WikiDer > Список секвенированных геномов животных

List of sequenced animal genomes

Этот список секвенированных геномов животных содержит виды животных, для которых собраны, аннотированы и опубликованы полные последовательности генома. Включены по существу полные черновые варианты геномов, но не частичные последовательности генома или последовательности только органелл.

Этот список неполный; вы можете помочь добавление недостающих предметов с надежные источники.

Porifera

Гребневик

Placozoa

Книдария

Deuterostomia

Полухордовые

Иглокожие

Оболочки

Цефалохордовые

Циклостомы

Хрящевые рыбы

Костяная рыба

Амфибии

Рептилии

Птицы

Млекопитающие

Протостомия

Насекомые

Ракообразные

Хелицераты

Из них паукообразные:

Myriapoda

Тихоходки

Моллюски

Платигельминты

Нематоды

Аннелиды

Брахиоподы

Коловратка

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ Шривастава М., Симаков О., Чепмен Дж., Фэи Б., Готье М.Э., Митрос Т. и др. (Август 2010 г.). «Геном Amphimedon queenslandica и эволюция сложности животных». Природа. 466 (7307): 720–6. Bibcode:2010Натура.466..720С. Дои:10.1038 / природа09201. ЧВК 3130542. PMID 20686567.
  2. ^ а б Ryu T, Seridi L, Moitinho-Silva L, Oates M, Liew YJ, Mavromatis C и др. (Февраль 2016). «Гологеномный анализ двух морских губок с разными микробиомами». BMC Genomics. 17 (1): 158. Дои:10.1186 / s12864-016-2501-0. ЧВК 4772301. PMID 26926518.
  3. ^ Кенни Н., Фрэнсис В. и др. (Июль 2020 г.). «Отслеживание геномной эволюции животных с помощью сборки на хромосомном уровне пресноводной губки Ephydatia muelleri». Nature Communications. 11 (1): 720–6. Bibcode:2020NatCo..11.3676K. Дои:10.1038 / с41467-020-17397-в. ЧВК 7385117. PMID 32719321.
  4. ^ Национальный институт исследования генома человека (2012). «Проект NHGRI Mnemiopsis Genome Project». Получено 2013-02-05.
  5. ^ Райан Дж. Ф., Панг К., Шницлер К. Э., Нгуен А. Д., Морленд Р. Т., Симмонс Д. К. и др. (Декабрь 2013). «Геном гребневика Mnemiopsis leidyi и его значение для эволюции типов клеток». Наука. 342 (6164): 1242592. Дои:10.1126 / science.1242592. ЧВК 3920664. PMID 24337300.
  6. ^ Мороз Л.Л., Кокот К.М., Цитарелла М.Р., Досунг С., Норекян Т.П., Поволоцкая И.С. и др. (Июнь 2014 г.). «Геном гребневика и эволюционное происхождение нейронных систем». Природа. 510 (7503): 109–14. Bibcode:2014Натура.510..109М. Дои:10.1038 / природа13400. ЧВК 4337882. PMID 24847885.
  7. ^ Шривастава М., Бегович Э., Чапман Дж., Путнам Н.Х., Хеллстен Ю., Кавашима Т. и др. (Август 2008 г.). «Геном Trichoplax и природа плакозоя». Природа. 454 (7207): 955–60. Bibcode:2008Натура.454..955S. Дои:10.1038 / природа07191. PMID 18719581. S2CID 4415492.
  8. ^ Эйтель М., Фрэнсис В.Р., Вароко Ф., Дарасп Дж., Осигус Х.Д., Кребс С. и др. (Июль 2018). «Сравнительная геномика и природа видов плакозоя». PLOS Биология. 16 (7): e2005359. Дои:10.1371 / journal.pbio.2005359. ЧВК 6067683. PMID 30063702.
  9. ^ Чапман Дж. А., Киркнесс Э. Ф., Симаков О., Хэмпсон С. Е., Митрос Т., Вайнмайер Т. и др. (Март 2010 г.). «Динамический геном гидры». Природа. 464 (7288): 592–6. Bibcode:2010Натура.464..592C. Дои:10.1038 / природа08830. ЧВК 4479502. PMID 20228792.
  10. ^ Putnam NH, Srivastava M, Hellsten U, Dirks B, Chapman J, Salamov A, et al. (Июль 2007 г.). «Геном морского анемона раскрывает репертуар и геномную организацию наследственного гена эвметазоана». Наука. 317 (5834): 86–94. Bibcode:2007Научный ... 317 ... 86P. Дои:10.1126 / science.1139158. PMID 17615350. S2CID 9868191.
  11. ^ Баумгартен С., Симаков О., Эшерик Л. Я., Лью Ю. Дж., Ленерт Е. М., Мичелл С. Т. и др. (Сентябрь 2015 г.). «Геном Aiptasia, модель морского анемона для кораллового симбиоза». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 112 (38): 11893–8. Bibcode:2015ПНАС..11211893Б. Дои:10.1073 / pnas.1513318112. ЧВК 4586855. PMID 26324906.
  12. ^ Синдзато К., Сёгучи Е., Кавасима Т., Хамада М., Хисата К., Танака М. и др. (Июль 2011 г.). «Использование генома Acropora digitifera для понимания реакции кораллов на изменение окружающей среды». Природа. 476 (7360): 320–3. Bibcode:2011Натура.476..320S. Дои:10.1038 / природа10249. PMID 21785439. S2CID 4364757.
  13. ^ Цзян Дж (2017). "Геном Renilla muelleri". рифгеномика.
  14. ^ Цзян Дж. Б., Кваттрини А. М., Фрэнсис В. Р., Райан Дж. Ф., Родригес Э., Макфадден К. С. (апрель 2019 г.). «Гибрид de novo сборки генома морских анютиных глазок (Renilla muelleri)». GigaScience. 8 (4). Дои:10.1093 / gigascience / giz026. ЧВК 6446218. PMID 30942866.
  15. ^ Вулстра С.Р., Ли Й., Лью Ю.Дж., Баумгартен С., Зоккола Д., Флот Дж. Ф. и др. (Декабрь 2017 г.). «Сравнительный анализ геномов Stylophora pistillata и Acropora digitifera свидетельствует о значительных различиях между видами кораллов». Научные отчеты. 7 (1): 17583. Bibcode:2017НатСР ... 717583В. Дои:10.1038 / с41598-017-17484-х. ЧВК 5730576. PMID 29242500.
  16. ^ Голд Д.А., Кацуки Т., Ли Й, Ян Х, Регульски М., Ибберсон Д. и др. (Январь 2019). «Геном медузы Аурелии и эволюция сложности животных» (PDF). Природа Экология и эволюция. 3 (1): 96–104. Дои:10.1038 / с41559-018-0719-8. PMID 30510179. S2CID 54437176.
  17. ^ Леклер Л., Хорин С., Шевалье С., Лапеби П., Дрю П., Перон С. и др. (Май 2019). «Геном медузы Clytia hemisphaerica и эволюция жизненного цикла книдарий». Природа Экология и эволюция. 3 (5): 801–810. Дои:10.1038 / s41559-019-0833-2. PMID 30858591. S2CID 73728941.
  18. ^ Каннинг Р., Бэй Р.А., Жилетт П., Бейкер А.С., Трейлор-Ноулз и др. (2018). «Сравнительный анализ генома Pocillopora damicornis подчеркивает роль иммунной системы в эволюции кораллов». Научные отчеты. 8 (1): 16134. Bibcode:2018НатСР ... 816134C. Дои:10.1038 / s41598-018-34459-8. ЧВК 6208414. PMID 30382153.
  19. ^ Prada C, Hanna B, Budd AF, Woodley CM, Schmutz J, Grimwood J, Iglesias-Prieto R, Pandolfi JM, Levitan D, Johnson KG, DiGiorgio M, et al. (2016). «В 2016 году пустые ниши после вымирания увеличивают численность современных кораллов». Текущая биология. 1 (26): 3190–3194. Дои:10.1016 / j.cub.2016.09.039. PMID 27866895. S2CID 188206.
  20. ^ Ким Х.М., Вебер Дж. А., Ли Н., Пак С. Г., Чо И. С., Бхак И. и др. (Март 2019 г.). «Геном гигантской медузы Номуры проливает свет на раннюю эволюцию активного хищничества». BMC Биология. 17 (1): 28. Дои:10.1186 / s12915-019-0643-7. ЧВК 6441219. PMID 30925871.
  21. ^ Ли И, Гао Л., Пань И, Тиан М., Ли И, Хе С и др. (Апрель 2020 г.). «Эталонный геном на уровне хромосом медузы Rhopilema esculentum». GigaScience. 9 (4). Дои:10.1093 / gigascience / giaa036. ЧВК 7172023. PMID 32315029.
  22. ^ а б c Ohdera A, Ames CL, Dikow RB, Kayal E, Chiodin M, Busby B и др. (Июль 2019). «Коробка, стебель и перевернутая голова? Наброски геномов различных линий медуз (Cnidaria, Acraspeda): Alatina alata (Cubozoa), Calvadosia cruxmelitensis (Staurozoa) и Cassiopea xamachana (Scyphozoa)». GigaScience. 8 (7). Дои:10.1093 / gigascience / giz069. ЧВК 6599738. PMID 31257419.
  23. ^ Jeon Y, Park SG, Lee N, Weber JA, Kim HS, Hwang SJ и др. (Март 2019 г.). "Проект генома октокорала, Dendronephthya gigantea". Геномная биология и эволюция. 11 (3): 949–953. Дои:10.1093 / gbe / evz043. ЧВК 6447388. PMID 30825304.
  24. ^ Кук, Ира; Инь, Хуа; Форе, Сильвен; Бонгаертс, Пим; Стругнелл, Ян М .; Симаков Олег; Чжан, Цзя; Филд, Мэтт А .; Родригес-Ланетти, Маурисио; Белл, Сара С .; Борн, Дэвид Г. (01.11.2020). «Геномные сигнатуры кораллового холобионта выявляют адаптацию хозяина, обусловленную изменением климата голоцена и симбионтами, характерными для рифов». Достижения науки. 6 (48): eabc6318. Дои:10.1126 / sciadv.abc6318. ISSN 2375-2548. PMID 33246955 Проверять | pmid = ценить (помощь). S2CID 227179581.
  25. ^ а б Симаков О., Кавашима Т., Марлетаз Ф., Дженкинс Дж., Коянаги Р., Митрос Т. и др. (Ноябрь 2015 г.). «Геномы полухордовых и происхождение дейтеростома». Природа. 527 (7579): 459–65. Bibcode:2015Натура.527..459S. Дои:10.1038 / природа16150. ЧВК 4729200. PMID 26580012.
  26. ^ Баумэн К.В., Макдугалл К., Камминс С.Ф., Холл М, Дегнан Б.М., Сато Н., Шогучи Э. (декабрь 2014 г.). «Геномная организация кластеров Hox и ParaHox в иглокожих, Acanthaster planci». Бытие. 52 (12): 952–8. Дои:10.1002 / dvg.22840. PMID 25394327. S2CID 32809575.
  27. ^ Джо Дж, О Дж, Ли Х. Г., Хонг Х. Х., Ли С. Г., Чеон С. и др. (Январь 2017 г.). «Проект генома морского огурца Apostichopus japonicus и генетический полиморфизм среди вариантов окраски». GigaScience. 6 (1): 1–6. Дои:10.1093 / gigascience / giw006. ЧВК 5437941. PMID 28369350.
  28. ^ Содергрен Э., Вайншток Г.М., Дэвидсон Э.Х., Камерон Р.А., Гиббс Р.А., Ангерер Р.К. и др. (Ноябрь 2006 г.). «Геном морского ежа Strongylocentrotus purpuratus». Наука. 314 (5801): 941–52. Bibcode:2006Научный ... 314..941С. Дои:10.1126 / science.1133609. ЧВК 3159423. PMID 17095691.
  29. ^ Дехал П., Сато Й., Кэмпбелл Р.К., Чепмен Дж., Дегнан Б., Де Томазо А. и др. (Декабрь 2002 г.). «Проект генома Ciona Кишечник: понимание происхождения хордовых и позвоночных». Наука. 298 (5601): 2157–67. Bibcode:2002Sci ... 298.2157D. Дои:10.1126 / science.1080049. PMID 12481130. S2CID 15987281.
  30. ^ Смолл К.С., Брудно М., Хилл М.М., Сидов А. (2007). «Выравнивание гапломов и эталонная последовательность высокополиморфного генома Ciona savignyi». Геномная биология. 8 (3): R41. Дои:10.1186 / gb-2007-8-3-r41. ЧВК 1868934. PMID 17374142.
  31. ^ Seo HC, Kube M, Edvardsen RB, Jensen MF, Beck A, Spriet E, et al. (Декабрь 2001 г.). «Миниатюрный геном морской хордовой Oikopleura dioica». Наука. 294 (5551): 2506. Дои:10.1126 / science.294.5551.2506. PMID 11752568.
  32. ^ Putnam NH, Butts T, Ferrier DE, Furlong RF, Hellsten U, Kawashima T. и др. (Июнь 2008 г.). «Геном амфиоксуса и эволюция хордового кариотипа». Природа. 453 (7198): 1064–71. Bibcode:2008 Натур.453.1064P. Дои:10.1038 / природа06967. PMID 18563158. S2CID 4418548.
  33. ^ Либантс С., Карр К., Ву Х., Титер Дж. Х., Чунг-Дэвидсон Ю. В., Чжан З., Уилкерсон С., Ли В. (июль 2009 г.). «Геном морской миноги Petromyzon marinus показывает раннее происхождение нескольких семейств хемосенсорных рецепторов в линии позвоночных». BMC Эволюционная биология. 9: 180. Дои:10.1186/1471-2148-9-180. ЧВК 2728731. PMID 19646260.
  34. ^ Смит Дж. Дж., Кураку С., Холт С., Саука-Шпенглер Т., Цзян Н., Кэмпбелл М. С. и др. (Апрель 2013). «Секвенирование генома морской миноги (Petromyzon marinus) дает представление об эволюции позвоночных». Природа Генетика. 45 (4): 415–21, 421e1-2. Дои:10,1038 / нг.2568. ЧВК 3709584. PMID 23435085.
  35. ^ Венкатеш Б., Киркнесс Э. Ф., Ло Ю. Х., Халперн А. Л., Ли А. П., Джонсон Дж. И др. (Апрель 2007 г.). «Обзорное секвенирование и сравнительный анализ генома слоновой акулы (Callorhinchus milii)». PLOS Биология. 5 (4): e101. Дои:10.1371 / journal.pbio.0050101. ЧВК 1845163. PMID 17407382.
  36. ^ Прочтите Т.Д., Пети Р.А., Джозеф С.Дж., Алам М.Т., Вейл М.Р., Ахмад М. и др. (Июль 2017 г.). «Проект секвенирования и сборки генома самой большой рыбы в мире, китовой акулы: Rhincodon typus Smith 1828». BMC Genomics. 18 (1): 532. Дои:10.1186 / s12864-017-3926-9. ЧВК 5513125. PMID 28709399.
  37. ^ Марра Нью-Джерси, Стэнхоуп М.Дж., Джуэ Н.К., Ван М., Сун К., Павински Битар П. и др. (Февраль 2019). «В геноме белой акулы обнаружены древние адаптации эластожаберных, связанные с заживлением ран и поддержанием стабильности генома». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 116 (10): 4446–4455. Дои:10.1073 / pnas.1819778116. ЧВК 6410855. PMID 30782839.
  38. ^ а б Хара Ю., Ямагути К., Онимару К., Кадота М., Коянаги М., Кили С.Д. и др. (Ноябрь 2018 г.). «Геномы акул дают представление об эволюции пластиножаберных и происхождении позвоночных». Природа Экология и эволюция. 2 (11): 1761–1771. Дои:10.1038 / s41559-018-0673-5. PMID 30297745. S2CID 52944566.
  39. ^ Fan G, Chan J, Ma K, Yang B, Zhang H, Yang X и др. (Ноябрь 2018 г.). «Эталонный геном на уровне хромосом сиамской бойцовой рыбы Betta splendens, модельного вида для изучения агрессии». GigaScience. 7 (11). Дои:10.1093 / gigascience / giy087. ЧВК 6251983. PMID 30010754.
  40. ^ а б c d е ж грамм час я j Фань, Гуаньи; Сонг, Юэ; Ян, Лиандун; Хуан, Сяоюнь; Чжан, Сую; Чжан, Мэнци; Ян, Сяньвэй; Чанг, Юэ; Чжан, Хэ; Ли, Юнсинь; Лю, Шаньшань (2020-08-01). «Публикация первых данных и объявление о проекте« 10 000 геномов рыб »(Fish10K)». GigaScience. 9 (8). Дои:10.1093 / gigascience / giaa080. ЧВК 7433795. PMID 32810278.
  41. ^ Гуаньи, Фань; Юэ, Сон; Ляньдун, Ян; Сяоюнь, Хуан; Сую, Чжан; Мэнци, Чжан; Сяньвэй, Ян; Юэ, Чанг; Он, Чжан (2020), Геномные данные целующихся гурами, Helostoma temminkii, База данных GigaScience, Дои:10.5524/102190, получено 2020-08-19
  42. ^ Kasahara M, Naruse K, Sasaki S, Nakatani Y, Qu W., Ahsan B, et al. (Июнь 2007 г.). «Проект генома медаки и понимание эволюции генома позвоночных». Природа. 447 (7145): 714–9. Bibcode:2007Натура.447..714K. Дои:10.1038 / природа05846. PMID 17554307. S2CID 4419559.
  43. ^ Зима, Свен; Прост, Стефан; Раад, Хорди де; Коимбра, Рафаэль Т. Ф .; Волк, Магнус; Небенфюр, Марсель; Хелд, Анника; Курзаве, Мелина; Папапостолоу, Рамона; Тессиен, Джейд; Блудау, Джулиан (2020). "Сборка генома на уровне хромосом бентосных видов Syngnathiformes: обыкновенного дракона Callionymus lyra". Гигабайт. 2020: 1–10. Дои:10.46471 / гигабайт.6.
  44. ^ Сяо Ю., Сяо З., Ма Д., Лю Дж., Ли Дж. (Март 2019 г.). "Последовательность генома ножевой челюсти с перемычкой Oplegnathus fasciatus (Temminck & Schlegel, 1844): первый проект генома на уровне хромосомы в семействе Oplegnathidae". GigaScience. 8 (3). Дои:10.1093 / gigascience / giz013. ЧВК 6423371. PMID 30715332.
  45. ^ Макгоу С.Е., Гросс Дж. Б., Акен Б., Блин М., Боровски Р., Чалопин Д. и др. (Октябрь 2014 г.). «Геном пещерной рыбы раскрывает гены-кандидаты на потерю глаз». Nature Communications. 5 (1): 5307. Bibcode:2014 НатКо ... 5.5307 млн. Дои:10.1038 / ncomms6307. ЧВК 4218959. PMID 25329095.
  46. ^ а б Конте М.А., Джоши Р., Мур Е.К., Нандамури С.П., Гаммердингер В.Дж., Робертс Р.Б. и др. (Апрель 2019 г.). «Хромосомные сборки показывают структурную эволюцию геномов африканских цихлид». GigaScience. 8 (4). Дои:10.1093 / gigascience / giz030. ЧВК 6447674. PMID 30942871.
  47. ^ Í Kongsstovu S, Dahl HA, Gislason H, Í Homrum E, Jacobsen JA, Flicek P, Mikalsen SO (апрель 2020 г.). «Идентификация участков, определяющих гетерогаметный пол самцов в геноме атлантической сельди Clupea harengus». Журнал биологии рыб. 97 (1): 190–201. Дои:10.1111 / jfb.14349. ЧВК 7115899. PMID 32293027. S2CID 215774454.
