве коактиватора для рецептора». J. Biol. Chem. Соединенные Штаты. 277 (33): 30031–9. Дои:10.1074 / jbc.M203811200. ISSN 0021-9258. PMID 12039962.

дальнейшее чтение

внешние ссылки