WikiDer > HLA-B52
B * 5101-β2MG со связанным пептидом 1e27 | ||
главный комплекс гистосовместимости (человек), класс I, B52 | ||
Аллели | В * 5201, 5202, 5203,. . . | |
Структура (Видеть HLA-B) | ||
Общие данные | ||
Locus | chr.6 6п21.31 |
HLA-B52 (B52) - это HLA-B серотип. Серотип определяет наиболее распространенные генные продукты HLA-B * 52.[1]
B52 - это расщепленный антиген из широкий антиген B5, и является сестринским типом B51. B * 5201, вероятно, образовался в результате преобразование гена событие между другим аллелем HLA-B и HLA-B * 5101.[2]В группе аллелей B * 52 имеется ряд аллелей.[3]
Серотип
В * 52 | B52 | B5 | B51 | B53 | Образец |
аллель | % | % | % | % | размер (N) |
*5201 | 84 | 2 | 7 | 1 | 2823 |
Ссылка на все аллели на IMGT/HLA База данных на EBI |
частота | ||
исх. | численность населения | (%) |
[5] | Китай Юньнань Лису | 21.7 |
[5] | Китай Юньнань Ну | 18.6 |
[5] | Болгария цыганская | 18.2 |
[5] | Венесуэла Сьерра-де-Периха Юкпа | 12.8 |
[5] | Индия Андхра-Прадеш Голла | 12.0 |
[5] | Япония Центральная | 10.7 |
[5] | Япония | 10.4 |
[5] | Грузия Тибилиси Курды | 10.3 |
[5] | Мали Бандиагара | 8.3 |
[5] | Южная Африка Натал Тамил | 8.2 |
[5] | Израиль Ашк. и не-ашк. Евреи | 7.3 |
[5] | Индусы Северной Индии | 6.7 |
[5] | Китай Пекин | 6.1 |
[5] | Индия Нью-Дели | 6.1 |
[5] | Индия Мумбаи Маратхи | 5.6 |
[5] | Тунис Ганнуш | 5.5 |
[5] | Таиланд pop3 | 5.1 |
[5] | Парсы западного побережья Индии | 5.0 |
[5] | Индия Северный Дели | 4.9 |
[5] | Мексика Местис | 4.9 |
[5] | Аргентина Тоба Росарио | 4.7 |
[5] | Мексика Zaptotec Oaxaca | 4.5 |
[5] | США испаноязычный | 4.5 |
[5] | Китай Цинхай Хуэй | 4.1 |
[5] | Китай Внутренняя Монголия | 3.9 |
[5] | Китай Северная Хань | 3.8 |
[5] | Оман | 3.8 |
[5] | Сенегал Ниохоло Манденка | 3.7 |
[5] | Болгария | 3.6 |
[5] | Таиланд | 3.5 |
[5] | Кот-д'Ивуар Akan Adiopodoume | 3.4 |
[5] | Венесуэла Перха Гора Бари | 3.4 |
[5] | Италия Северная поп 1 | 3.3 |
[5] | Суданский | 3.3 |
[5] | румынский | 3.2 |
[5] | Сингапур Риау Малайский | 3.0 |
[5] | Автономный регион Тибетцы | 2.8 |
[5] | Россия Тува поп 2 | 2.8 |
[5] | Южная Корея поп 3 | 2.8 |
[5] | Иран Белудж | 2.5 |
[5] | Тунис | 2.5 |
[5] | Иордания Амман | 2.4 |
[5] | США Гавайи Окинава | 2.4 |
[5] | Сингапурские яванские индонезийцы | 2.0 |
[5] | Испания Восточная Андалусия | 1.8 |
[5] | Македония поп 4 | 1.6 |
[5] | Уганда Кампала | 1.6 |
[5] | Бельгия | 1.5 |
[5] | Мексика Гвадалахара Mestizos pop2 | 1.5 |
[5] | Сингапур Тайский | 1.5 |
[5] | Бразилия | 1.4 |
[5] | Китай Юньнань Лису | 1.4 |
[5] | Азорские острова Санта-Мария и Сан-Мигель | 1.3 |
[5] | Юго-Восток Франции | 1.2 |
[5] | Италия Северная Павия | 1.2 |
[5] | Саудовская Аравия Guraiat and Hail | 1.2 |
[5] | Мексика Штат Чиуауа Тараумара | 1.1 |
[5] | Тунис Тунис | 1.1 |
[5] | Израильские арабские друзы | 1.0 |
[5] | Япония Айну Хоккайдо | 1.0 |
[5] | Центр Португалии | 1.0 |
[5] | Сингапурский китайский | 1.0 |
[5] | Тайвань Миннан поп 1 | 1.0 |
[5] | США Кавказский | 1.0 |
[5] | Центральные острова Азорских островов | 0.9 |
[5] | Китай Южный Хан | 0.9 |
[5] | Македония поп 4 | 0.7 |
[5] | Марокко Надор Металса Класс I | 0.7 |
[5] | Грузия Сванети Сваны | 0.6 |
[5] | Южная Ирландия | 0.6 |
[5] | Италия Бергамо | 0.6 |
Аллели
Имеется 18 аллелей с 14 вариантами аминокислотной последовательности в B52. Из них только 9 встречаются достаточно часто, чтобы иметь надежный серотип. В * 5201 является наиболее распространенным, но другие имеют большое региональное распространение.