  48. ^ Сюй Джи, Биан С, Ни З, Ли Дж, Ван И, Сюй Д. и др. (Январь 2020 г.). «Геном и популяционное секвенирование сборки генома на уровне хромосом китайского анчоуса с хвостиком (Coilia nasus) позволяет по-новому взглянуть на миграционную адаптацию». GigaScience. 9 (1). Дои:10.1093 / gigascience / giz157. ЧВК 6939831. PMID 31895412.
  49. ^ Луро Б., Де Моро Дж., Гарсия С., Кокс С.Дж., Вериссимо А., Сабатино С.Дж. и др. (Май 2019). «Проект генома европейской сардины (Sardina pilchardus) с разрешенным гаплотипом». GigaScience. 8 (5). Дои:10.1093 / gigascience / giz059. ЧВК 6528745. PMID 31112613.
  50. ^ Amemiya CT, Alföldi J, Lee AP, Fan S, Philippe H, Maccallum I и др. (Апрель 2013). «Геном африканских латимерии дает представление об эволюции четвероногих». Природа. 496 (7445): 311–6. Bibcode:2013Натура.496..311A. Дои:10.1038 / природа12027. ЧВК 3633110. PMID 23598338.
  51. ^ Ensembl entry
  52. ^ Jiang W, Qiu Y, Pan X, Zhang Y, Wang X, Lv Y и др. (2018). "Anabarilius grahami (Реган) и его эволюционное и генетическое применение". Границы генетики. 9: 614. Дои:10.3389 / fgene.2018.00614. ЧВК 6288284. PMID 30564274.
  53. ^ "Браузер ансамбля генома 59: Данио рерио - Описание - Поиск по ансамблю рыбок данио". Ensembl.org. Получено 2010-08-27.
  54. ^ а б ван Круистум Х., ван ден Хеувел Дж., Трэвис Дж., Краайевельд К., Цваан Б.Дж., Гроенен М.А. и др. (Июль 2019). «Геном живородящей рыбы Heterandria formosa предполагает роль консервативных генов позвоночных в эволюции плацентарных рыб». BMC Эволюционная биология. 19 (1): 156. Дои:10.1186 / s12862-019-1484-2. ЧВК 6660938. PMID 31349784.
  55. ^ Лю Х.П., Сяо С.Дж., Ву Н, Ван Д., Лю Ю.С., Чжоу К.В. и др. (Февраль 2019). «Последовательность и сборка de novo генома Oxygymnocypris stewartii». Научные данные. 6: 190009. Bibcode:2019НатСД ... 690009Л. Дои:10.1038 / sdata.2019.9. ЧВК 6362891. PMID 30720802.
  56. ^ Лю Х., Чен Ц., Гао З., Мин Дж., Гу И, Цзян Дж. И др. (Июль 2017 г.). «Проект генома тупорылого леща (Megalobrama amblycephala) показывает развитие межмышечной кости и адаптацию к рациону травоядных». GigaScience. 6 (7): 1–13. Дои:10.1093 / gigascience / gix039. ЧВК 5570040. PMID 28535200.
  57. ^ Гуаньи, Фань; Юэ, Сон; Ляньдун, Ян; Сяоюнь, Хуан; Сую, Чжан; Мэнци, Чжан; Сяньвэй, Ян; Юэ, Чанг; Он, Чжан; Юнсинь, Ли; Шаньшань, Лю; Лили, Ю; Джеффри, Чу; Инге, Сейм; Чэнгуан, Фэн; Thomas, Near J .; Штанга, крыло А .; Вэнь, Ван; Кун, Ван; Цзин, Ван; Сюнь, Сюй; Хуаньминь, Ян; Синь, Лю; Наньшэн, Чен; Шуньпин, Он (2020). «Набор данных GigaDB - DOI 10.5524 / 102192 - Геномные данные розового горчака Rhodeus ocellatus». База данных GigaScience. Дои:10.5524/102192. Цитировать журнал требует | журнал = (помощь)
  58. ^ Гуаньи, Фань; Юэ, Сон; Ляньдун, Ян; Сяоюнь, Хуан; Сую, Чжан; Мэнци, Чжан; Сяньвэй, Ян; Юэ, Чанг; Он, Чжан; Юнсинь, Ли; Шаньшань, Лю; Лили, Ю; Джеффри, Чу; Инге, Сейм; Чэнгуан, Фэн; Thomas, Near J .; Штанга, крыло А .; Вэнь, Ван; Кун, Ван; Цзин, Ван; Сюнь, Сюй; Хуаньминь, Ян; Синь, Лю; Наньшэн, Чен; Шуньпин, Он (2020). «Набор данных GigaDB - DOI 10.5524 / 102191 - Геномные данные Pseudobrama simoni». База данных GigaScience. Дои:10.5524/102191. Цитировать журнал требует | журнал = (помощь)
  59. ^ а б c d Джонсон, Лиза К.; Сахасрабудхе, Рута; Гилл, Джеймс Энтони; Роуч, Дженнифер Л; Froenicke, Lutz; Браун, C Titus; Уайтхед, Эндрю (01.06.2020). «Проект геномных сборок с использованием считывания секвенирования с платформ Oxford Nanopore Technology и Illumina для четырех видов североамериканских киллифов Fundulus». GigaScience. 9 (6). Дои:10.1093 / gigascience / giaa067. ISSN 2047-217X. ЧВК 7301629. PMID 32556169.
  60. ^ Шао, Фэн; Людвиг, Арне; Мао, Ян; Лю, Ни; Пэн, Цзоган (01.08.2020). «Сборка генома на уровне хромосом самки западного москита (Gambusia affinis)». GigaScience. 9 (8). Дои:10.1093 / gigascience / giaa092. ISSN 2047-217X. ЧВК 7450667. PMID 32852039.
  61. ^ Schartl M, Walter RB, Shen Y, Garcia T, Catchen J, Amores A, et al. (Май 2013). «Геном плоской рыбы Xiphophorus maculatus дает представление об эволюционной адаптации и некоторых сложных чертах». Природа Генетика. 45 (5): 567–72. Дои:10,1038 / нг.2604. ЧВК 3677569. PMID 23542700.
  62. ^ Харел И., Бенаюн Б.А., Мачадо Б., Сингх П.П., Ху С.К., Печ М.Ф., Валензано Д.Р., Чжан Э., Шарп С.К., Артанди С.Е., Брюнет А. (февраль 2015 г.). «Платформа для быстрого изучения процессов старения и болезней у короткоживущих позвоночных». Клетка. 160 (5): 1013–1026. Дои:10.1016 / j.cell.2015.01.038. ЧВК 4344913. PMID 25684364.
  63. ^ Райхвальд К., Петцольд А., Кох П., Дауни Б.Р., Хартманн Н., Питч С. и др. (Декабрь 2015 г.). "Понимание эволюции половых хромосом и старения из генома короткоживущих рыб". Клетка. 163 (6): 1527–38. Дои:10.1016 / j.cell.2015.10.071. PMID 26638077. S2CID 16423362.
  64. ^ Валенсано Д.Р., Бенаюн Б.А., Сингх П.П., Чжан Э., Эттер П.Д., Ху СК, Клемент-Зиза М., Виллемсен Д., Цуй Р., Харел И., Мачадо Б.Э., Йи М.С., Шарп С.К., Бустаманте С.Д., Бейер А., Джонсон Е.А., Брюне А (декабрь 2015 г.). «Геном киллифа африканской бирюзы дает представление об эволюции и генетической архитектуре продолжительности жизни». Клетка. 163 (6): 1539–54. Дои:10.1016 / j.cell.2015.11.008. ЧВК 4684691. PMID 26638078.
  65. ^ Рондо Э. Б., Минкли Д. Р., Леонг Дж. С., Мессмер А. М., Янцен Дж. Р., фон Шальбург К. Р. и др. (2014). «Геном и карта сцепления северной щуки (Esox lucius): выявлена ​​консервативная синтения между сестринской группой лососевых и Neoteleostei». PLOS ONE. 9 (7): e102089. Bibcode:2014PLoSO ... 9j2089R. Дои:10.1371 / journal.pone.0102089. ЧВК 4113312. PMID 25069045.
  66. ^ Ensembl Pre entry[постоянная мертвая ссылка]
  67. ^ Джонс Ф.К., Грабхерр М.Г., Чан Ю.Ф., Рассел П., Масели Э., Джонсон Дж. И др. (Апрель 2012 г.). «Геномная основа адаптивной эволюции трехиглой колюшки». Природа. 484 (7392): 55–61. Bibcode:2012Натура 484 ... 55.. Дои:10.1038 / природа10944. ЧВК 3322419. PMID 22481358.
  68. ^ Гуаньи, Фань; Юэ, Сон; Ляньдун, Ян; Сяоюнь, Хуан; Сую, Чжан; Мэнци, Чжан; Сяньвэй, Ян; Юэ, Чанг; Он, Чжан (2020), Геномные данные мраморного бычка Oxyeleotris marmorata, База данных GigaScience, Дои:10.5524/102185, получено 2020-08-19
  69. ^ Галлант Дж. Р., Трэгер Л. Л., Фолькенинг Дж. Д., Моффет Х., Чен П. Х., Новина С. Д. и др. (Июнь 2014 г.). «Нечеловеческая генетика. Геномная основа конвергентной эволюции электрических органов». Наука. 344 (6191): 1522–5. Дои:10.1126 / science.1254432. ЧВК 5541775. PMID 24970089.
  70. ^ «Пятнистый гар». Ансамбль. Получено 11 сентября 2014.
  71. ^ Лю К., Сюй Д., Ли Дж., Бянь К., Дуань Дж., Чжоу Й и др. (Апрель 2017 г.). «Секвенирование полного генома китайской ледяной рыбы-ясновидца, Protosalanx hyalocranius». GigaScience. 6 (4): 1–6. Дои:10.1093 / gigascience / giw012. ЧВК 5530312. PMID 28327943.
  72. ^ Гуаньи, Фань; Юэ, Сон; Ляньдун, Ян; Сяоюнь, Хуан; Сую, Чжан; Мэнци, Чжан; Сяньвэй, Ян; Юэ, Чанг; Он, Чжан (2020), Данные генома африканского костистого языка Heterotis niloticus, База данных GigaScience, Дои:10.5524/102184, получено 2020-08-19
  73. ^ Биан, Чао; Ху Иньчан; Рави, Видианатан; Кузнецова, Инна С .; Шэнь, Сюэянь; Му, Сидун; Солнце, Инь; Ты, Синьсинь; Ли, Цзя; Ли, Сяофэн; Цю, Ин (2016-04-19). «Геном азиатской арованы (Scleropages formosus) позволяет по-новому взглянуть на эволюцию ранней линии костистых».. Научные отчеты. 6 (1): 24501. Bibcode:2016НатСР ... 624501Б. Дои:10.1038 / srep24501. ISSN 2045-2322. ЧВК 4835728. PMID 27089831.
  74. ^ Гуаньи, Фань; Юэ, Сон; Ляньдун, Ян; Сяоюнь, Хуан; Сую, Чжан; Мэнци, Чжан; Сяньвэй, Ян; Юэ, Чанг; Он, Чжан; Юнсинь, Ли; Шаньшань, Лю; Лили, Ю; Джеффри, Чу; Инге, Сейм; Чэнгуан, Фэн; Thomas, Near J .; Штанга, крыло А .; Вэнь, Ван; Кун, Ван; Цзин, Ван; Сюнь, Сюй; Хуаньминь, Ян; Синь, Лю; Наньшэн, Чен; Шуньпин, Он (2020). «Набор данных GigaDB - DOI 10.5524 / 102187 - Геномные данные дынной рыбы-бабочки, Chaetodon trifasciatus». База данных GigaScience. Дои:10.5524/102187. Цитировать журнал требует | журнал = (помощь)
  75. ^ Xu J, Bian C, Chen K, Liu G, Jiang Y, Luo Q и др. (Апрель 2017 г.). «Проект генома змееголова, Channa argus». GigaScience. 6 (4): 1–5. Дои:10.1093 / gigascience / gix011. ЧВК 5530311. PMID 28327946.
  76. ^ Гуаньи, Фань; Юэ, Сон; Ляньдун, Ян; Сяоюнь, Хуан; Сую, Чжан; Мэнци, Чжан; Сяньвэй, Ян; Юэ, Чанг; Он, Чжан (2020), Геномные данные медной рыбы-бабочки Chelmon rostratus, База данных GigaScience, Дои:10.5524/102189, получено 2020-08-19
  77. ^ а б Чен Л., Лу И, Ли В., Рен И, Ю М., Цзян С. и др. (Апрель 2019 г.). «Геномная основа для колонизации замерзающего Южного океана, выявленная геномами антарктического клыкача и патагонского робало». GigaScience. 8 (4). Дои:10.1093 / gigascience / giz016. ЧВК 6457430. PMID 30715292.
  78. ^ Wu C, Zhang D, Kan M, Lv Z, Zhu A, Su Y и др. (Ноябрь 2014 г.). «Черновой геном большого желтого горбыля свидетельствует о хорошо развитом врожденном иммунитете». Nature Communications. 5: 5227. Bibcode:2014 НатКо ... 5.5227 Вт. Дои:10.1038 / ncomms6227. ЧВК 4263168. PMID 25407894.
  79. ^ Норрелл А.Е., Джонс К.Л., Сайллант Е.А. (29.04.2020). «Разработка и характеристика геномных ресурсов немодельной морской костистости, красного луциана (Lutjanus campechanus, Lutjanidae): построение карты сцепления высокой плотности, закрепление контигов генома и сравнительный геномный анализ». PLOS ONE. 15 (4): e0232402. Bibcode:2020PLoSO..1532402N. Дои:10.1371 / journal.pone.0232402. ЧВК 7190162. PMID 32348345.
  80. ^ Гуаньи, Фань; Юэ, Сон; Ляньдун, Ян; Сяоюнь, Хуан; Сую, Чжан; Мэнци, Чжан; Сяньвэй, Ян; Юэ, Чанг; Он, Чжан; Юнсинь, Ли; Шаньшань, Лю; Лили, Ю; Джеффри, Чу; Инге, Сейм; Чэнгуан, Фэн; Thomas, Near J .; Штанга, крыло А .; Вэнь, Ван; Кун, Ван; Цзин, Ван; Сюнь, Сюй; Хуаньминь, Ян; Синь, Лю; Наньшэн, Чен; Шуньпин, Он (2020). "GigaDB Dataset - DOI 10.5524 / 102188 - Геномные данные большой рыбы-единорога, Naso vlamingii". База данных GigaScience. Дои:10.5524/102188. Цитировать журнал требует | журнал = (помощь)
  81. ^ Ан Д.Х., Шин С.К., Ким Б.М., Кан С., Ким Дж. Х., Ан И., Пак Дж., Пак Х (август 2017 г.). «Проект генома антарктической рыбы-дракона, Parachaenichthys charcoti». GigaScience. 6 (8): 1–6. Дои:10.1093 / gigascience / gix060. ЧВК 5597851. PMID 28873966.
  82. ^ Сарропулу Э., Сундарам А.Ю., Кайтциду Э., Котулас Г., Гилфиллан Г.Д., Папандроулакис Н. и др. (Декабрь 2017 г.). «Полное геномное исследование и динамика экспрессии генов амберджека Seriola dumerili». GigaScience. 6 (12): 1–13. Дои:10.1093 / gigascience / gix108. ЧВК 5751066. PMID 29126158.
  83. ^ Сюй С, Сяо С, Чжу С, Цзэн Х, Ло Дж, Лю Дж и др. (Сентябрь 2018 г.). «Проект сборки генома китайского силлаго (Sillago sinica), первый эталонный геном рыб Sillaginidae». GigaScience. 7 (9). Дои:10.1093 / gigascience / giy108. ЧВК 6143730. PMID 30202912.
  84. ^ Лу, Лян; Чжао, Цзиньлян; Ли, Ченхун (2020-03-01). «Высококачественная сборка генома и аннотация большеглазой мандариновой рыбы (Siniperca knerii)». G3: гены, геномы, генетика. 10 (3): 877–880. Дои:10.1534 / g3.119.400930. ISSN 2160-1836. ЧВК 7056987. PMID 31953307.
  85. ^ Паулетто М., Манусаки Т., Феррарессо С., Баббуччи М., Цакогианнис А., Луро Б. и др. (2018-08-17). «Sparus aurata раскрывает эволюционную динамику генов, зависимых от пола, у последовательных рыб-гермафродитов». Биология коммуникации. 1 (1): 119. Дои:10.1038 / с42003-018-0122-7. ЧВК 6123679. PMID 30271999.
  86. ^ Лиен С., Куп Б.Ф., Сандве С.Р., Миллер Дж.Р., Кент М.П., ​​Ном Т. и др. (Май 2016). «Геном атлантического лосося дает представление о редиплоидизации». Природа. 533 (7602): 200–5. Bibcode:2016 Натур.533..200л. Дои:10.1038 / природа17164. PMID 27088604. S2CID 4398298.
  87. ^ Бертло С., Брюне Ф., Чалопин Д., Хуанчич А., Бернар М., Ноэль Б. и др. (Апрель 2014 г.). «Геном радужной форели позволяет по-новому взглянуть на эволюцию после дупликации всего генома у позвоночных». Nature Communications. 5: 3657. Bibcode:2014 НатКо ... 5,3657B. Дои:10.1038 / ncomms4657. ЧВК 4071752. PMID 24755649.
  88. ^ Кристенсен К.А., Леонг Дж.С., Сахрани Д., Биаджи К.А., Минкли Д.Р., Витлер Р.Э. и др. (2018-04-05). «Геном и транскриптом чавычи (Oncorhynchus tshawytscha)». PLOS ONE. 13 (4): e0195461. Bibcode:2018PLoSO..1395461C. Дои:10.1371 / journal.pone.0195461. ЧВК 5886536. PMID 29621340.
  89. ^ Нарум С.Р., Ди Генова А., Мичелетти С.Дж., Маасс А. (июль 2018 г.). «Геномные вариации, лежащие в основе сложных жизненных характеристик, выявленные секвенированием генома у чавычи». Ход работы. Биологические науки. 285 (1883): 20180935. Дои:10.1098 / rspb.2018.0935. ЧВК 6083255. PMID 30051839.
  90. ^ Хе Й, Чанг Й, Бао Л, Ю М, Ли Р, Ниу Дж и др. (Май 2019). «Геном черного морского окуня Sebastes schlegelii на уровне хромосом дает представление об эволюции живорождения» (PDF). Ресурсы по молекулярной экологии. 0 (5): 1309–1321. Дои:10.1111/1755-0998.13034. PMID 31077549. S2CID 149454779.
  91. ^ Лю З., Лю С., Яо Дж., Бао Л., Чжан Дж., Ли Й и др. (Июнь 2016). «Последовательность генома канального сома дает представление об эволюции образования чешуек у костистых насекомых». Nature Communications. 7: 11757. Bibcode:2016НатКо ... 711757L. Дои:10.1038 / ncomms11757. ЧВК 4895719. PMID 27249958.
  92. ^ Озеров Михаил Юрьевич; Флайшанс, Мартин; Норейкиене, Кристина; Васемяги, Анти; Гросс, Рихо (01.11.2020). «Проект сборки генома пресноводного сома Apex Predator Wels (Silurus glanis) с использованием секвенирования с последовательным считыванием». G3: гены, геномы, генетика. 10 (11): 3897–3906. Дои:10.1534 / g3.120.401711. ISSN 2160-1836. PMID 32917720. S2CID 221636677.
  93. ^ Гуаньи, Фань; Юэ, Сон; Ляньдун, Ян; Сяоюнь, Хуан; Сую, Чжан; Мэнци, Чжан; Сяньвэй, Ян; Юэ, Чанг; Он, Чжан; Юнсинь, Ли; Шаньшань, Лю; Лили, Ю; Джеффри, Чу; Инге, Сейм; Чэнгуан, Фэн; Thomas, Near J .; Штанга, крыло А .; Вэнь, Ван; Кун, Ван; Цзин, Ван; Сюнь, Сюй; Хуаньминь, Ян; Синь, Лю; Наньшэн, Чен; Шуньпин, Он (2020). «Набор данных GigaDB - DOI 10.5524 / 102186 - Геномные данные сиамской тигровой рыбы, Datnioides pulcher». База данных GigaScience. Дои:10.5524/102186. Цитировать журнал требует | журнал = (помощь)
  94. ^ Сунь, Шуай; Ван, Юэ; Цзэн, Вэньхун; Ду, Сяо; Ли, Лей; Хун, Сяонин; Хуан, Сяоюнь; Чжан, Хэ; Чжан, Мэнци; Фань, Гуаньи; Лю, Синь (18.05.2020). «Геном меконгского тигрового окуня (Datnioides undecimradiatus) дает представление о филогенетическом положении Lobotiformes и биологической сохранности». Научные отчеты. 10 (1): 8164. Bibcode:2020НатСР..10.8164С. Дои:10.1038 / s41598-020-64398-2. ISSN 2045-2322. ЧВК 7235238. PMID 32424221. S2CID 218670972.
  95. ^ Гуаньи, Фань; Юэ, Сон; Ляньдун, Ян; Сяоюнь, Хуан; Сую, Чжан; Мэнци, Чжан; Сяньвэй, Ян; Юэ, Чанг; Он, Чжан; Юнсинь, Ли; Шаньшань, Лю; Лили, Ю; Джеффри, Чу; Инге, Сейм; Чэнгуан, Фэн; Thomas, Near J .; Штанга, крыло А .; Вэнь, Ван; Кун, Ван; Цзин, Ван; Сюнь, Сюй; Хуаньминь, Ян; Синь, Лю; Наньшэн, Чен; Шуньпин, Он (2020). «Набор данных GigaDB - DOI 10.5524 / 102183 - данные генома длиннохвостого дикобраза, Diodon holocanthus». База данных GigaScience. Дои:10.5524/102183. Цитировать журнал требует | журнал = (помощь)
  96. ^ Пан Х., Ю Х., Рави В., Ли К., Ли А. П., Лиан М. М. и др. (Сентябрь 2016 г.). «Геном самой большой костистой рыбы, морской солнечной рыбы (Mola mola), дает представление о быстрых темпах ее роста». GigaScience. 5 (1): 36. Дои:10.1186 / s13742-016-0144-3. ЧВК 5016917. PMID 27609345.
  97. ^ «Четвертая сборка генома». Проект генома фугу. Международный консорциум генома фугу. Архивировано из оригинал 31 января 2010 г.
  98. ^ Aparicio S, Chapman J, Stupka E, Putnam N, Chia JM, Dehal P и др. (Август 2002 г.). «Сборка полногеномного ружья и анализ генома Fugu rubripes». Наука. 297 (5585): 1301–10. Bibcode:2002Научный ... 297.1301A. Дои:10.1126 / science.1072104. PMID 12142439. S2CID 10310355.
  99. ^ Jaillon O, Aury JM, Brunet F, Petit JL, Stange-Thomann N, Mauceli E, et al. (Октябрь 2004 г.). «Дупликация генома костистых рыб Tetraodon nigroviridis выявляет ранний протокариотип позвоночных». Природа. 431 (7011): 946–57. Bibcode:2004 Натур.431..946J. Дои:10.1038 / природа03025. PMID 15496914. S2CID 4414316.
  100. ^ Nowoshilow S, Schloissnig S, Fei JF, Dahl A, Pang AW, Pippel M и др. (Февраль 2018). «Геном аксолотля и эволюция ключевых регуляторов тканевого образования». Природа. 554 (7690): 50–55. Bibcode:2018Натура.554 ... 50N. Дои:10.1038 / природа25458. PMID 29364872.
  101. ^ Ли Дж, Ю Х, Ван В, Фу Ц, Чжан В, Хань Ф, Ву Х (декабрь 2019 г.). "Геномное и транскриптомное понимание молекулярных основ сексуально диморфных брачных шипов в Leptobrachium leishanense". Nature Communications. 10 (1): 5551. Bibcode:2019НатКо..10.5551L. Дои:10.1038 / s41467-019-13531-5. ЧВК 6895153. PMID 31804492.
  102. ^ Ли, Ци Ё; Го, Цюньфэй; Чжоу, Ян; Тан, Хуйшуан; Бертоцци, Терри; Чжу, Юаньчжэнь; Ли, Цзи; Доннеллан, Стивен; Чжан, Гоцзе. «Проект сборки генома восточной лягушки-банджо Limnodynastes dumerilii dumerilii (Anura: Limnodynastidae)». gigabytejournal.com. Получено 2020-11-17.
  103. ^ Сунь YB, Xiong ZJ, Xiang XY, Liu SP, Zhou WW, Tu XL и др. (Март 2015 г.). «Полногеномная последовательность тибетской лягушки Nanorana parkeri и сравнительная эволюция геномов тетрапод». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 112 (11): E1257-62. Bibcode:2015PNAS..112E1257S. Дои:10.1073 / pnas.1501764112. ЧВК 4371989. PMID 25733869.
  104. ^ Роджерс Р.Л., Чжоу Л., Чу С., Маркес Р., Корл А., Линдерот Т. и др. (Декабрь 2018 г.). «Геномный захват транспонированных элементов в клубничной ядовитой лягушке». Молекулярная биология и эволюция. 35 (12): 2913–2927. Дои:10.1093 / molbev / msy185. ЧВК 6278860. PMID 30517748.
  105. ^ Дентон, Роберт Д .; Кудра, Рэндал С .; Малком, Джейкоб У .; Приз, Луи Дю; Мэлоун, Джон Х. (20 ноября 2018 г.). «Геном африканской лягушки-быка (Pyxicephalus adspersus) объединяет два наследственных ингредиента для создания половых хромосом позвоночных». bioRxiv: 329847. Дои:10.1101/329847. S2CID 90800869.
  106. ^ Хаммонд С.А., Уоррен Р.Л., Вандервальк Б.П., Кучук Е., Хан Х., Гибб Э.А., Пандох П., Кирк Х., Чжао Й., Джонс М., Мунгалл А.Дж., Купе Р., Плезанс С., Мур Р.А., Холт Р.А., Раунд Дж.М., Охора С. , Walle BV, Veldhoen N, Helbing CC, Birol I (ноябрь 2017 г.). «Геном проекта североамериканской лягушки-быка дает представление о гормональной регуляции длинной некодирующей РНК». Nature Communications. 8 (1): 1433. Bibcode:2017 НатКо ... 8.1433H. Дои:10.1038 / s41467-017-01316-7. ЧВК 5681567. PMID 29127278.
  107. ^ Эдвардс Р.Дж., Туипулоту Д.Е., Амос Т.Г., О'Милли Д., Ричардсон М.Ф., Рассел Т.Л. и др. (Август 2018 г.). «Проект сборки генома инвазивной тростниковой жабы, Rhinella marina». GigaScience. 7 (9). Дои:10.1093 / gigascience / giy095. ЧВК 6145236. PMID 30101298.
  108. ^ Ли И, Рен И, Чжан Д., Цзян Х, Ван З, Ли Х, Рао Д. (сентябрь 2019 г.). «Сборка на уровне хромосом генома усатой жабы с использованием секвенирования ДНК третьего поколения и анализа Hi-C». GigaScience. 8 (9). Дои:10.1093 / gigascience / giz114. ЧВК 6755253. PMID 31544214.
  109. ^ Hellsten U, Harland RM, Gilchrist MJ, Hendrix D, Jurka J, Kapitonov V, et al. (Апрель 2010 г.). «Геном западной когтистой лягушки Xenopus tropicalis». Наука. 328 (5978): 633–6. Bibcode:2010Sci ... 328..633H. Дои:10.1126 / science.1183670. ЧВК 2994648. PMID 20431018.
  110. ^ а б c Сент-Джон Дж. А., Браун Э. Л., Исберг С. Р., Майлз Л. Г., Чонг А. Ю., Гонгора Дж. И др. (Январь 2012 г.). «Секвенирование трех геномов крокодилов для освещения эволюции архозавров и амниот». Геномная биология. 13 (1): 415. Дои:10.1186 / gb-2012-13-1-415. ЧВК 3334581. PMID 22293439.
  111. ^ Ван К.Х., Пан С.К., Ху Л., Чжу Й., Сюй П.В., Ся Дж.К. и др. (Сентябрь 2013). «Анализ генома и открытие сигнатур ныряющих и сенсорных свойств исчезающего китайского аллигатора». Клеточные исследования. 23 (9): 1091–105. Дои:10.1038 / cr.2013.104. ЧВК 3760627. PMID 23917531.
  112. ^ Ван К.Х., Пан С.К., Ху Л., Чжу Й., Сюй П.В., Ся Дж.К. и др. (28 марта 2014 г.). «Геномные данные китайского аллигатора (Аллигатор китайский)". База данных GigaScience. Дои:10.5524/100077. | chapter = игнорируется (помощь)
  113. ^ Gemmell, Neil J .; Резерфорд, Ким; Прост, Стефан; Толлис, Марк; Винтер, Дэвид; Мейси, Дж. Роберт; Адельсон, Дэвид Л .; Су, Александр; Бертоцци, Терри; Грау, Хосе Х .; Орган, Крис (2020-08-20). «Геном туатары раскрывает древние особенности эволюции амниот». Природа. 584 (7821): 403–409. Дои:10.1038 / s41586-020-2561-9. ISSN 1476-4687. ЧВК 7116210. PMID 32760000.
  114. ^ Альфельди Дж., Ди Пальма Ф., Грабхер М., Уильямс С., Конг Л., Мусели Е. и др. (Август 2011 г.). «Геном зеленой ящерицы анола и сравнительный анализ с птицами и млекопитающими». Природа. 477 (7366): 587–91. Bibcode:2011Натура.477..587A. Дои:10.1038 / природа10390. ЧВК 3184186. PMID 21881562.
  115. ^ Сон Би, Ченг С, Сунь И, Чжун Х, Цзинь Дж, Гуань Р, Мерфи РВ, Че Дж, Чжан И, Лю Х (2015). "Черновик генома безногой ящерицы ангид, Ophisaurus gracilis". GigaScience. 4: 17. Дои:10.1186 / s13742-015-0056-7. ЧВК 4391233. PMID 25859342.
  116. ^ а б c d Кишида Т., Гоу Й, Тацумото С., Тацуми К., Кураку С., Тода М. (2019). «Потеря обоняния у морских змей открывает новые перспективы для адаптации амниот к водной среде». Труды Королевского общества B: биологические науки. 286 (1910): 20191828. Дои:10.1098 / rspb.2019.1828. ЧВК 6742997. PMID 31506057.
  117. ^ Xiong Z, Li F, Li Q, Zhou L, Gamble T, Zheng J и др. (Октябрь 2016 г.). «Проект генома леопардового геккона, Эублефарис макулярный". GigaScience. 5 (1): 47. Дои:10.1186 / s13742-016-0151-4. ЧВК 5080775. PMID 27784328.
  118. ^ Vonk FJ, Casewell NR, Henkel CV, Heimberg AM, Jansen HJ, McCleary RJ и др. (Декабрь 2013). «Геном королевской кобры показывает динамическую эволюцию генов и адаптацию системы змеиного яда». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 110 (51): 20651–6. Bibcode:2013ПНАС..11020651В. Дои:10.1073 / pnas.1314702110. ЧВК 3870661. PMID 24297900.
  119. ^ Уллате-Аготе А, Милинкович М.К., Цика А.С. (02.07.2015). «Последовательность генома кукурузной змеи (Pantherophis guttatus), ценный ресурс для исследований EvoDevo на чешуях». Международный журнал биологии развития. 58 (10–12): 881–8. Дои:10.1387 / ijdb.150060at. PMID 26154328.
  120. ^ Жорж А., Ли Кью, Лиан Дж., О'Мелли Д., Дикин Дж., Ван З. и др. (2015-12-01). «Секвенирование с высоким охватом и аннотированная сборка генома австралийской драконьей ящерицы Pogona vitticeps». GigaScience. 4 (1): 45. Дои:10.1186 / s13742-015-0085-2. ЧВК 4585809. PMID 26421146.
  121. ^ Castoe TA, de Koning AP, Hall KT, Card DC, Schield DR, Fujita MK и др. (Декабрь 2013). «Геном бирманского питона раскрывает молекулярную основу экстремальной адаптации змей». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 110 (51): 20645–50. Bibcode:2013PNAS..11020645C. Дои:10.1073 / pnas.1314475110. ЧВК 3870669. PMID 24297902.
  122. ^ Roscito JG, Sameith K, Pippel M, Francoijs KJ, Winkler S, Dahl A, et al. (Декабрь 2018 г.). «Геном ящерицы тегу Salvator merianae: объединение данных Illumina, PacBio и данных оптического картирования для создания очень непрерывной сборки». GigaScience. 7 (12). Дои:10.1093 / gigascience / giy141. ЧВК 6304105. PMID 30481296.
  123. ^ Гао Дж, Ли Кью, Ван Зи, Чжоу Й, Мартелли П., Ли Ф и др. (Июль 2017 г.). «Секвенирование, сборка de novo и аннотирование генома вымирающей китайской крокодиловой ящерицы Shinisaurus crocodilurus». GigaScience. 6 (7): 1–6. Дои:10.1093 / gigascience / gix041. ЧВК 5569961. PMID 28595343.
  124. ^ а б Ван З., Паскуаль-Анайя Дж., Задисса А., Ли В., Ниимура Ю., Хуанг З. и др. (Июнь 2013). «Проект геномов мягкой черепахи и зеленой морской черепахи дает представление о развитии и эволюции специфичного для черепах строения тела». Природа Генетика. 45 (6): 701–706. Дои:10,1038 / нг.2615. ЧВК 4000948. PMID 23624526.
  125. ^ Shaffer HB, Минкс П., Уоррен Д.Е., Шедлок А.М., Томсон Р.С., Валенсуэла Н. и др. (Март 2013 г.). «Геном западной нарисованной черепахи, модель эволюции экстремальных физиологических адаптаций в медленно развивающейся ветви». Геномная биология. 14 (3): R28. Дои:10.1186 / gb-2013-14-3-r28. ЧВК 4054807. PMID 23537068.
  126. ^ Цао Д., Ван М., Гэ И, Гун С. (май 2019 г.). «Проект генома головастой черепахи Platysternon megacephalum». Научные данные. 6 (1): 60. Bibcode:2019НатСД ... 6 ... 60С. Дои:10.1038 / s41597-019-0067-9. ЧВК 6522511. PMID 31097710.
  127. ^ а б c d е ж грамм час я j k л м п о п q р s т ты v ш Икс у z аа ab ac объявление ае аф аг ах ай эй ак аль являюсь ан ао ap водный Джарвис Э.Д., Мирараб С., Аберер А.Дж., Ли Б., Хоуд П., Ли С. и др. (Декабрь 2014 г.). «Полногеномный анализ позволяет выявить ранние ветви на древе жизни современных птиц». Наука. 346 (6215): 1320–31. Bibcode:2014Научный ... 346.1320J. Дои:10.1126 / science.1253451. ЧВК 4405904. PMID 25504713.
  128. ^ «Секвенирование генома золотого орла».
  129. ^ Хуан И, Ли И, Берт Д. В., Чен Х, Чжан И, Цянь В. и др. (Июль 2013). «Геном и транскриптом утки дают представление о видах, являющихся резервуаром вируса птичьего гриппа». Природа Генетика. 45 (7): 776–783. Дои:10.1038 / ng.2657. ЧВК 4003391. PMID 23749191.
  130. ^ Ле Дюк, Диана; Рено, Габриэль; Кришнан, Арункумар; Альмен, Маркус Селлман; Huynen, Леон; Прохазка, Соня Дж .; Онгерт, Матиас; Bitarello, Bárbara D .; Schiöth, Helgi B .; Хофрайтер, Майкл; Стадлер, Питер Ф. (23.07.2015). «Геном киви дает представление об эволюции ночного образа жизни». Геномная биология. 16 (1): 147. Дои:10.1186 / s13059-015-0711-4. ISSN 1465-6906. ЧВК 4511969. PMID 26201466.
  131. ^ а б c d Галла С.Дж., Форсдик Н.Дж., Браун Л., Хёппнер М.П., ​​Кнапп М., Мэлони Р.Ф. и др. (Декабрь 2018 г.). «Эталонные геномы от отдаленно родственных видов могут быть использованы для обнаружения однонуклеотидных полиморфизмов для информирования управления сохранением». Гены. 10 (1): 9. Дои:10.3390 / genes10010009. ЧВК 6356778. PMID 30583569.
  132. ^ Ли С., Ли Б., Ченг Ц., Сюн З, Лю Ц., Лай Дж и др. (2014-12-11). «Геномные признаки исчезновения и возрождения хохлатого ибиса и других исчезающих видов птиц». Геномная биология. 15 (12): 557. Дои:10.1186 / s13059-014-0557-1. ЧВК 4290368. PMID 25496777.
  133. ^ а б Чжан Х, Пан С., Ван Дж., Диксон А., Хе Дж., Мюллер М.Г. и др. (Май 2013). «Последовательности генома сапсана и балобана дают представление об эволюции хищного образа жизни». Природа Генетика. 45 (5): 563–6. Дои:10.1038 / нг.2588. PMID 23525076. S2CID 10858993.
  134. ^ Чжоу, Чжуан; Ту, Хунмэй; Ю, Хаорань; Чжэн, Шуай; Дай, Бо; Прайс, Меган; Ву, Юнцзе; Ян, Нан; Юэ, Бисон; Мэн, Ян (5 сентября 2019 г.). "Проект генома сычуаньской куропатки, находящейся под угрозой исчезновения (Arborophila rufipectus), с эволюционными последствиями". Гены. 10 (9): 677. Дои:10.3390 / гены10090677. ISSN 2073-4425. ЧВК 6770966. PMID 31491910.
  135. ^ Международный консорциум по секвенированию куриного генома. (Декабрь 2004 г.). «Последовательность и сравнительный анализ генома курицы дают уникальные перспективы эволюции позвоночных». Природа. 432 (7018): 695–716. Bibcode:2004Натура 432..695С. Дои:10.1038 / природа03154. PMID 15592404. S2CID 4405203.
  136. ^ Даллул Р.А., Лонг Дж. А., Зимин А. В., Аслам Л., Бил К., Бломберг Л. и др. (Сентябрь 2010 г.). «Мультиплатформенное секвенирование нового поколения домашней индейки (Meleagris gallopavo): сборка и анализ генома». PLOS Биология. 8 (9): e10000475. Дои:10.1371 / journal.pbio.1000475. ЧВК 2935454. PMID 20838655.
  137. ^ Виньяль, Ален; Бойтар, Саймон; Тебо, Ноэми; Дайо, Гигигбаза-Коссиган; Япи-Гнаоре, Валентин; Юсао Абду Карим, Иссака; Бертули-Салазар, Сесиль; Палинкаш-Бодзар, Нора; Гемене, Даниэль; Тибо-Ниссен, Франсуаза; Уоррен, Уэсли С. (июль 2019 г.). «Сборка генома цесарки дает новые доказательства эволюции после одомашнивания и отбора у галлиформ». Ресурсы по молекулярной экологии. 19 (4): 997–1014. Дои:10.1111/1755-0998.13017. ISSN 1755-0998. ЧВК 6579635. PMID 30945415.
  138. ^ Джайсвал С.К., Гупта А., Саксена Р. (5 мая 2018 г.). «Последовательность генома индийского павлина раскрывает особый случай сверкающей птицы». bioRxiv. Дои:10.1101/315457. S2CID 196632443.
  139. ^ Лю, Ян; Лю, Симин; Чжан, Нан; Чен, Де; Que, Pinjia; Лю, Найцзя; Хёглунд, Якоб; Чжан, Чжэнван; Ван, Бяо (2019-12-01). «Сборка генома общего фазана Phasianus colchicus: модель видообразования и экологической геномики». Геномная биология и эволюция. 11 (12): 3326–3331. Дои:10.1093 / gbe / evz249. ЧВК 7145668. PMID 31713630.
  140. ^ Ли CY, Hsieh PH, Chiang LM, Chattopadhyay A, Li KY, Lee YF и др. (Май 2018). «Секвенирование всего генома de novo выявляет уникальные гены, которые внесли свой вклад в адаптивную эволюцию фазана Микадо». GigaScience. 7 (5). Дои:10.1093 / gigascience / giy044. ЧВК 5941149. PMID 29722814.
  141. ^ Ван Б., Экблом Р., Буникис И., Ситари Х., Хёглунд Дж. (Март 2014 г.). «Секвенирование полного генома тетерева (Tetrao tetrix): сборка под руководством предполагает более быструю эволюцию Z и MHC». BMC Genomics. 15: 180. Дои:10.1186/1471-2164-15-180. ЧВК 4022176. PMID 24602261.
  142. ^ Саттон Дж. Т., Хельмкампф М., Штайнер С. К., Беллинджер М. Р., Корлах Дж., Холл Р. и др. (Август 2018 г.). «Качественная, долго читаемая сборка генома De Novo для содействия сохранению последних оставшихся на Гавайях видов ворон». Гены. 9 (8): 393. Дои:10.3390 / гены9080393. ЧВК 6115840. PMID 30071683.