Болезнь
При язвенном колите
HLA-B52, по-видимому, имеет самую сильную связь с язвенный колит в Японии.[6][7] Эта форма заболевания часто встречается при Артериит Такаясу.[8][9]
При артериите Такаясу
Артериит Такаясу имеет независимую связь с заболеванием, ассоциированным с B52.[10][11] Связь с B * 5201 увеличивает риск легочного инфаркт, ишемическая болезнь сердца, аортальная регургитация, системный гипертония, стеноз почечной артерии, цереброваскулярное заболеваниеи нарушение зрения.[12]
Рекомендации
- ^ Marsh, S.G .; Альберт, Э. Д .; Bodmer, W. F .; Bontrop, R.E .; Dupont, B .; Erlich, H.A .; Fernández-Viña, M .; Герати, Д. Э .; Holdsworth, R .; Hurley, C.K .; Lau, M .; Lee, K. W .; Мах, Б .; Maiers, M .; Mayr, W. R .; Müller, C.R .; Parham, P .; Petersdorf, E.W .; Сасадзуки, Т .; Strominger, J. L .; Svejgaard, A .; Terasaki, P. I .; Tiercy, J.M .; Троусдейл, Дж. (2010). «Номенклатура факторов системы HLA, 2010». Тканевые антигены. 75 (4): 291–455. Дои:10.1111 / j.1399-0039.2010.01466.x. ЧВК 2848993. PMID 20356336.
- ^ Кокс С.Т., Маквинни А.Дж., Робинсон Дж. И др. (Январь 2003 г.). «Клонирование и секвенирование полноразмерных генов HLA-B и -C» (PDF). Тканевые антигены. 61 (1): 20–48. Дои:10.1034 / j.1399-0039.2003.610103.x. PMID 12622774. Архивировано из оригинал (PDF) на 2008-10-28. Получено 2008-08-03.
- ^ Хаяси Х., Эннис П.Д., Арига Х. и др. (Январь 1989 г.). «HLA-B51 и HLA-Bw52 отличаются только двумя аминокислотами, которые находятся в спиральной области домена альфа 1». J. Immunol. 142 (1): 306–11. PMID 2909619.
- ^ получено из IMGT / HLA
- ^ а б c d е ж грамм час я j k л м п о п q р s т ты v ш Икс у z аа ab ac объявление ае аф аг ах ай эй ак аль являюсь ан ао ap водный ар в качестве в au средний ау топор ай az ба bb до н.э bd быть парень bg бх би Ъ bk бл бм млрд бо бп бк br bs Миддлтон Д., Менчака Л., Руд Н., Комеровски Р. (2003). «Новая база данных частот аллелей: http://www.allelefrequencies.net". Тканевые антигены. 61 (5): 403–7. Дои:10.1034 / j.1399-0039.2003.00062.x. PMID 12753660. Внешняя ссылка в
| название =
(помощь) - ^ Сугимура К., Асакура Х., Мизуки Н. и др. (Февраль 1993 г.). «Анализ генов в области HLA, влияющих на предрасположенность к язвенному колиту». Гм. Иммунол. 36 (2): 112–8. Дои:10.1016 / 0198-8859 (93) 90113-Ф. PMID 8096500.
- ^ Номура Э., Киноути Ю., Негоро К. и др. (Сентябрь 2004 г.). «Картирование локуса восприимчивости к болезни в хромосоме 6p у японских пациентов с язвенным колитом». Гены иммунной. 5 (6): 477–83. Дои:10.1038 / sj.gene.6364114. PMID 15215890.
- ^ Оянаги, Хиронобу; Ishihata, R; Ishikawa, H; и другие. (Февраль 1994 г.), «Язвенный колит, связанный с болезнью Такаясу», Междунар. Med., 33 (2): 127–129, Дои:10.2169 / internalmedicine.33.127, PMID 7912572
- ^ Сато, Р. Сато, Y; Ishikawa, H; и другие. (Декабрь 1994 г.), «Болезнь Такаясу, связанная с язвенным колитом», Междунар. Med., 33 (12): 759–763, Дои:10.2169 / internalmedicine.33.759, PMID 7718956
- ^ Кимура А., Китамура Х, Дэйт У, Нумано Ф (август 1996). «Комплексный анализ генов HLA при артериите Такаясу в Японии». Int. Дж. Кардиол. 54 Дополнение: S61–9. Дои:10.1016 / s0167-5273 (96) 88774-2. PMID 9119528.
- ^ Йошида М., Кимура А., Кацураги К., Нумано Ф., Сасадзуки Т. (август 1993 г.). «Типирование ДНК гена HLA-B при артериите Такаясу». Тканевые антигены. 42 (2): 87–90. Дои:10.1111 / j.1399-0039.1993.tb02242.x. PMID 7903491.
- ^ Китамура Х., Кобаяши Й., Кимура А., Нумано Ф. (октябрь 1998 г.). «Ассоциация клинических проявлений с аллелями HLA-B при артериите Такаясу». Int. Дж. Кардиол. 66 Приложение 1: S121–6. Дои:10.1016 / S0167-5273 (98) 00159-4. PMID 9951811.