  143. ^ Gan HM, Falk S, Morales HE, Austin CM, Sunnucks P, Pavlova A (сентябрь 2019 г.). «Геномное свидетельство наличия новых половых хромосом у восточной желтой малиновки». GigaScience. 8 (9). Дои:10.1093 / gigascience / giz111. ЧВК 6736294. PMID 31494668.
  144. ^ а б Эллегрен Х., Смедс Л., Бурри Р., Оласон П.И., Бакстрём Н., Каваками Т. и др. (Ноябрь 2012 г.). «Геномный ландшафт расхождения видов у мухоловок Ficedula». Природа. 491 (7426): 756–60. Bibcode:2012Натура.491..756E. Дои:10.1038 / природа11584. PMID 23103876. S2CID 4414084.
  145. ^ Форменти Дж., Кьяра М., Поведа Л., Франкойс К. Дж., Бонисоли-Алквати А., Канова Л. и др. (Январь 2019). «Длинные считывания SMRT и оптические карты Direct Label и Stain позволяют создать высококачественную сборку генома европейской ласточки (Hirundo rustica rustica)». GigaScience. 8 (1). Дои:10.1093 / gigascience / giy142. ЧВК 6324554. PMID 30496513.
  146. ^ Колкитт Б.М., Метс Д.Г., Брейнард М.С. (март 2018 г.). «Проект сборки генома бенгальского зяблика, Lonchura striata domestica, модель изменчивости двигательных навыков и обучения». GigaScience. 7 (3): 1–6. Дои:10.1093 / gigascience / giy008. ЧВК 5861438. PMID 29618046.
  147. ^ Александр С., Бент П., Бретт Б. В., Элефтерия П., Элли А. Э., Грегг Т. В. и др. (2019). "Геномный". Набор данных GigaDB - данные генома райской птицы Lycocorax pyrrhopterus. gigadb.org. База данных GigaScience. Дои:10.5524/102158. Получено 2019-06-14.
  148. ^ а б c d Prost S, Armstrong EE, Nylander J, Thomas GW, Suh A, Petersen B, et al. (Май 2019). «Сравнительный анализ определяет геномные особенности, потенциально участвующие в эволюции райских птиц». GigaScience. 8 (5). Дои:10.1093 / gigascience / giz003. ЧВК 6497032. PMID 30689847.
  149. ^ де Вильмерёй, Пьер; Ручманн, Алексис; Ли, Кейт Д .; Ewen, John G .; Брекке, Патрисия; Сантуре, Анна В. (04.03.2019). "Небольшой адаптивный потенциал у птиц, находящихся под угрозой исчезновения". Текущая биология. 29 (5): 889–894.e3. Дои:10.1016 / j.cub.2019.01.072. ISSN 0960-9822. PMID 30799244. S2CID 72334429.
  150. ^ Александр С., Бент П., Бретт Б. В., Элефтерия П., Элли А. Е., Грегг Т. В. и др. (2019). «Геномный». Набор данных GigaDB - данные генома райской птицы Paradisaea rubra. База данных GigaScience. Дои:10.5524/102160.
  151. ^ Александр С., Бент П., Бретт Б. В., Элефтерия П., Элли А. Э., Грегг Т. В. и др. (2019). «Геномный». Набор данных GigaDB - данные генома райской птицы Pteridophora alberti. База данных GigaScience. Дои:10.5524/102161.
  152. ^ Александр С., Бент П., Бретт Б. В., Элефтерия П., Элли А. Э., Грегг Т. В. и др. (2019). «Геномный». Данные генома райской птицы Ptiloris paradiseus. База данных GigaScience. Дои:10.5524/102159.
  153. ^ Уоррен В.К., Клейтон Д.Ф., Эллегрен Х., Арнольд А.П., Хиллиер Л.В., Кюнстнер А. и др. (Апрель 2010 г.). «Геном певчей птицы». Природа. 464 (7289): 757–62. Bibcode:2010 Натур.464..757Вт. Дои:10.1038 / природа08819. ЧВК 3187626. PMID 20360741.
  154. ^ а б Колчанова С., Кливер С., Комиссаров А., Добринин П., Тамазян Г., Григорьев К. и др. (Январь 2019). «Геномы трех тесно связанных карибских амазонок дают представление об истории и сохранении видов». Гены. 10 (1): 54. Дои:10.3390 / гены10010054. ЧВК 6356210. PMID 30654561.
  155. ^ Олексик Т.К., Помберт Дж.Ф., Сиу Д., Мазо-Варгас А., Рамос Б., Гуйблет В. и др. (Сентябрь 2012 г.). «Проект по секвенированию генома пуэрториканского попугая (Amazona vittata), финансируемый из местных источников, увеличивает объем данных о птицах и способствует образованию молодых исследователей». GigaScience. 1 (1): 14. Дои:10.1186 / 2047-217X-1-14. ЧВК 3626513. PMID 23587420.
  156. ^ Сибери К.М., Дауд С.Е., Сибери П.М., Раудсепп Т., Брайтсмит Д.Д., Либориуссен П. и др. (2013-05-08). «Мультиплатформенный проект сборки генома de novo и сравнительный анализ алого ара (Ара-Макао)». PLOS ONE. 8 (5): e62415. Bibcode:2013PLoSO ... 862415S. Дои:10.1371 / journal.pone.0062415. ЧВК 3648530. PMID 23667475.
  157. ^ Галла С.Дж., Морага Р., Браун Л., Клеланд С., Хёппнер М.П., ​​Мэлони Р.Ф., Ричардсон А., Слейтер Л., Санюр А.В., Стивс Т.Э. (2020). «Сравнение родословных, генетических и геномных оценок родства для принятия решения о спаривании у двух птиц, находящихся в критическом состоянии: значение для программ природоохранного разведения во всем мире». Эволюционные приложения. 13 (5): 991–1008. Дои:10.1111 / eva.12916. ЧВК 7232769. PMID 32431748.
  158. ^ а б c d е ж грамм час я j k л м п о п q р s Пан Х., Коул Т.Л., Би Х, Фанг М., Чжоу Ц., Ян З. и др. (Сентябрь 2019 г.). «Геномы с большим охватом для выяснения эволюции пингвинов». GigaScience. 8 (9). Дои:10.1093 / gigascience / giz117. ЧВК 6904868. PMID 31531675.
  159. ^ Алан Д.Т., Эндрю Р.Х., Маккинлей Б., Шарль-Андре Б., Ченгран З., Дэниел К.Т. и др. (2019). «Геномный». Набор данных GigaDB - DOI 10.5524 / 102182 - Геномные данные королевского пингвина (Aptenodytes patagonicus). База данных GigaScience. Дои:10.5524/102182.
  160. ^ Алан Д.Т., Эндрю Р.Х., Маккинлей Б., Шарль-Андре Б., Ченгран З., Дэниел К.Т. и др. (2019). «Геномный». Набор данных GigaDB - DOI 10.5524 / 102170 - Геномные данные западного пингвина рокхоппер (Eudyptes chrysocome). База данных GigaScience. Дои:10.5524/102170.
  161. ^ Алан Д.Т., Эндрю Р.Х., Маккинлей Б., Шарль-Андре Б., Ченгран З., Дэниел К.Т. и др. (2019). «Геномный». Набор данных GigaDB - DOI 10.5524 / 102165 - Геномные данные макаронного пингвина (Eudyptes chrysolophus chrysolophus). База данных GigaScience. Дои:10.5524/102165.
  162. ^ Алан Д.Т., Эндрю Р.Х., Маккинлей Б., Шарль-Андре Б., Ченгран З., Дэниел К.Т. и др. (2019). «Геномный». Набор данных GigaDB - DOI 10.5524 / 102164 - Геномные данные королевского пингвина (Eudyptes chrysolophus schlegeli). База данных GigaScience. Дои:10.5524/102164.
  163. ^ Алан Д.Т., Эндрю Р.Х., Маккинлей Б., Шарль-Андре Б., Ченгран З., Дэниел К.Т. и др. (2019). «Геномный». Набор данных GigaDB - DOI 10.5524 / 102169 - Геномные данные восточного пингвина рокхоппер (Eudyptes filholi). База данных GigaScience. Дои:10.5524/102169.
  164. ^ Алан Д.Т., Эндрю Р.Х., Маккинлей Б., Шарль-Андре Б., Ченгран З., Дэниел К.Т. и др. (2019). «Геномный». Набор данных GigaDB - DOI 10.5524 / 102171 - Геномные данные северного пингвина рокхоппер (Eudyptes moseleyi). База данных GigaScience. Дои:10.5524/102171.
  165. ^ Алан Д.Т., Эндрю Р.Х., Маккинлей Б., Шарль-Андре Б., Ченгран З., Дэниел К.Т. и др. (2019). «Геномный». Набор данных GigaDB - DOI 10.5524 / 102166 - Геномные данные фьордландского хохлатого пингвина (Eudyptes pachyrhynchus). База данных GigaScience. Дои:10.5524/102166.
  166. ^ Алан Д.Т., Эндрю Р.Х., Маккинлей Б., Шарль-Андре Б., Ченгран З., Дэниел К.Т. и др. (2019). «Геномный». Набор данных GigaDB - DOI 10.5524 / 102167 - Геномные данные пингвина с ловчей хохлатой (Eudyptes robustus). База данных GigaScience. Дои:10.5524/102167.
  167. ^ Алан Д.Т., Эндрю Р.Х., Маккинлей Б., Шарль-Андре Б., Ченгран З., Дэниел К.Т. и др. (2019). «Геномный». Набор данных GigaDB - DOI 10.5524 / 102168 - Геномные данные прямохохлого пингвина (Eudyptes sclateri). База данных GigaScience. Дои:10.5524/102168.
  168. ^ Алан Д.Т., Эндрю Р.Х., Маккинлей Б., Шарль-Андре Б., Ченгран З., Дэниел К.Т. и др. (2019). «Геномный». Набор данных GigaDB - DOI 10.5524 / 102177 - Геномные данные пингвина с белыми шипами (Eudyptula minor albosignata). База данных GigaScience. Дои:10.5524/102177.
  169. ^ Алан Д.Т., Эндрю Р.Х., Маккинлей Б., Шарль-Андре Б., Ченгран З., Дэниел К.Т. и др. (2019). «Геномный». Набор данных GigaDB - DOI 10.5524 / 102178 - Геномные данные маленького синего пингвина (Eudyptula minor minor). База данных GigaScience. Дои:10.5524/102178.
  170. ^ Алан Д.Т., Эндрю Р.Х., Маккинлей Б., Шарль-Андре Б., Ченгран З., Дэниел К.Т. и др. (2019). «Геномный». Набор данных GigaDB - DOI 10.5524 / 102179 - Геномные данные сказочного пингвина (Eudyptula novaehollandiae). База данных GigaScience. Дои:10.5524/102179.
  171. ^ Алан Д.Т., Эндрю Р.Х., Маккинлей Б., Шарль-Андре Б., Ченгран З., Дэниел К.Т. и др. (2019). «Геномный». Набор данных GigaDB - DOI 10.5524 / 102172 - Геномные данные желтоглазого пингвина (антиподы Megadyptes). База данных GigaScience. Дои:10.5524/102172.
  172. ^ Алан Д.Т., Эндрю Р.Х., Маккинлей Б., Шарль-Андре Б., Ченгран З., Дэниел К.Т. и др. (2019). «Геномный». Набор данных GigaDB - DOI 10.5524 / 102181 - Геномные данные антарктического пингвина (Pygoscelis antarctica). База данных GigaScience. Дои:10.5524/102181.
  173. ^ Алан Д.Т., Эндрю Р.Х., Маккинлей Б., Шарль-Андре Б., Ченгран З., Дэниел К.Т. и др. (2019). «Геномный». Набор данных GigaDB - DOI 10.5524 / 102180 - Геномные данные пингвина Gentoo (Pygoscelis papua). База данных GigaScience. Дои:10.5524/102180.
  174. ^ Алан Д.Т., Эндрю Р.Х., Маккинлей Б., Шарль-Андре Б., Ченгран З., Дэниел К.Т. и др. (2019). «Геномный». Набор данных GigaDB - DOI 10.5524 / 102176 - Геномные данные пингвина Гумбольдта (Spheniscus humboldti). База данных GigaScience. Дои:10.5524/102176.
  175. ^ Алан Д.Т., Эндрю Р.Х., Маккинлей Б., Шарль-Андре Б., Ченгран З., Дэниел К.Т. и др. (2019). «Геномный». Набор данных GigaDB - DOI 10.5524 / 102173 - Геномные данные магелланова пингвина (Spheniscus magellanicus). База данных GigaScience. Дои:10.5524/102173.
  176. ^ Алан Д.Т., Эндрю Р.Х., Маккинлей Б., Шарль-Андре Б., Ченгран З., Дэниел К.Т. и др. (2019). «Геномный». Набор данных GigaDB - DOI 10.5524 / 102175 - Геномные данные галапагосского пингвина (Spheniscus mendiculus). База данных GigaScience. Дои:10.5524/102175.
  177. ^ а б Hanna ZR, Henderson JB, Wall JD, Emerling CA, Fuchs J, Runckel C и др. (Октябрь 2017 г.). «Геном северной пятнистой совы (Strix occidentalis caurina): расхождение с неясытью (Strix varia) и характеристика генов, связанных со светом». Геномная биология и эволюция. 9 (10): 2522–2545. Дои:10.1093 / gbe / evx158. ЧВК 5629816. PMID 28992302.
  178. ^ а б c d Бурга А., Ван В., Бен-Дэвид Е., Вольф ПК, Рэйми А. М., Вердуго С., Лион К., Паркер П. Г., Кругляк Л. (июнь 2017 г.). «Генетическая подпись эволюции потери полета у галапагосских бакланов». Наука. 356 (6341): eaal3345. Дои:10.1126 / science.aal3345. ЧВК 5567675. PMID 28572335.
  179. ^ Уоррен В. К., Хиллиер Л. В., Маршалл Грейвс Дж. А., Бирни Э., Понтинг С. П., Грюцнер Ф. и др. (Май 2008 г.). «Анализ генома утконоса показывает уникальные признаки эволюции». Природа. 453 (7192): 175–83. Bibcode:2008 Натур.453..175Вт. Дои:10.1038 / природа06936. ЧВК 2803040. PMID 18464734.
  180. ^ Миккельсен Т.С., Уэйкфилд М.Дж., Акен Б., Амемия К.Т., Чанг Дж.Л., Дюк С. и др. (Май 2007 г.). «Геном сумчатого Monodelphis domestica обнаруживает нововведение в некодирующих последовательностях». Природа. 447 (7141): 167–77. Bibcode:2007Натура.447..167М. Дои:10.1038 / природа05805. PMID 17495919. S2CID 4337232.
  181. ^ Бренди, Parice A .; Тан, Саймон; Джонсон, Роберт С. П .; Хогг, Кэролайн Дж .; Белов, Катерина (2020). «Первый эталонный геном Antechinus предоставляет ресурс для исследования генетической основы семелпаритности и возрастных невропатологий». Гигабайт. 2020: 1–22. Дои:10.46471 / гигабайт.7. Получено 2020-11-17.
  182. ^ Ensembl entry
  183. ^ Фейгин С.Ю., Ньютон А.Х., Доронина Л., Шмитц Дж., Хипсли К.А., Митчелл К.Дж. и др. (Январь 2018). «Геном тасманского тигра дает представление об эволюции и демографии вымершего сумчатого плотоядного животного». Природа Экология и эволюция. 2 (1): 182–192. Дои:10.1038 / с41559-017-0417-у. PMID 29230027. S2CID 4630578.
  184. ^ Ренфри М.Б., Папенфус А.Т., Дикин Дж. Э., Линдси Дж., Хайдер Т., Белов К. и др. (Август 2011 г.). «Последовательность генома австралийского кенгуру Macropus eugenii дает представление об эволюции размножения и развития млекопитающих». Геномная биология. 12 (8): R81. Дои:10.1186 / gb-2011-12-8-r81. ЧВК 3277949. PMID 21854559.
  185. ^ Дэйви, М. (10 апреля 2013 г.). «Австралийцы взламывают код генетического кода коалы». Возраст. Получено 25 июн 2013.
  186. ^ а б "Проект генома млекопитающих". Массачусетский технологический институт. Архивировано из оригинал на 2009-01-06. Получено 2012-05-23.
  187. ^ Григорьев К., Кливер С., Добрынин П., Комиссаров А., Вольфсбергер В., Крашенинникова К. и др. (Июнь 2018). «Инновационная стратегия сборки способствует пониманию эволюции и генетики сохранения исчезающего вида Solenodon paradoxus с острова Эспаньола». GigaScience. 7 (6). Дои:10.1093 / gigascience / giy025. ЧВК 6009670. PMID 29718205.
  188. ^ а б c d Паркер Дж., Цагкогеорга Дж., Коттон Дж. А., Лю Й., Проверо П., Ступка Е., Росситер С. Дж. (Октябрь 2013 г.). «Общегеномные признаки конвергентной эволюции эхолокационных млекопитающих». Природа. 502 (7470): 228–31. Bibcode:2013Натура.502..228П. Дои:10.1038 / природа12511. ЧВК 3836225. PMID 24005325.
  189. ^ а б Линдблад-То К., Гарбер М., Зук О, Лин М.Ф., Паркер Б.Дж., Вашитл С. и др. (Октябрь 2011 г.). «Карта с высоким разрешением эволюционных ограничений человека с использованием 29 млекопитающих». Природа. 478 (7370): 476–82. Bibcode:2011Натура 478..476.. Дои:10.1038 / природа10530. ЧВК 3207357. PMID 21993624.
  190. ^ Ensembl entry
  191. ^ а б c d е Gutiérrez-Guerrero, Yocelyn T .; Ибарра-Лаклетт, Энрике; Мартинес дель Рио, Карлос; Баррера-Редондо, Хосуэ; Реболлар, Эрия А .; Ортега, Хорхе; Леон-Паниагуа, Ливия; Уррутия, Аракси; Агирре-Плантер, Эрика; Эгиарте, Луис Э. (01.06.2020). «Геномные последствия диетического разнообразия и параллельной эволюции из-за нектароядности у летучих мышей с носом». GigaScience. 9 (6). Дои:10.1093 / gigascience / giaa059. ЧВК 7276932. PMID 32510151.
  192. ^ Ensembl entry
  193. ^ Гиббс Р.А., Роджерс Дж., Катце М.Г., Бумгарнер Р., Вайншток Г.М., Мардис Е.Р. и др. (Апрель 2007 г.). «Эволюционные и биомедицинские идеи из генома макаки резус». Наука. 316 (5822): 222–34. Bibcode:2007Научный ... 316..222.. Дои:10.1126 / science.1139247. PMID 17431167. S2CID 10535839.
  194. ^ а б Ян Г, Чжан Г, Фанг Х, Чжан И, Ли Ц, Лин Ф и др. (Октябрь 2011 г.). «Секвенирование генома и сравнение двух моделей животных-приматов, кроме яванского макак и китайских макак-резусов». Природа Биотехнологии. 29 (11): 1019–23. Дои:10.1038 / nbt.1992. PMID 22002653. S2CID 9218360.
  195. ^ Ван Л, Ву Дж, Лю Х, Ди Ди, Лян И, Фэн И и др. (Август 2019 г.). «Высококачественная сборка генома находящейся под угрозой исчезновения золотистой курносой обезьяны (Rhinopithecus roxellana)». GigaScience. 8 (8). Дои:10.1093 / gigascience / giz098. ЧВК 6705546. PMID 31437279.
  196. ^ Локк Д.П., Хиллиер Л.В., Уоррен В.К., Уорли К.С., Назарет Л.В., Музны Д.М. и др. (Январь 2011 г.). «Сравнительно-демографический анализ геномов орангутангов». Природа. 469 (7331): 529–33. Bibcode:2011Натура.469..529L. Дои:10.1038 / природа09687. ЧВК 3060778. PMID 21270892.
  197. ^ Scally A, Dutheil JY, Hillier LW, Jordan GE, Goodhead I, Herrero J и др. (Март 2012 г.). «Понимание эволюции гоминидов из последовательности генома гориллы». Природа. 483 (7388): 169–75. Bibcode:2012Натура.483..169С. Дои:10.1038 / природа10842. ЧВК 3303130. PMID 22398555.
  198. ^ Макферсон Дж. Д., Марра М., Хиллиер Л., Уотерстон Р. Х., Чинвалла А., Уоллис Дж. И др. (Февраль 2001 г.). «Физическая карта генома человека». Природа. 409 (6822): 934–41. Bibcode:2001Натура.409..934М. Дои:10.1038/35057157. PMID 11237014. S2CID 186244510.
  199. ^ Вентер Дж. К., Адамс, доктор медицины, Майерс Э. У., Ли П. У., Фреска Р. Дж., Саттон Г. Г. и др. (Февраль 2001 г.). «Последовательность генома человека». Наука. 291 (5507): 1304–51. Bibcode:2001Научный ... 291.1304V. Дои:10.1126 / science.1058040. PMID 11181995. S2CID 85981305.
  200. ^ «Псс, геном человека никогда не был полностью секвенирован». СТАТ. 2017-06-20. Получено 2017-10-23.
  201. ^ Green RE, Krause J, Briggs AW, Maricic T, Stenzel U, Kircher M и др. (Май 2010 г.). «Черновик последовательности генома неандертальца». Наука. 328 (5979): 710–722. Bibcode:2010Sci ... 328..710G. Дои:10.1126 / science.1188021. ЧВК 5100745. PMID 20448178.
  202. ^ Консорциум по секвенированию и анализу шимпанзе. (Сентябрь 2005 г.). «Исходная последовательность генома шимпанзе и сравнение с геномом человека». Природа. 437 (7055): 69–87. Bibcode:2005Натура 437 ... 69.. Дои:10.1038 / природа04072. PMID 16136131. S2CID 2638825.
  203. ^ Прюфер К., Мунк К., Хеллманн И., Акаги К., Миллер Дж. Р., Валенц Б. и др. (Июнь 2012 г.). «Геном бонобо по сравнению с геномами шимпанзе и человека». Природа. 486 (7404): 527–31. Bibcode:2012Натура.486..527П. Дои:10.1038 / природа11128. ЧВК 3498939. PMID 22722832.
  204. ^ Ensembl entry
  205. ^ Worley KC, Warren WC, Rogers J, Locke D, Muzny DM, Mardis ER и др. (Консорциум по секвенированию и анализу генома мартышек) (август 2014 г.). «Геном обыкновенной мартышки дает представление о биологии и эволюции приматов». Природа Генетика. 46 (8): 850–7. Дои:10.1038 / нг.3042. ЧВК 4138798. PMID 25038751.
  206. ^ Добрынин П., Лю С., Тамазян Г., Сюн З., Юрченко А.А., Крашенинникова К. и др. (Декабрь 2015 г.). «Геномное наследие африканского гепарда Acinonyx jubatus». Геномная биология. 16 (1): 277. Дои:10.1186 / s13059-015-0837-4. ЧВК 4676127. PMID 26653294.
  207. ^ Понтиус Дж., Малликин Дж. С., Смит Д. Р., Линдблад-То К., Гнерре С., Зажим М. и др. (Ноябрь 2007 г.). «Исходная последовательность и сравнительный анализ генома кошки». Геномные исследования. 17 (11): 1675–89. Дои:10.1101 / гр.6380007. ЧВК 2045150. PMID 17975172.
  208. ^ а б c d Чо Ю.С., Ху Л., Хоу Х., Ли Х., Сю Дж., Квон С. и др. (2013). «Геном тигра и сравнительный анализ с геномами льва и снежного барса». Nature Communications. 4: 2433. Bibcode:2013 НатКо ... 4.24 33C. Дои:10.1038 / ncomms3433. ЧВК 3778509. PMID 24045858.
  209. ^ а б Ким С., Чо И.С., Ким Х.М., Чунг О, Ким Х., Джо С. и др. (Октябрь 2016 г.). «Сравнение геномов млекопитающих плотоядных, всеядных и травоядных животных с новой сборкой леопарда». Геномная биология. 17 (1): 211. Дои:10.1186 / s13059-016-1071-4. ЧВК 5090899. PMID 27802837.
  210. ^ Линдблад-Тох К., Уэйд С.М., Миккельсен Т.С., Карлссон Е.К., Яффе Д.Б., Камал М. и др. (Декабрь 2005 г.). «Последовательность генома, сравнительный анализ и структура гаплотипов домашней собаки». Природа. 438 (7069): 803–19. Bibcode:2005Натура.438..803л. Дои:10.1038 / природа04338. PMID 16341006. S2CID 4338513.
  211. ^ Гопалакришнан С., Саманьего Каструита Дж. А., Синдинг М. С., Кудерна Л. Ф., Райкконен Дж., Петерсен Б. и др. (Июнь 2017). «Контрольная последовательность генома волка (Canis lupus lupus) и ее значение для популяционной геномики Canis spp.». BMC Genomics. 18 (1): 495. Дои:10.1186 / s12864-017-3883-3. ЧВК 5492679. PMID 28662691.
  212. ^ Армстронг Е.Е., Тейлор Р.В., Прост С., Блинстон П., ван дер Меер Е., Мадзиканда Н. и др. (Февраль 2019). «Экономичная сборка генома африканской дикой собаки (Lycaon pictus) с использованием связанных считываний». GigaScience. 8 (2). Дои:10.1093 / gigascience / giy124. ЧВК 6350039. PMID 30346553.
  213. ^ Ли Р., Фан В., Тиан Дж., Чжу Х., Хе Л., Цай Дж. И др. (Январь 2010 г.). «Последовательность и сборка de novo генома гигантской панды». Природа. 463 (7279): 311–7. Bibcode:2010Натура.463..311L. Дои:10.1038 / природа08696. ЧВК 3951497. PMID 20010809.
  214. ^ Тейлор Г.А., Кирк Х., Кумб Л., Джекман С.Д., Чу Дж., Цзе К. и др. (Ноябрь 2018 г.). «Геном североамериканского бурого медведя или гризли: Ursus arctos ssp. Horribilis». Гены. 9 (12): 598. Дои:10.3390 / гены9120598. ЧВК 6315469. PMID 30513700.
  215. ^ Шривастава А., Кумар Сарсани В., Фиддес И., Шихан С.М., Сегер Р.Л., Бартер М.Э. и др. (Февраль 2019). «Сборка генома и экспрессия генов у американского черного медведя позволяют по-новому взглянуть на реакцию почек на гибернацию». ДНК исследования. 26 (1): 37–44. Дои:10.1093 / dnares / dsy036. ЧВК 6379037. PMID 30395234.
  216. ^ Лю С., Лоренцен Э.Д., Фумагалли М., Ли Б., Харрис К., Сюн З. и др. (Май 2014 г.). «Популяционная геномика выявляет недавнее видообразование и быструю эволюционную адаптацию белых медведей». Клетка. 157 (4): 785–94. Дои:10.1016 / j.cell.2014.03.054. ЧВК 4089990. PMID 24813606.
  217. ^ Ли Б, Чжан Джи, Виллерслев Э, Ван Дж, Ван Дж (2011). «Геномные данные белого медведя (Ursus maritimus)". GigaScience. Дои:10.5524/100008. Получено 2019-06-21. | chapter = игнорируется (помощь)
  218. ^ а б c Foote AD, Liu Y, Thomas GW, Vinař T, Alföldi J, Deng J, et al. (Март 2015 г.). «Конвергентная эволюция геномов морских млекопитающих». Природа Генетика. 47 (3): 272–5. Дои:10,1038 / нг.3198. ЧВК 4644735. PMID 25621460.
  219. ^ Джонс С.Дж., Хаулена М., Тейлор Г.А., Чан С., Билобрам С., Уоррен Р.Л. и др. (Декабрь 2017 г.). «Геном северной каланы (Enhydra lutris kenyoni)». Гены. 8 (12): 379. Дои:10.3390 / гены8120379. ЧВК 5748697. PMID 29232880.
  220. ^ Колелла Дж. П., Лан Т., Шустер С. К., Талбот С. Л., Кук Дж. А., Линдквист С. (31 мая 2018 г.). «Mustela erminea обнаружила, что импульсная гибридизация влияет на эволюцию высокогорных районов». Биология коммуникации. 1 (1): 51. Дои:10.1038 / с42003-018-0058-у. ЧВК 6123727. PMID 30271934.
  221. ^ Пенг X, Альфельди Дж., Гори К., Эйсфельд А.Дж., Тайлер С.Р., Тисончик-Го Дж. И др. (Декабрь 2014 г.). «Проект последовательности генома хорька (Mustela putorius furo) облегчает изучение респираторных заболеваний человека». Природа Биотехнологии. 32 (12): 1250–5. Дои:10.1038 / nbt.3079. ЧВК 4262547. PMID 25402615.
  222. ^ Бейчман А.С., Кёпфли К.П., Ли Дж., Мерфи В., Добрынин П., Килвер С. и др. (Июнь 2019). «Водная адаптация и истощенное разнообразие: глубокое погружение в геномы калана и гигантской выдры». Молекулярная биология и эволюция. 36 (12): 2631–2655. Дои:10.1093 / molbev / msz101. PMID 31212313.
  223. ^ Дастджерди А, Роберт С, Уотсон М (2014). «Секвенирование с низким уровнем покрытия геномов двух азиатских слонов (Elephas maximus)». GigaScience. 3: 12. Дои:10.1186 / 2047-217X-3-12. ЧВК 4106201. PMID 25053995.
  224. ^ Запись в браузере UCSC
  225. ^ Уэйд С.М., Джулотто Э., Сигурдссон С., Золи М., Гнерре С., Имсланд Ф. и др. (Ноябрь 2009 г.). «Последовательность генома, сравнительный анализ и популяционная генетика домашней лошади». Наука. 326 (5954): 865–7. Bibcode:2009Sci ... 326..865W. Дои:10.1126 / science.1178158. ЧВК 3785132. PMID 19892987.
  226. ^ Kalbfleisch TS, Rice ES, DePriest MS, Walenz BP, Hestand MS, Vermeesch JR и др. (2018-11-16). «Улучшенный эталонный геном домашней лошади увеличивает смежность сборки и композицию». Биология коммуникации. 1 (1): 197. Дои:10.1038 / с42003-018-0199-з. ЧВК 6240028. PMID 30456315.
  227. ^ а б c d е ж грамм час я j k л м п о п q р s т ты v ш Икс у z аа ab ac объявление ае аф аг ах ай эй ак аль Чен Л., Цю Кью, Цзян И, Ван К., Лин З, Ли З и др. (Июнь 2019). «Крупномасштабное секвенирование генома жвачных животных дает представление об их эволюции и отличительных чертах». Наука. 364 (6446): eaav6202. Bibcode:2019Научный ... 364.6202C. Дои:10.1126 / science.aav6202. PMID 31221828. S2CID 195191415.
  228. ^ Кин, Майкл; Семейкс, Джереми; Уэбб, Эндрю Э .; Ли, Ян И .; Кесада, Виктор; Крейг, Томас; Мэдсен, Одинокий Брюн; ван Дам, Сипко; Браванд, Дэвид; Marques, Patrícia I .; Михалак, Павел (2015). «Взгляд на эволюцию долголетия на основе генома гренландского кита». Отчеты по ячейкам. 10 (1): 112–122. Дои:10.1016 / j.celrep.2014.12.008. ЧВК 4536333. PMID 25565328.
  229. ^ а б c d е Арнасон, Эльфур; Ламмерс, Фритьоф; Кумар, Викас; Нильссон, Мария А .; Янке, Аксель (2018). «Секвенирование всего генома синего кита и других животных обнаруживает признаки интрогрессивного потока генов». Достижения науки. 4 (4): eaap9873. Bibcode:2018SciA .... 4.9873A. Дои:10.1126 / sciadv.aap9873. ISSN 2375-2548. ЧВК 5884691. PMID 29632892.
  230. ^ а б c Yim HS, Cho YS, Guang X, Kang SG, Jeong JY, Cha SS и др. (Январь 2014). «Геном малых полосатиков и водная адаптация китообразных». Природа Генетика. 46 (1): 88–92. Дои:10,1038 / нг.2835. ЧВК 4079537. PMID 24270359.
  231. ^ Ван К., Ван Л., Ленстра Дж. А., Цзян Дж., Ян И, Ху К. и др. (Апрель 2017 г.). «Последовательность генома зубра (Bison bonasus)». GigaScience. 6 (4): 1–5. Дои:10.1093 / gigascience / gix016. ЧВК 5530314. PMID 28327911.
  232. ^ Dong J, Hu Z, Wu C, Guo H, Zhou B, Lv J и др. (Июль 2012 г.). «Анализ ассоциации выявляет несколько новых локусов восприимчивости к раку легких и их взаимодействие с курением среди населения Китая». Природа Генетика. 44 (8): 895–9. Дои:10.1038 / ng.2351. ЧВК 6628171. PMID 22797725.
  233. ^ Канавез ФК, Луче Д.Д., Стотхард П., Лейте К.Р., Соуза-Канавес Дж. М., Пластов Г. и др. (2012). «Последовательность генома и сборка Bos indicus». Журнал наследственности. 103 (3): 342–8. Дои:10.1093 / jhered / esr153. PMID 22315242.
  234. ^ Элсик К.Г., Теллам Р.Л., Уорли К.С., Гиббс Р.А., Музны Д.М., Вайншток Г.М. и др. (Апрель 2009 г.). «Последовательность генома тауринового крупного рогатого скота: окно в биологию и эволюцию жвачных животных». Наука. 324 (5926): 522–8. Bibcode:2009Sci ... 324..522A. Дои:10.1126 / science.1169588. ЧВК 2943200. PMID 19390049.
  235. ^ Уильямс Дж. Л., Ямартино Д., Прюитт К. Д., Сонстегард Т., Смит Т. П., Лоу Вайоминг и др. (Октябрь 2017 г.). «Ресурс сборки генома и транскриптома речного буйвола, Bubalus bubalis (2n = 50)». GigaScience. 6 (10): 1–6. Дои:10.1093 / gigascience / gix088. ЧВК 5737279. PMID 29048578.
  236. ^ Кепфли К.П., Тамазиан Г., Вильдт Д., Добрынин П., Ким С., Франдсен П.Б. и др. (Июнь 2019). "Популяции in situ". G3. 9 (6): 1785–1793. Дои:10.1534 / g3.119.400084. ЧВК 6553546. PMID 31000506.
  237. ^ Фарре М., Ли Кью, Чжоу Й., Дамас Дж., Хемник Л.Г., Ким Дж. И др. (Февраль 2019). «Сборка генома гемсбока (Oryx gazella) почти на уровне хромосом: культовой антилопы пустыни Калахари». GigaScience. 8 (2). Дои:10.1093 / gigascience / giy162. ЧВК 6351727. PMID 30649288.
  238. ^ Ян И, Ван И, Чжао И, Чжан Х, Ли Р, Чен Л. и др. (Декабрь 2017 г.). «Проект генома барана Марко Поло (Ovis Ammon polii)». GigaScience. 6 (12): 1–7. Дои:10.1093 / gigascience / gix106. ЧВК 5740985. PMID 29112761.
  239. ^ Чжан С., Чен Л., Чжоу Ю., Ван К., Хемник Л.Г., Райдер О.А. и др. (Февраль 2018). «Проект генома милу (Elaphurus davidianus)». GigaScience. 7 (2). Дои:10.1093 / gigascience / gix130. ЧВК 5824821. PMID 29267854.
  240. ^ Ли З, Лин З, Ба Х, Чен Л, Ян Й, Ван К. и др. (Декабрь 2017 г.). «Проект генома северного оленя (Rangifer tarandus)». GigaScience. 6 (12): 1–5. Дои:10.1093 / gigascience / gix102. ЧВК 5726476. PMID 29099922.
  241. ^ Мин Й, Цзянь Дж, Ю Икс, Ван Дж, Лю В. (май 2019 г.). «Ресурсы генома для сохранения индо-тихоокеанского горбатого дельфина Sousa chinensis». Научные данные. 6 (1): 68. Bibcode:2019NatSD ... 6 ... 68M. Дои:10.1038 / s41597-019-0078-6. ЧВК 6531461. PMID 31118413.
  242. ^ Фарре М., Ли К., Даролти И., Чжоу Ю., Дамас Дж., Проскурякова А.А. и др. (Август 2019 г.). «Интегрированная сборка генома в масштабе хромосом жирафа масаи (Giraffa camelopardalis tippelskirchi)». GigaScience. 8 (8). Дои:10.1093 / gigascience / giz090. ЧВК 6669057. PMID 31367745.
  243. ^ Ip S (12 декабря 2017 г.). «Геном белухи впервые секвенирован в Ванкувере». Ванкувер Сан.
  244. ^ Fan Z, Li W, Jin J, Cui K, Yan C, Peng C и др. (Апрель 2018). «Проект последовательности генома лесной кабарги (Moschus berezovskii)». GigaScience. 7 (4). Дои:10.1093 / gigascience / giy038. ЧВК 5906906. PMID 29635287.
  245. ^ Fan G, Zhang Y, Liu X, Wang J, Sun Z, Sun S и др. (Июль 2019). «Первый геном на уровне хромосом для морского млекопитающего как ресурс для изучения экологии и эволюции». Ресурсы по молекулярной экологии. 19 (4): 944–956. Дои:10.1111/1755-0998.13003. PMID 30735609. S2CID 73451140.
  246. ^ Гроенен М.А., Арчибальд А.Л., Уениши Х., Таггл С.К., Такеучи Ю., Ротшильд М.Ф. и др. (Ноябрь 2012 г.). «Анализ генома свиней дает представление о демографии и эволюции свиней». Природа. 491 (7424): 393–8. Bibcode:2012Натура.491..393G. Дои:10.1038 / природа11622. ЧВК 3566564. PMID 23151582.
  247. ^ Эррера-Альварес С., Карлссон Э., Райдер О.А., Линдблад-То К., Кроуфорд А.Дж. (23.09.2018). «Как сделать грызуна-гиганта: геномная основа и компромиссы гигантизма капибары, самого большого грызуна в мире». bioRxiv 10.1101/424606. Дои:10.1101/424606. S2CID 92321538. Цитировать журнал требует | журнал = (помощь)
  248. ^ Long AD, Baldwin-Brown J, Tao Y, Cook VJ, Balderrama-Gutierrez G, Crobett-Detig R, Mortazavi R, Barbour AG (июль 2019 г.). "Геном Peromyscus leucopus, естественный хозяин болезни Лайма и других возникающих инфекций ". Достижения науки. 5 (7): eaaw6441. Bibcode:2019SciA .... 5.6441L. Дои:10.1126 / sciadv.aaw6441. ЧВК 6656541. PMID 31355335.
  249. ^ Хардин А., Невонен К.А., Эккальбар В.Л., Карбон Л., Ахитув Н. (август 2019 г.). «Сравнительная геномная характеристика мультимамматической мыши Mastomys coucha». Молекулярная биология и эволюция. 36 (12): 2805–2812. Дои:10.1093 / molbev / msz188. ЧВК 6878952. PMID 31424545.
  250. ^ Уотерстон Р.Х., Линдблад-То К., Бирни Э., Роджерс Дж., Абрил Дж. Ф., Агарвал П. и др. (Декабрь 2002 г.). «Первоначальное секвенирование и сравнительный анализ генома мыши». Природа. 420 (6915): 520–62. Bibcode:2002 Натур. 420..520Вт. Дои:10.1038 / природа01262. PMID 12466850.
  251. ^ Гиббс Р.А., Вайншток Г.М., Мецкер М.Л., Музны Д.М., Содергрен Э.Дж., Шерер С. и др. (Апрель 2004 г.). «Последовательность генома коричневой норвежской крысы дает представление об эволюции млекопитающих». Природа. 428 (6982): 493–521. Bibcode:2004Натура.428..493G. Дои:10.1038 / природа02426. PMID 15057822. S2CID 4415600.
  252. ^ Ensembl entry
  253. ^ а б Харрисон М.С., Джонгпьер Э., Робертсон Х.М., Арнинг Н., Битард-Фейлдел Т., Чао Х. и др. (Март 2018 г.). «Гемиметаболические геномы раскрывают молекулярные основы эусоциальности термитов». Природа Экология и эволюция. 2 (3): 557–566. Дои:10.1038 / s41559-017-0459-1. ЧВК 6482461. PMID 29403074.
  254. ^ Ли С., Чжу С., Цзя К., Юань Д., Рен С., Ли К. и др. (Март 2018 г.). «Геномные и функциональные пейзажи пластичности развития американского таракана». Nature Communications. 9 (1): 1008. Bibcode:2018НатКо ... 9.1008L. Дои:10.1038 / s41467-018-03281-1. ЧВК 5861062. PMID 29559629.
  255. ^ Террапон Н., Ли К., Робертсон Х. М., Джи Л., Мэн Х, Бут В. и др. (Май 2014 г.). «Молекулярные следы альтернативной социальной организации в геноме термитов». Nature Communications. 5: 3636. Bibcode:2014 НатКо ... 5,3636 т. Дои:10.1038 / ncomms4636. PMID 24845553.
  256. ^ Poulsen M, Hu H, Li C, Chen Z, Xu L, Otani S и др. (Октябрь 2014 г.). «Дополнительный вклад симбионтов в разложение растений у грибных термитов». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 111 (40): 14500–5. Bibcode:2014ПНАС..11114500П. Дои:10.1073 / pnas.1319718111. ЧВК 4209977. PMID 25246537.
  257. ^ Килинг К.И., Юэн М.М., Ляо Нью-Йорк, Докинг Т.Р., Чан С.К., Тейлор Г.А. и др. (Март 2013 г.). «Проект генома жука горной сосны, Dendroctonus ponderosae Hopkins, крупного вредителя леса». Геномная биология. 14 (3): R27. Дои:10.1186 / gb-2013-14-3-r27. ЧВК 4053930. PMID 23537049.
  258. ^ а б Fallon TR, Lower SE, Chang CH, Bessho-Uehara M, Martin GJ, Bewick AJ, et al. (Октябрь 2018 г.). Уотерхаус Р., Таутц Д. (ред.). «Геномы светлячков проливают свет на параллельное происхождение биолюминесценции у жуков». eLife. 7: e36495. Дои:10.7554 / eLife.36495. ЧВК 6191289. PMID 30324905.
  259. ^ Ван К., Ли П, Гао Й, Лю Ц., Ван Ц., Инь Дж и др. (Апрель 2019 г.). «Сборка de novo генома белопятнистого цветочного жука (Protaetia brevitarsis)». GigaScience. 8 (4). Дои:10.1093 / gigascience / giz019. ЧВК 6449472. PMID 30949689.
  260. ^ Ричардс С., Гиббс Р.А., Вайншток Г.М., Браун С.Дж., Денелл Р., Биман Р.В. и др. (Апрель 2008 г.). «Геном модельного жука и вредителя Tribolium castaneum» (PDF). Природа. 452 (7190): 949–55. Bibcode:2008Натура.452..949р. Дои:10.1038 / природа06784. PMID 18362917. S2CID 4402128.
  261. ^ Мэн Ф., Лю З., Хань Х., Финкельбергс Д., Цзян Ю., Чжу М. и др. (Март 2020 г.). «Сборка генома на уровне хромосом у Aldrichina grahami, важной для судебной медицины мясной мухи». GigaScience. 9 (3). Дои:10.1093 / gigascience / giaa020. ЧВК 7081965. PMID 32191812.
  262. ^ Drukewitz SH, Bokelmann L, Undheim EA, von Reumont BM (июль 2019 г.). «Токсины с нуля? Разнообразное мультимодальное происхождение генов у хищной мухи-грабителя Dasypogon diadema указывает на динамическую эволюцию яда у двукрылых насекомых». GigaScience. 8 (7). Дои:10.1093 / gigascience / giz081. ЧВК 6615979. PMID 31289835.
  263. ^ Kim S, Oh M, Jung W, Park J, Choi HG, Shin SC (март 2017). «Секвенирование генома крылатой мошки Parochlus steinenii с Антарктического полуострова». GigaScience. 6 (3): 1–8. Дои:10.1093 / gigascience / giw009. ЧВК 5467013. PMID 28327954.
  264. ^ Диков РБ, Франдсен ПБ, Туркатель М, Диков Т. (31.01.2017). «Proctacanthus coquilletti (Insecta: Diptera: Asilidae) и 16 репрезентативных транскриптомов». PeerJ. 5: e2951. Дои:10.7717 / peerj.2951. ЧВК 5289110. PMID 28168115.
  265. ^ Нене В., Вортман Дж. Р., Лоусон Д., Хаас Б., Кодира С., Ту З. Дж. И др. (Июнь 2007 г.). «Последовательность генома Aedes aegypti, основного вектора арбовируса». Наука. 316 (5832): 1718–23. Bibcode:2007Научный ... 316.1718N. Дои:10.1126 / science.1138878. ЧВК 2868357. PMID 17510324.
  266. ^ Chen XG, Jiang X, Gu J, Xu M, Wu Y, Deng Y и др. (Ноябрь 2015 г.). «Последовательность генома азиатского тигрового комара, Aedes albopictus, раскрывает понимание его биологии, генетики и эволюции». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 112 (44): E5907-15. Bibcode:2015PNAS..112E5907C. Дои:10.1073 / pnas.1516410112. ЧВК 4640774. PMID 26483478.
  267. ^ Холт Р.А., Субраманиан Г.М., Халперн А., Саттон Г.Г., Чарлаб Р., Нусскерн Д.Р. и др. (Октябрь 2002 г.). «Последовательность генома малярийного комара Anopheles gambiae». Наука. 298 (5591): 129–49. Bibcode:2002Наука ... 298..129H. Дои:10.1126 / science.1076181. PMID 12364791. S2CID 4512225.ЧАС
  268. ^ а б Lawniczak MK, Emrich SJ, Holloway AK, Regier AP, Olson M, White B, et al. (Октябрь 2010 г.). «Широко распространенное расхождение между зарождающимися видами Anopheles gambiae, выявленное последовательностями полного генома». Наука. 330 (6003): 512–4. Bibcode:2010Sci ... 330..512L. Дои:10.1126 / science.1195755. ЧВК 3674514. PMID 20966253.
  269. ^ Zhou D, Zhang D, Ding G, Shi L, Hou Q, Ye Y и др. (Январь 2014). «Последовательность генома Anopheles sinensis дает представление о генетических основах компетентности комаров в отношении малярийных паразитов». BMC Genomics. 15 (1): 42. Дои:10.1186/1471-2164-15-42. ЧВК 3901762. PMID 24438588.
  270. ^ а б c d е ж грамм час я j k л м п о Нефси Д.Е., Уотерхаус Р.М., Абай М.Р., Аганезов С.С., Алексеев М.А., Аллен Дж.Э. и др. (Январь 2015 г.). «Геномика комаров. Высокоэволюционирующие переносчики малярии: геномы 16 комаров Anopheles». Наука. 347 (6217): 1258522. Дои:10.1126 / science.1258522. ЧВК 4380271. PMID 25554792.
  271. ^ Ghurye J, Koren S, Small ST, Redmond S, Howell P, Phillippy AM, Besansky NJ (июнь 2019 г.). «Сборка в масштабе хромосом основного переносчика малярии в Африке Anopheles funestus». GigaScience. 8 (6). Дои:10.1093 / gigascience / giz063. ЧВК 6545970. PMID 31157884.
  272. ^ Аренсбургер П., Меги К., Уотерхаус Р.М., Абрудан Дж., Амедео П., Антило Б. и др. (Октябрь 2010 г.). «Секвенирование Culex quinquefasciatus создает платформу для сравнительной геномики комаров». Наука. 330 (6000): 86–8. Bibcode:2010Наука ... 330 ... 86А. Дои:10.1126 / science.1191864. ЧВК 3740384. PMID 20929810.
  273. ^ Чжоу К., Чжу Х.М., Хуанг К.Ф., Чжао Л., Чжан Г.Дж., Рой С.В. и др. (Март 2012 г.). «Расшифровка эволюции нового пола и В-хромосомы по черновому варианту генома Drosophila albomicans». BMC Genomics. 13: 109. Дои:10.1186/1471-2164-13-109. ЧВК 3353239. PMID 22439699.
  274. ^ а б c d е ж грамм час я j Кларк А.Г., Эйзен М.Б., Смит Д.Р., Бергман С.М., Оливер Б., Марков Т.А. и др. (Ноябрь 2007 г.). «Эволюция генов и геномов на филогении дрозофилы». Природа. 450 (7167): 203–18. Bibcode:2007Натура.450..203С. Дои:10.1038 / природа06341. PMID 17994087. S2CID 2416812.
  275. ^ а б c d е ж грамм час "Drosophila modENCODE Project BCM-HGSC". Медицинский колледж Бейлора, Центр секвенирования генома человека.
  276. ^ Adams MD, Celniker SE, Holt RA, Evans CA, Gocayne JD, Amanatides PG, et al. (Март 2000 г.). «Последовательность генома Drosophila melanogaster». Наука. 287 (5461): 2185–95. Bibcode:2000Sci ... 287.2185.. Дои:10.1126 / science.287.5461.2185. PMID 10731132.
  277. ^ Гамильтон П. Т., Леонг Дж. С., Куп Б. Ф., Перлман С. Дж. (Март 2014 г.). «Транскрипционные ответы в защитном симбиозе дрозофилы». Молекулярная экология. 23 (6): 1558–70. Дои:10.1111 / mec.12603. PMID 24274471. S2CID 2964885.
  278. ^ Ричардс С., Лю Ю., Беттанкур Б. Р., Градеки П., Летовский С., Нильсен Р. и др. (Январь 2005 г.). «Сравнительное секвенирование генома Drosophila pseudoobscura: эволюция хромосом, генов и цис-элементов». Геномные исследования. 15 (1): 1–18. Дои:10.1101 / гр.3059305. ЧВК 540289. PMID 15632085.
  279. ^ "Геном Drosophila santomea - версия 1.0". Лаборатория Андольфатто. Университет Принстона.
  280. ^ а б Хименес-Гури Э., Уэрта-Сепас Дж., Коззуто Л., Уоттон К. Р., Канг Х., Химмельбауэр Х. и др. (Февраль 2013). «Сравнительная транскриптомика раннего развития двукрылых». BMC Genomics. 14: 123. Дои:10.1186/1471-2164-14-123. ЧВК 3616871. PMID 23432914.
  281. ^ Мартинсон Е.О., Пейтон Дж., Келкар Ю.Д., Дженнингс Е.К., Бенуа Дж. Б., Веррен Дж. Х., Денлингер Д.Л. (май 2019 г.). "Саркофага бульата". G3. 9 (5): 1313–1320. Дои:10.1534 / g3.119.400148. ЧВК 6505164. PMID 30926723.
  282. ^ Лемке С., Антонопулос Д.А., Мейер Ф., Доманус М.Х., Шмидт-Отт У. (май 2011 г.). «Компоненты передачи сигналов BMP в эмбриональных транскриптомах парящей мухи Episyrphus balteatus (Syrphidae)». BMC Genomics. 12: 278. Дои:10.1186/1471-2164-12-278. ЧВК 3224130. PMID 21627820.
  283. ^ Международный консорциум по геномике тли (февраль 2010 г.). «Последовательность генома гороховой тли Acyrthosiphon pisum». PLOS Биология. 8 (2): e1000313. Дои:10.1371 / journal.pbio.1000313. ЧВК 2826372. PMID 20186266.
  284. ^ Ян П, Ю С, Хао Дж, Лю В., Чжао З, Чжу З и др. (Сентябрь 2019 г.). «Последовательность генома китайского белого воскового щитовка Ericerus pela: первый проект генома семейства Coccidae щитовок». GigaScience. 8 (9). Дои:10.1093 / gigascience / giz113. ЧВК 6743827. PMID 31518402.
  285. ^ Чжу Дж., Цзян Ф., Ван Х, Ян П, Бао И, Чжао В. и др. (Декабрь 2017 г.). «Последовательность генома маленькой коричневой цикадки, Laodelphax striatellus». GigaScience. 6 (12): 1–12. Дои:10.1093 / gigascience / gix109. ЧВК 5740986. PMID 29136191.
  286. ^ Kingan SB, Urban J, Lambert CC, Baybayan P, Childers AK, Coates B. и др. (Октябрь 2019 г.). «Сборка высококачественного генома из единственной собранного в полевых условиях пятнистой мухи (Lycorma delicatula) с использованием системы PacBio Sequel II». GigaScience. 8 (10). Дои:10.1093 / gigascience / giz122. ЧВК 6791401. PMID 31609423.
  287. ^ Мескита Р.Д., Вионетт-Амарал Р.Дж., Ловенбергер С., Ривера-Помар Р., Монтейро Ф.А., Минкс П. и др. (Декабрь 2015 г.). «Геном Rhodnius prolixus, насекомого-переносчика болезни Шагаса, обнаруживает уникальные приспособления к гематофагии и паразитарной инфекции». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 112 (48): 14936–41. Bibcode:2015ПНАС..11214936М. Дои:10.1073 / pnas.1506226112. ЧВК 4672799. PMID 26627243.
  288. ^ Чен В., Шакир С., Бигхэм М., Рихтер А., Фей З., Джандер Г. (апрель 2019 г.). "Последовательность генома кукурузной тли (Rhopalosiphum maidis Fitch)". GigaScience. 8 (4). Дои:10.1093 / gigascience / giz033. ЧВК 6451198. PMID 30953568.
  289. ^ Чен Дж., Фан Дж., Чжан И, Ли Кью, Чжан С., Инь Х и др. (2019-08-01). «Проект генома зерновой тли Sitobion miscanthi на уровне хромосом». GigaScience. 8 (8). Дои:10.1093 / gigascience / giz101. ЧВК 6701489. PMID 31430367.
  290. ^ Лю Цюй, Го И, Чжан И, Ху В, Ли И, Чжу Д. и др. (Август 2019 г.). «Сборка генома на хромосомном уровне для насекомых-переносчиков болезни Шагаса, Triatoma rubrofasciata». GigaScience. 8 (8). Дои:10.1093 / gigascience / giz089. ЧВК 6699579. PMID 31425588.
  291. ^ Nygaard S, Zhang G, Schiøtt M, Li C, Wurm Y, Hu H и др. (Август 2011 г.). «Геном муравья-листореза Acromyrmex echinatior предлагает ключевые приспособления к развитой социальной жизни и выращиванию грибов». Геномные исследования. 21 (8): 1339–48. Дои:10.1101 / гр.121392.111. ЧВК 3149500. PMID 21719571.
  292. ^ Консорциум по секвенированию генома медоносной пчелы (октябрь 2006 г.). «Понимание социальных насекомых из генома пчелы Apis mellifera». Природа. 443 (7114): 931–49. Bibcode:2006Натура.443..931Т. Дои:10.1038 / природа05260. ЧВК 2048586. PMID 17073008.
  293. ^ Suen G, Teiling C, Li L, Holt C, Abouheif E, Bornberg-Bauer E, et al. (Февраль 2011 г.). Копенгейвер G (ред.). «Последовательность генома муравья-листореза Atta cephalotes позволяет лучше понять его облигатный симбиотический образ жизни». PLOS Genetics. 7 (2): e1002007. Дои:10.1371 / journal.pgen.1002007. ЧВК 3037820. PMID 21347285.
  294. ^ а б Бонасио Р., Чжан Дж., Е Ч, Мутти Н. С., Фанг Х, Цинь Н. и др. (Август 2010 г.). «Геномное сравнение муравьев Camponotus floridanus и Harpegnathos saltator». Наука. 329 (5995): 1068–71. Bibcode:2010Sci ... 329.1068B. Дои:10.1126 / science.1192428. ЧВК 3772619. PMID 20798317.
  295. ^ Оксли П.Р., Джи Л., Феттер-Прунда И., Маккензи С.К., Ли К., Ху Х, Чжан Дж., Кронауэр Д. Д. (февраль 2014 г.). «Геном клонального муравья-рейдера Cerapachys biroi». Текущая биология. 24 (4): 451–8. Дои:10.1016 / j.cub.2014.01.018. ЧВК 3961065. PMID 24508170.
  296. ^ Коноров Е.А., Никитин М.А., Михайлов К.В., Лысенков С.Н., Беленький М., Чанг П.Л., Нуждин С.В., Скобеева В.А. (февраль 2017). «Геномная эксаптация позволяет Lasius niger адаптироваться к городской среде». BMC Эволюционная биология. 17 (Приложение 1): 39. Дои:10.1186 / с12862-016-0867-х. ЧВК 5333191. PMID 28251870.
  297. ^ Смит С.Д., Зимин А., Холт С., Абухейф Е., Бентон Р., Кэш Е. и др. (Апрель 2011 г.). «Проект генома всемирно распространенного и инвазионного аргентинского муравья (Linepithema humile)». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 108 (14): 5673–8. Bibcode:2011ПНАС..108.5673С. Дои:10.1073 / pnas.1008617108. ЧВК 3078359. PMID 21282631.
  298. ^ а б c Werren JH, Richards S, Desjardins CA, Niehuis O, Gadau J, Colbourne JK и др. (Январь 2010 г.). «Функциональные и эволюционные выводы из геномов трех паразитоидных видов Nasonia». Наука. 327 (5963): 343–8. Bibcode:2010Научный ... 327..343.. Дои:10.1126 / science.1178028. ЧВК 2849982. PMID 20075255.
  299. ^ Kapheim KM, Pan H, Li C, Blatti C, Harpur BA, Ioannidis P, et al. (Март 2019 г.). "Nomia melanderi)". G3. 9 (3): 625–634. Дои:10.1534 / g3.118.200865. ЧВК 6404593. PMID 30642875.
  300. ^ Смит С. Р., Смит С. Д., Робертсон Н. М., Хельмкампф М., Зимин А., Янделл М. и др. (Апрель 2011 г.). «Проект генома красного муравья-комбайна Pogonomyrmex barbatus». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 108 (14): 5667–72. Bibcode:2011ПНАС..108.5667С. Дои:10.1073 / pnas.1007901108. ЧВК 3078412. PMID 21282651.
  301. ^ Wurm Y, Wang J, Riba-Grognuz O, Corona M, Nygaard S, Hunt BG и др. (Апрель 2011 г.). «Геном огненного муравья Solenopsis invicta». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 108 (14): 5679–84. Bibcode:2011PNAS..108.5679W. Дои:10.1073 / pnas.1009690108. ЧВК 3078418. PMID 21282665.
  302. ^ Ким С.Р., Квак В., Ким Х., Каэтано-Аноллес К., Ким К.Й., Ким С.Б. и др. (Январь 2018). «Последовательность генома шелковой моли японского дуба, Antheraea yamamai: первый проект генома в семействе Saturniidae». GigaScience. 7 (1): 1–11. Дои:10.1093 / gigascience / gix113. ЧВК 5774507. PMID 29186418.
  303. ^ Йен, Евгения С; Маккарти, Шейн А; Галарза, Хуан А; Генералович, Томаш Н; Пелан, Сара; Нгуен, Петр; Мейер, Джоана I; Уоррен, Ян А; Маппес, Джоанна; Дурбин, Ричард; Джиггинс, Крис Д. (01.08.2020). «Сборка гаплотипа de novo генома лесной тигровой моли (Arctia plantaginis) посредством трехкомпонентного биннинга». GigaScience. 9 (8). Дои:10.1093 / gigascience / giaa088. ISSN 2047-217X. ЧВК 7433188. PMID 32808665.
  304. ^ Nowell RW, Elsworth B, Oostra V, Zwaan BJ, Wheat CW, Saastamoinen M и др. (Июль 2017 г.). "Проект генома микалезиновой бабочки Bicyclus anynana с большим охватом". GigaScience. 6 (7): 1–7. Дои:10.1093 / gigascience / gix035. ЧВК 5493746. PMID 28486658.
  305. ^ Мита К., Касахара М., Сасаки С., Нагаясу Й., Ямада Т., Канамори Х., Намики Н., Китагава М., Ямасита Х., Ясукочи И., Кадоно-Окуда К., Ямамото К., Аджимура М., Равикумар Г, Шимомура М., Нагамура, Шин-И Т, Абэ Х, Шимада Т, Моришита С., Сасаки Т (февраль 2004 г.). «Последовательность генома тутового шелкопряда Bombyx mori». ДНК исследования. 11 (1): 27–35. Дои:10.1093 / dnares / 11.1.27. PMID 15141943.
  306. ^ Ван Ф, Инь Ц., Тан Р, Чен М., Ву Ц., Хуанг С. и др. (Сентябрь 2019 г.). «Сборка генома Cydia pomonella на уровне хромосом дает представление о химической экологии и устойчивости к инсектицидам». Nature Communications. 10 (1): 4237. Bibcode:2019NatCo..10.4237W. Дои:10.1038 / s41467-019-12175-9. ЧВК 6748993. PMID 31530873.
  307. ^ Жан С., Мерлин С., Буре Дж. Л., Репперт С. М. (ноябрь 2011 г.). «Геном бабочки-монарха дает представление о миграции на большие расстояния». Клетка. 147 (5): 1171–85. Дои:10.1016 / j.cell.2011.09.052. ЧВК 3225893. PMID 22118469.
  308. ^ Дасмахапатра К.К. (июль 2012 г.). «Геном бабочки показывает беспорядочный обмен мимикрическими адаптациями между видами». Природа. 487 (7405): 94–8. Bibcode:2012Натура 487 ... 94 т. Дои:10.1038 / природа11041. ЧВК 3398145. PMID 22722851.
  309. ^ Ахола В., Лехтонен Р., Сомервуо П., Салмела Л., Коскинен П., Растас П. и др. (Сентябрь 2014 г.). «Геном рябчиков Гланвилля сохраняет древний кариотип и выявляет селективные хромосомные слияния у чешуекрылых». Nature Communications. 5 (1): 4737. Bibcode:2014 НатКо ... 5.4737A. Дои:10.1038 / ncomms5737. ЧВК 4164777. PMID 25189940.
  310. ^ Конг Q, Ли В, Борек Д., Отвиновски З., Гришин Н.В. (февраль 2019 г.). «Геном Bear Giant-Skipper предполагает генетическую адаптацию к жизни в корнях юкки». Молекулярная генетика и геномика. 294 (1): 211–226. Дои:10.1007 / s00438-018-1494-6. ЧВК 6436644. PMID 30293092.
  311. ^ Лу С, Ян Дж, Дай Х, Се Ф, Хе Дж, Донг Зи и др. (Ноябрь 2019 г.). «Эталонный геном на хромосомном уровне китайской бабочки павлина (Papilio bianor) на основе секвенирования ДНК третьего поколения и анализа Hi-C». GigaScience. 8 (11). Дои:10.1093 / gigascience / giz128. ЧВК 6827417. PMID 31682256.
  312. ^ Шен Дж, Конг Q, Кинч Л.Н., Борек Д., Отвиновский З., Гришин Н.В. (03.11.2016). "Pieris rapae, стойкий инопланетянин, вредитель капусты и источник противораковых белков". F1000 Исследования. 5: 2631. Дои:10.12688 / f1000research.9765.1. ЧВК 5247789. PMID 28163896.
  313. ^ Ю М, Юэ З, Хэ Ш, Ян X, Ян Г, Се М и др. (Февраль 2013). «Гетерозиготный геном моли дает представление о травоядности и детоксикации». Природа Генетика. 45 (2): 220–5. Дои:10,1038 / нг.2524. PMID 23313953. S2CID 645600.
  314. ^ Гуэн А., Бретодо А., Нам К., Хименес С., Аури Дж. М., Дувик Б. и др. (Сентябрь 2017 г.). «Два генома высокополифагных чешуекрылых вредителей (Spodoptera frugiperda, Noctuidae) с различными диапазонами растений-хозяев». Научные отчеты. 7 (1): 11816. Bibcode:2017НатСР ... 711816Г. Дои:10.1038 / s41598-017-10461-4. ЧВК 5613006. PMID 28947760.
  315. ^ Какумани П.К., Малхотра П., Мукерджи С.К., Бхатнагар РК (август 2014 г.). «Проект сборки генома армейского червя Spodoptera frugiperda». Геномика. 104 (2): 134–43. Дои:10.1016 / j.ygeno.2014.06.005. PMID 24984256.
  316. ^ Сивасанкаран К., Мэтью П., Ананд С., Цезарь С.А., Мариапаккиам С., Игнасимуту С. (2017). "Полная последовательность митохондриального генома плодовитой моли Eudocima phalonia (Linnaeus, 1763) Lepidoptera: Noctuoidea)". Геномические данные. 14: 66–81. Дои:10.1016 / j.gdata.2017.09.004. ЧВК 5633087. PMID 29021958.
  317. ^ Ван Х, Фанг Х, Ян П, Цзян Х, Цзян Ф, Чжао Д. и др. (14 января 2014 г.). «Геном саранчи дает представление об образовании роя и дальних перелетах». Nature Communications. 5 (1): 2957. Bibcode:2014 НатКо ... 5.2957 Вт. Дои:10.1038 / ncomms3957. ЧВК 3896762. PMID 24423660.
  318. ^ Verlinden H, Sterck L, Li J, Li Z, Yssel A, Gansemans Y, et al. (27 июля 2020 г.). «Первый проект сборки генома пустынной саранчи Schistocerca gregaria». F1000 Исследования. 9: 775. Дои:10.12688 / f1000research.25148.1. ЧВК 7607483. PMID 33163158.
  319. ^ Киркнесс Э. Ф., Хаас Б. Дж., Сан В., Брейг Х. Р., Перотти М. А., Кларк Дж. М. и др. (Июль 2010 г.). «Последовательности генома тельца человека и его первичного эндосимбионта дают представление о постоянном паразитическом образе жизни». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 107 (27): 12168–73. Bibcode:2010PNAS..10712168K. Дои:10.1073 / pnas.1003379107. ЧВК 2901460. PMID 20566863.
  320. ^ Луо С., Тан М., Франдсен ПБ, Стюарт Р.Дж., Чжоу Х (декабрь 2018 г.). «Геном подводного архитектора ручейника Stenopsyche tienmushanensis Hwang (Insecta: Trichoptera)». GigaScience. 7 (12). Дои:10.1093 / gigascience / giy143. ЧВК 6302954. PMID 30476205.
  321. ^ Йоргенсен Т.С., Петерсен Б., Петерсен Х.С., Браун П.Д., Прост С., Стиллман Дж. Х. и др. (Май 2019). «Геном и транскриптом мРНК Cosmopolitan Calanoid Copepod Acartiatonsa Dana улучшают понимание эволюции размера генома Copepod». Геномная биология и эволюция. 11 (5): 1440–1450. Дои:10.1093 / gbe / evz067. ЧВК 6526698. PMID 30918947.
  322. ^ "Консорциум по геномике дафний". Архивировано из оригинал на 2010-01-09. Получено 2012-05-23.
  323. ^ "Дафния пулекс v1.0 ". Объединенный институт генома DOE. Получено 2009-11-29.
  324. ^ Colbourne JK, Pfrender ME, Gilbert D, Thomas WK, Tucker A, Oakley TH и др. (Февраль 2011 г.). «Экоответственный геном Daphnia pulex». Наука. 331 (6017): 555–61. Bibcode:2011Наука ... 331..555C. Дои:10.1126 / science.1197761. ЧВК 3529199. PMID 21292972.
  325. ^ Болдуин-Браун Дж. Г., Weeks SC, Long AD (январь 2018 г.). «Новый стандарт геномов ракообразных: очень смежная аннотированная сборка генома моллюска Eulimnadia texana выявляет порядок генов HOX и определяет половую хромосому». Геномная биология и эволюция. 10 (1): 143–156. Дои:10.1093 / gbe / evx280. ЧВК 5765565. PMID 29294012.
  326. ^ Кенни Нью-Джерси, Син Ю.В., Шен Х, Чжэ К., Ван В., Чан Т.Ф. и др. (Март 2014 г.). «Геномная последовательность и экспериментальная податливость новой модели десятиногих креветок, Neocaridina denticulata». Морские препараты. 12 (3): 1419–37. Дои:10.3390 / md12031419. ЧВК 3967219. PMID 24619275.
  327. ^ Као Д., Лай А.Г., Стаматаки Э., Розич С., Константинидес Н., Джарвис Э. и др. (Ноябрь 2016 г.). «Parhyale hawaiensis, модель развития животных, регенерации, иммунитета и переваривания лигноцеллюлозы». eLife. 5: e20062. Дои:10.7554 / eLife.20062. ЧВК 5111886. PMID 27849518.
  328. ^ Тан Б., Чжан Д., Ли Х, Цзян С., Чжан Х, Сюань Ф и др. (Январь 2020 г.). «Сборка генома на уровне хромосом показывает уникальную эволюцию генома краба-плавунца (Portunus trituberculatus)». GigaScience. 9 (1). Дои:10.1093 / gigascience / giz161. ЧВК 6944217. PMID 31904811.
  329. ^ Gutekunst J, Andriantsoa R, Falckenhayn C, Hanna K, Stein W, Rasamy J, Lyko F (март 2018 г.). «Клональная эволюция генома и быстрое инвазивное распространение мраморных раков». Природа Экология и эволюция. 2 (3): 567–573. Дои:10.1038 / s41559-018-0467-9. PMID 29403072. S2CID 3354026.
  330. ^ Кан С., Ан Д.Х., Ли Дж. Х., Ли С. Г., Шин С. К., Ли Дж. И др. (Январь 2017 г.). «Геном рачков, эндемичных по Антарктике, Tigriopus kingsejongensis». GigaScience. 6 (1): 1–9. Дои:10.1093 / gigascience / giw010. ЧВК 5467011. PMID 28369352.
  331. ^ Nossa CW, Havlak P, Yue JX, Lv J, Vincent KY, Brockmann HJ и др. (2014). «Совместная сборка и генетическое картирование генома атлантического подковообразного краба выявляют древнюю дупликацию всего генома». GigaScience. 3: 9. Дои:10.1186 / 2047-217X-3-9. ЧВК 4066314. PMID 24987520.
  332. ^ Шингате П., Рави В., Прасад А., Тай Б. Х., Гарг К. М., Чаттопадхьяй Б. и др. (2020). «Сборка на уровне хромосом генома подковообразного краба дает представление об эволюции его генома». Nature Communications. 11 (1): 2322. Bibcode:2020NatCo..11.2322S. Дои:10.1038 / s41467-020-16180-1. ЧВК 7210998. PMID 32385269.
  333. ^ а б Sanggaard KW, Bechsgaard JS, Fang X, Duan J, Dyrlund TF, Gupta V и др. (Май 2014 г.). «Геномы пауков дают представление о составе и эволюции яда и шелка». Nature Communications. 5: 3765. Bibcode:2014 НатКо ... 5.3765S. Дои:10.1038 / ncomms4765. ЧВК 4273655. PMID 24801114.
  334. ^ Санчес-Эрреро Дж. Ф., Фриас-Лопес К., Эскуэр П., Инохоса-Альварес С., Арнедо М. А., Санчес-Грасиа А., Розас Дж. (Август 2019 г.). «Проект последовательности генома паука Dysdera silvatica (Araneae, Dysderidae): ценный ресурс для функциональных и эволюционных геномных исследований хелицератов». GigaScience. 8 (8). Дои:10.1093 / gigascience / giz099. ЧВК 6701490. PMID 31430368.
  335. ^ Гулиа-Нусс М., Нусс А.Б., Мейер Дж.М., Соненшайн Д.Е., Роу Р.М., Уотерхаус Р.М. и др. (Февраль 2016). "Геномное понимание клещевого вектора болезни Лайма Ixodes scapularis". Nature Communications. 7: 10507. Bibcode:2016 НатКо ... 710507G. Дои:10.1038 / ncomms10507. ЧВК 4748124. PMID 26856261.
  336. ^ Цао З, Ю И, Ву И, Хао П, Ди З, Хе И и др. (2013). «Геном Mesobuthus martensii раскрывает уникальную модель адаптации членистоногих». Nature Communications. 4: 2602. Bibcode:2013 НатКо ... 4.2602C. Дои:10.1038 / ncomms3602. ЧВК 3826648. PMID 24129506.
  337. ^ Бабб П.Л., Лахенс Н.Ф., Корреа-Гарвал С.М., Николсон Д.Н., Ким Э.Дж., Хогенеш Дж.Б. и др. (Май 2017 г.). «Геном Nephila clavipes подчеркивает разнообразие генов паучьего шелка и их сложную экспрессию». Природа Генетика. 49 (6): 895–903. Дои:10,1038 / нг.3852. PMID 28459453. S2CID 1221097.
  338. ^ Schwager EE, Sharma PP, Clarke T., Leite DJ, Wierschin T, Pechmann M, et al. (Июль 2017 г.). «Геном домашнего паука показывает древнюю дупликацию всего генома во время эволюции паукообразных». BMC Биология. 15 (1): 62. Дои:10.1186 / с12915-017-0399-х. ЧВК 5535294. PMID 28756775.
  339. ^ Грбич М., Ван Леувен Т., Кларк Р.М., Ромбаутс С., Рузе П., Грбич В. и др. (Ноябрь 2011 г.). «Геном Tetranychus urticae обнаруживает приспособления травоядных вредителей». Природа. 479 (7374): 487–92. Bibcode:2011Натура.479..487Г. Дои:10.1038 / природа10640. ЧВК 4856440. PMID 22113690.
  340. ^ Донг X, Армстронг С.Д., Ся Д., Мейкпис Б.Л., Дарби А.С., Кадоваки Т. (1 марта 2017 г.). «Проект генома эктопаразитарного клеща медоносной пчелы», Tropilaelaps mercedesae, формируется паразитической историей жизни ". Gigascience. 6 (3): 1–17. Дои:10.1093 / gigascience / gix008. ЧВК 5467014. PMID 28327890.
  341. ^ Чипман А.Д., Ферриер Д.Е., Брена С., Ку Дж., Хьюз Д.С., Шредер Р. и др. (Ноябрь 2014 г.). «Первая последовательность генома многоножки показывает консервативное содержание генов членистоногих и организацию генома у многоножки Strigamia maritima». PLOS Биология. 12 (11): e1002005. Дои:10.1371 / journal.pbio.1002005. ЧВК 4244043. PMID 25423365.
  342. ^ Бутби Т.К., Тенлен-младший, Смит Ф.В., Ван-младший, Патанелла К.А., Нишимура Е.О. и др. (Декабрь 2015 г.). «Доказательства обширного горизонтального переноса генов из чернового генома тихоходки». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 112 (52): 15976–81. Bibcode:2015ПНАС..11215976Б. Дои:10.1073 / pnas.1510461112. ЧВК 4702960. PMID 26598659.
  343. ^ Кутсовулос Г., Кумар С., Лаэтч Д.Р., Стивенс Л., Дауб Дж., Конлон С., Марун Х., Томас Ф., Абубейкер А., Блэкстер М. (2015). «Геном тихоходки Hypsibius dujardini». bioRxiv 10.1101/033464.
  344. ^ Го И, Чжан И, Лю Цюй, Хуанг И, Мао Г, Юэ З и др. (Октябрь 2019 г.). «Сборка генома на хромосомном уровне для гигантской африканской улитки Achatina fulica». GigaScience. 8 (10). Дои:10.1093 / gigascience / giz124. ЧВК 6802634. PMID 31634388.
  345. ^ Брежова Б., Альбертин С.Б., Сильва Ф., Гарднер П., Барил Т., Хейворд А. и др. (01.01.2020). «Черновая последовательность генома неуловимого гигантского кальмара Architeuthis dux». GigaScience. 9 (1). Дои:10.1093 / gigascience / giz152. ЧВК 6962438. PMID 31942620.
  346. ^ Ли Ч, Лю Х, Лю Б, Ма Б, Лю Ф, Лю Дж и др. (Апрель 2018). «Проект генома перуанского гребешка Argopecten purpuratus». GigaScience. 7 (4). Дои:10.1093 / gigascience / giy031. ЧВК 5905365. PMID 29617765.
  347. ^ а б Сунь Дж, Чжан И, Сюй Т, Чжан И, Му Х, Чжан И и др. (Апрель 2017 г.). «Адаптация к глубоководной хемосинтетической среде, выявленная геномами мидий». Природа Экология и эволюция. 1 (5): 121. Дои:10.1038 / s41559-017-0121. PMID 28812709. S2CID 26405671.
  348. ^ Adema CM, Hillier LW, Jones CS, Loker ES, Knight M, Minx P и др. (Май 2017 г.). «Полногеномный анализ пресноводной улитки, передающей шистосомоз». Nature Communications. 8: 15451. Bibcode:2017НатКо ... 815451A. Дои:10.1038 / ncomms15451. ЧВК 5440852. PMID 28508897.
  349. ^ Ли Y, Сунь X, Ху X, Xun X, Zhang J, Guo X и др. (Ноябрь 2017 г.). «Геном морского гребешка обнаруживает молекулярную адаптацию к полусидячему образу жизни и нейротоксинам». Nature Communications. 8 (1): 1721. Bibcode:2017NatCo ... 8.1721L. Дои:10.1038 / s41467-017-01927-0. ЧВК 5700196. PMID 29167427.
  350. ^ Zhang G, Fang X, Guo X, Li L, Luo R, Xu F и др. (Октябрь 2012 г.). «Геном устрицы раскрывает стрессовую адаптацию и сложность формирования раковины». Природа. 490 (7418): 49–54. Bibcode:2012Натура.490 ... 49Z. Дои:10.1038 / природа11413. HDL:10722/251007. PMID 22992520. S2CID 52853995.
  351. ^ Кальчино А.Д., Луис де Оливейра А., Симаков О., Шваха Т., Цигер Э., Воллесен Т. и др. (Октябрь 2019 г.). «Геном квагги и эволюция толерантности к пресной воде». ДНК исследования. 26 (5): 411–422. Дои:10.1093 / dnares / dsz019. ЧВК 6796509. PMID 31504356.
  352. ^ Belcaid M, Casaburi G, McAnulty SJ, Schmidbaur H, Suria AM, Moriano-Gutierrez S, et al. (Февраль 2019). «Симбиотические органы, сформированные различными способами эволюции генома у головоногих моллюсков». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 116 (8): 3030–3035. Дои:10.1073 / pnas.1817322116. ЧВК 6386654. PMID 30635418.
  353. ^ Cai H, Li Q, Fang X, Li J, Curtis NE, Altenburger A, et al. (Февраль 2019). «Проект генома морской слизни Elysia chlorotica, работающей на солнечной энергии». Научные данные. 6: 190022. Bibcode:2019NatSD ... 690022C. Дои:10.1038 / sdata.2019.22. ЧВК 6380222. PMID 30778257.
  354. ^ Нам Б.Х., Квак В., Ким Й.О., Ким Д.Г., Конг Х.Дж., Ким В.Дж. и др. (Май 2017 г.). «Последовательность генома тихоокеанского морского ушка (Haliotis Discus hannai): первый проект генома в семействе Haliotidae». GigaScience. 6 (5): 1–8. Дои:10.1093 / gigascience / gix014. ЧВК 5439488. PMID 28327967.
  355. ^ Whitelaw, Brooke L; Кук, Ира Р.; Финн, Джулиан; да Фонсека, Rute R; Ритчард, Елена А; Гилберт, М. Т. П.; Симаков Олег; Стругнелл, Ян М. (ноябрь 2020 г.). «Эволюция адаптивного яда и его токсичность у осьминогов обусловлены обширным образованием, расширением и потерей новых генов». GigaScience. 9 (11). Дои:10.1093 / gigascience / giaa120. ISSN 2047-217X. ЧВК 7656900. PMID 33175168.
  356. ^ а б c Симаков О., Марлетаз Ф., Чо С.Дж., Эдсингер-Гонсалес Э., Хавлак П., Хеллстен У. и др. (Январь 2013). «Понимание эволюции билатерий из трех спиральных геномов». Природа. 493 (7433): 526–31. Bibcode:2013Натура.493..526S. Дои:10.1038 / природа11696. ЧВК 4085046. PMID 23254933.
  357. ^ Улиано-Силва М., Дондеро Ф., Дэн Отто Т., Коста I, Лима, Северная Каролина, Америко Дж. А. и др. (Февраль 2018). «Гибридно-иерархическая стратегия сборки генома для секвенирования инвазивной золотой мидии Limnoperna fortunei». GigaScience. 7 (2). Дои:10.1093 / gigascience / gix128. ЧВК 5836269. PMID 29267857.
  358. ^ Мургарелла М., Пуйу Д., Новоа Б., Фигерас А., Посада Д., Канчайа С. (2016-03-15). "Первое знакомство с геномом мидии-фильтратора Mytilus galloprovincialis". PLOS ONE. 11 (3): e0151561. Bibcode:2016PLoSO..1151561M. Дои:10.1371 / journal.pone.0151561. ЧВК 4792442. PMID 26977809.
  359. ^ Альбертин CB, Симаков О., Митрос Т., Ван З.Й., Пунгор Дж. Р., Эдсингер-Гонсалес Э. и др. (Август 2015 г.). «Геном осьминога и эволюция нейронных и морфологических новинок головоногих моллюсков». Природа. 524 (7564): 220–4. Bibcode:2015Натура.524..220А. Дои:10.1038 / природа14668. ЧВК 4795812. PMID 26268193.
  360. ^ Ким Б.М., Кан С., Ан Д.Х., Юнг С.Х., Ри Х., Ю Дж.С. и др. (Ноябрь 2018 г.). «Геном длиннорукого осьминога Octopus minor». GigaScience. 7 (11). Дои:10.1093 / gigascience / giy119. ЧВК 6279123. PMID 30256935.
  361. ^ Zarrella I, Herten K, Maes GE, Tai S, Yang M, Seuntjens E, et al. (Апрель 2019 г.). «Сборка генома Octopus vulgaris с помощью обследования и справочной информации». Научные данные. 6 (1): 13. Bibcode:2019NatSD ... 6 ... 13Z. Дои:10.1038 / s41597-019-0017-6. ЧВК 6472339. PMID 30931949.
  362. ^ Ван С., Чжан Дж., Цзяо В., Ли Дж., Сюнь X, Сунь Y и др. (Апрель 2017 г.). «Геном морского гребешка дает представление об эволюции кариотипа и развития двуногих животных». Природа Экология и эволюция. 1 (5): 120. Дои:10.1038 / s41559-017-0120. PMID 28812685. S2CID 10331741.
  363. ^ Кенни Н.Дж., Маккарти С.А., Дудченко О., Джеймс К., Беттеридж Е., Кортон С. и др. (Май 2020 г.). «Богатый геном геном морского гребешка Pecten maximus». GigaScience. 9 (5). Дои:10.1093 / gigascience / giaa037. ЧВК 7191990. PMID 32352532.
  364. ^ Такеучи Т., Кавасима Т., Коянаги Р., Гёджа Ф., Танака М., Икута Т. и др. (Апрель 2012 г.). «Проект генома жемчужной устрицы Pinctada fucata: платформа для понимания биологии двустворчатых моллюсков». ДНК исследования. 19 (2): 117–30. Дои:10.1093 / dnares / dss005. ЧВК 3325083. PMID 22315334.
  365. ^ Лю Ц., Чжан И, Рен И, Ван Х, Ли С., Цзян Ф. и др. (Сентябрь 2018 г.). «Геном золотой яблочной улитки Pomacea canaliculata дает представление о стрессоустойчивости и инвазивной адаптации». GigaScience. 7 (9). Дои:10.1093 / gigascience / giy101. ЧВК 6129957. PMID 30107526.
  366. ^ Mun S, Kim YJ, Markkandan K, Shin W, Oh S, Woo J и др. (Июнь 2017). «Полногеном и транскриптом манильского моллюска (Ruditapes philippinarum)». Геномная биология и эволюция. 9 (6): 1487–1498. Дои:10.1093 / gbe / evx096. ЧВК 5499747. PMID 28505302.
  367. ^ Пауэлл Д., Субраманиан С., Суванса-Ард С., Чжао М., О'Коннор В., Рафтос Д., Элизур А. (декабрь 2018 г.). «Геном устрицы Saccostrea дает представление об экологической устойчивости двустворчатых моллюсков». ДНК исследования. 25 (6): 655–665. Дои:10.1093 / dnares / dsy032. ЧВК 6289776. PMID 30295708.
  368. ^ Бай С.М., Синь Л.С., Розани У., Ву Б., Ван КК, Дуань К.К. и др. (Июль 2019). «Сборка на хромосомном уровне кровяного моллюска Scapharca (Anadara) broughtonii с использованием длинных последовательностей чтения и Hi-C». GigaScience. 8 (7). Дои:10.1093 / gigascience / giz067. ЧВК 6615981. PMID 31289832.
  369. ^ Renaut S, Guerra D, Hoeh WR, Stewart DT, Bogan AE, Ghiselli F и др. (Июль 2018). «Исследование генома пресноводной мидии Venustaconcha ellipsiformis (Bivalvia: Unionida) с использованием метода гибридной сборки De Novo». Геномная биология и эволюция. 10 (7): 1637–1646. Дои:10.1093 / gbe / evy117. ЧВК 6054159. PMID 29878181.
  370. ^ Ван Х, Чен В., Хуанг И, Сун Дж, Мэн Дж, Лю Х и др. (Октябрь 2011 г.). «Проект генома канцерогенного печеночного двуустки человека Clonorchis sinensis». Геномная биология. 12 (10): R107. Дои:10.1186 / gb-2011-12-10-r107. ЧВК 3333777. PMID 22023798.
  371. ^ а б c d Цай И.Дж., Заровецки М., Холройд Н., Гарсиаррубио А., Санчес-Флорес А., Брукс К.Л. и др. (Апрель 2013). «В геномах четырех видов ленточных червей обнаружена адаптация к паразитизму». Природа. 496 (7443): 57–63. Bibcode:2013Натура 496 ... 57.. Дои:10.1038 / природа12031. ЧВК 3964345. PMID 23485966.
  372. ^ Zheng H, Zhang W, Zhang L, Zhang Z, Li J, Lu G и др. (Октябрь 2013). «Геном гидатидного цепня Echinococcus granulosus». Природа Генетика. 45 (10): 1168–75. Дои:10,1038 / нг.2757. PMID 24013640. S2CID 205347630.
  373. ^ Янг Н.Д., Джекс А.Р., Ли Б., Лю С., Ян Л., Сюн З. и др. (Январь 2012 г.). «Полногеномная последовательность Schistosoma haematobium». Природа Генетика. 44 (2): 221–5. Дои:10,1038 / нг.1065. HDL:10072/45821. PMID 22246508. S2CID 13309839.
  374. ^ а б Stroehlein AJ, Korhonen PK, Chong TM, Lim YL, Chan KG, Webster B и др. (Сентябрь 2019 г.). «Высококачественный геном Schistosoma haematobium, достигнутый с помощью одномолекулярного секвенирования и долгосрочного секвенирования». GigaScience. 8 (9). Дои:10.1093 / gigascience / giz108. ЧВК 6736295. PMID 31494670.
  375. ^ В Schistosoma japonicum Консорциум по секвенированию и функциональному анализу генома (июль 2009 г.). «Геном Schistosoma japonicum обнаруживает особенности взаимодействия паразита и хозяина». Природа. 460 (7253): 345–51. Bibcode:2009 Натур.460..345Z. Дои:10.1038 / природа08140. ЧВК 3747554. PMID 19606140.
  376. ^ Берриман М., Хаас Б.Дж., Ловерде П.Т., Уилсон Р.А., Диллон Г.П., Серкейра Г.К. и др. (Июль 2009 г.). «Геном кровяной двуустки Schistosoma mansoni». Природа. 460 (7253): 352–8. Bibcode:2009Натура.460..352Б. Дои:10.1038 / природа08160. ЧВК 2756445. PMID 19606141.
  377. ^ Протасио А.В., Цай И.Дж., Бэббидж А., Никол С., Хант М., Аслетт М.А. и др. (Январь 2012 г.). «Систематически улучшенный высококачественный геном и транскриптом кровяной двуустки человека Schistosoma mansoni». PLOS забытые тропические болезни. 6 (1): e1455. Дои:10.1371 / journal.pntd.0001455. ЧВК 3254664. PMID 22253936.
  378. ^ "Проект". Архивировано из оригинал на 2012-03-08. Получено 2012-05-23.
  379. ^ «СмедГД».
  380. ^ Шварц Е.М., Ху Y, Антошечкин И., Миллер М.М., Штернберг П.В., Ароян Р.В. (апрель 2015 г.). «Геном и транскриптом зоонозного анкилостомы Ancylostoma ceylanicum идентифицируют семейства генов, специфичных для инфекции». Природа Генетика. 47 (4): 416–22. Дои:10,1038 / нг.3237. ЧВК 4617383. PMID 25730766.
  381. ^ Jex AR, Liu S, Li B, Young ND, Hall RS, Li Y и др. (Октябрь 2011 г.). «Проект генома Ascaris suum». Природа. 479 (7374): 529–33. Bibcode:2011Натура.479..529J. Дои:10.1038 / природа10553. PMID 22031327. S2CID 205226683.
  382. ^ Ghedin E, Wang S, Spiro D, Caler E, Zhao Q, Crabtree J, et al. (Сентябрь 2007 г.). «Проект генома филяриального паразита нематоды Brugia malayi». Наука. 317 (5845): 1756–60. Bibcode:2007Научный ... 317.1756G. Дои:10.1126 / science.1145406. ЧВК 2613796. PMID 17885136.
  383. ^ Кикучи Т., Коттон Дж. А., Далзелл Дж. Дж., Хасегава К., Канзаки Н., Маквей П. и др. (Сентябрь 2011 г.). «Геномное понимание происхождения паразитизма у появляющегося патогена растений Bursaphelenchus xylophilus». Патогены PLOS. 7 (9): e1002219. Дои:10.1371 / journal.ppat.1002219. ЧВК 3164644. PMID 21909270.
  384. ^ Мортазави А., Шварц Э.М., Уильямс Б., Шеффер Л., Антошечкин И., Уолд Б.Дж. и др. (Декабрь 2010 г.). «Создание каркаса для генома нематоды Caenorhabditis с помощью RNA-seq». Геномные исследования. 20 (12): 1740–7. Дои:10.1101 / гр.111021.110. ЧВК 2990000. PMID 20980554.
  385. ^ "GSC: Caenorhabditis n. Sp. PB2801". Архивировано из оригинал 18 августа 2007 г.. Получено 28 апреля 2007.
  386. ^ "Червячная база". Получено 4 сентября 2015.
  387. ^ Штейн Л.Д., Бао З., Блазиар Д., Блюменталь Т., Брент М.Р., Чен Н. и др. (Ноябрь 2003 г.). «Последовательность генома Caenorhabditis briggsae: платформа для сравнительной геномики». PLOS Биология. 1 (2): E45. Дои:10.1371 / journal.pbio.0000045. ЧВК 261899. PMID 14624247.
  388. ^ Консорциум по секвенированию C. elegans. (Декабрь 1998 г.). «Последовательность генома нематоды C. elegans: платформа для изучения биологии». Наука. 282 (5396): 2012–8. Bibcode:1998На ... 282.2012.. Дои:10.1126 / science.282.5396.2012. PMID 9851916.
  389. ^ "GSC: Caenorhabditis remanei". Архивировано из оригинал 13 марта 2007 г.. Получено 28 апреля 2007.
  390. ^ Хааг Е.С., Чемберлин Х., Коглан А, Fitch DH, Петерс А.Д., Шуленбург Х. (март 2007 г.). «Эволюция Caenorhabditis: если все они похожи, значит, вы недостаточно внимательно» (PDF). Тенденции в генетике. 23 (3): 101–4. Дои:10.1016 / j.tig.2007.01.002. PMID 17275130.
  391. ^ Godel C, Kumar S, Koutsovoulos G, Ludin P, Nilsson D, Comandatore F, et al. (Ноябрь 2012 г.). «Геном сердечного червя, Dirofilaria immitis, выявляет мишени для лекарств и вакцин». Журнал FASEB. 26 (11): 4650–61. Дои:10.1096 / fj.12-205096. ЧВК 3475251. PMID 22889830.
  392. ^ Коттон Дж. А., Лилли С. Дж., Джонс Л. М., Кикучи Т., Рид А. Дж., Торп П. и др. (Март 2014 г.). «Геном и специфические транскриптомы жизненного цикла Globodera pallida проливают свет на ключевые аспекты паразитизма растений цистовой нематодой». Геномная биология. 15 (3): R43. Дои:10.1186 / gb-2014-15-3-r43. ЧВК 4054857. PMID 24580726.
  393. ^ Лэнг Р., Кикучи Т., Мартинелли А., Цай И.Дж., Бич Р.Н., Редман Э. и др. (Август 2013). «Геном и транскриптом Haemonchus contortus, ключевой модели паразита для открытия лекарств и вакцин». Геномная биология. 14 (8): R88. Дои:10.1186 / gb-2013-14-8-r88. ЧВК 4054779. PMID 23985316.
  394. ^ Мейсонбринк Р., Майер Т.Р., Маппирала Ю., Ситхарам А.С., лорд Э., Джувейл П.С. и др. (9 февраля 2019 г.). «Геном нематоды соевых бобов (Гетеродеры глицины) раскрывает сложные закономерности дупликаций, участвующих в эволюции генов паразитизма ». BMC Genomics. 20 (1): 119. Дои:10.1186 / s12864-019-5485-8. ЧВК 6367775. PMID 30732586.
  395. ^ Бай X, Адамс Б.Дж., Циче Т.А., Клифтон С., Гоглер Р., Ким К.С. и др. (18 июля 2013 г.). «Любовник и боец: последовательность генома энтомопатогенной нематоды Heterorhabditis bacteriophora». PLOS ONE. 8 (7): e69618. Bibcode:2013PLoSO ... 869618B. Дои:10.1371 / journal.pone.0069618. ЧВК 3715494. PMID 23874975.
  396. ^ Desjardins CA, Cerqueira GC, Goldberg JM, Dunning Hotopp JC, Haas BJ, Zucker J, et al. (Май 2013). «Геномика лоа-лоа, филяриального паразита человека, свободного от вольбахии». Природа Генетика. 45 (5): 495–500. Дои:10,1038 / нг.2585. ЧВК 4238225. PMID 23525074.
  397. ^ Опперман Ч.Х., Берд Д.М., Уильямсон В.М., Рохсар Д.С., Берк М., Кон Дж. И др. (Сентябрь 2008 г.). «Последовательность и генетическая карта Meloidogyne hapla: компактный геном нематод для паразитизма растений». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 105 (39): 14802–7. Bibcode:2008PNAS..10514802O. Дои:10.1073 / pnas.0805946105. ЧВК 2547418. PMID 18809916.
  398. ^ Abad P, Gouzy J, Aury JM, Castagnone-Sereno P, Danchin EG, Deleury E, et al. (Август 2008 г.). «Последовательность генома многоклеточного растения-паразита нематоды Meloidogyne incognita». Природа Биотехнологии. 26 (8): 909–15. Дои:10.1038 / nbt.1482. PMID 18660804. S2CID 8836601.
  399. ^ Тан Ю.Т., Гао Х, Роза Б.А., Абубакер С., Холлсворт-Пепин К., Мартин Дж. И др. (Март 2014 г.). «Геном анкилостомы человека Necator americanus». Природа Генетика. 46 (3): 261–269. Дои:10,1038 / нг.2875. ЧВК 3978129. PMID 24441737.
  400. ^ а б «База данных филяриальных червей». 2015-06-04. Получено 5 июн 2015.
  401. ^ Дитрих С., Клифтон С.В., Шустер Л.Н., Чинвалла А., Делеханти К., Динкелакер И. и др. (Октябрь 2008 г.). «Геном Pristionchus pacificus дает уникальный взгляд на образ жизни и паразитизм нематод». Природа Генетика. 40 (10): 1193–8. Дои:10,1038 / нг.227. ЧВК 3816844. PMID 18806794.
  402. ^ Schiffer PH, Kroiher M, Kraus C, Koutsovoulos GD, Kumar S, Camps JI, et al. (Декабрь 2013). «Геном Romanomermis culicivorax: выявление фундаментальных изменений в основных генетических инструментах развития нематод». BMC Genomics. 14 (1): 923. Дои:10.1186/1471-2164-14-923. ЧВК 3890508. PMID 24373391.
  403. ^ Jex AR, Nejsum P, Schwarz EM, Hu L, Young ND, Hall RS и др. (Июль 2014 г.). «Геном и транскриптом свиного власоглава Trichuris suis». Природа Генетика. 46 (7): 701–6. Дои:10.1038 / нг.3012. ЧВК 4105696. PMID 24929829.
  404. ^ а б Foth BJ, Tsai IJ, Reid AJ, Bancroft AJ, Nichol S, Tracey A, et al. (Июль 2014 г.). «Анализ генома власоглавов и двухвидового транскриптома дает молекулярное понимание тесного взаимодействия паразита и хозяина». Природа Генетика. 46 (7): 693–700. Дои:10,1038 / нг.3010. ЧВК 5012510. PMID 24929830.
  405. ^ "JGI: Capitella teleta".
  406. ^ "JGI: Helobdella robusta".
  407. ^ "WhitneyLab: Eisenia fetida".
  408. ^ Zwarycz AS, Nossa CW, Putnam NH, Ryan JF (декабрь 2015 г.). «Сроки и объем геномного расширения в пределах Annelida: данные гомеобоксов в геноме дождевого червя Eisenia fetida». Геномная биология и эволюция. 8 (1): 271–81. Дои:10.1093 / gbe / evv243. ЧВК 4758240. PMID 26659921.
  409. ^ Луо Ю.Дж., Такеучи Т., Коянаги Р., Ямада Л., Канда М., Халтурина М. и др. (Сентябрь 2015 г.). «Геном Lingula дает представление об эволюции брахиопод и происхождении биоминерализации фосфатов». Nature Communications. 6: 8301. Bibcode:2015 НатКо ... 6.8301L. Дои:10.1038 / ncomms9301. ЧВК 4595640. PMID 26383154.
  410. ^ Флот Дж. Ф., Хеспелс Б., Ли Х, Ноэль Б., Архипова И., Данчин Э. Г. и др. (Август 2013). «Геномные доказательства амейотической эволюции бделлоидной коловратки Adineta vaga». Природа. 500 (7463): 453–7. Bibcode:2013Натура.500..453F. Дои:10.1038 / природа12326. PMID 23873043. S2CID 1706158.