WikiDer > POLR2A
POLR2A
ДНК-направленная субъединица РНК-полимеразы II RPB1, также известный как RPB1, является фермент что у людей кодируется POLR2A ген.
Функция
Этот ген кодирует самую большую субъединицу РНК-полимераза II, полимераза, ответственная за синтез информационная РНК в эукариоты. Продукт этого гена содержит карбокси-концевой домен состоит из гептапептидных повторов, которые необходимы для полимераза Мероприятия. Эти повторы содержат остатки серина и треонина, которые фосфорилируются при активной транскрипции. РНК-полимераза. Кроме того, эта субъединица в сочетании с несколькими другими субъединицами полимеразы образует ДНК-связывающий домен полимеразы, бороздку, в которой матрица ДНК транскрибируется в РНК.[5]
Взаимодействия
POLR2A был показан взаимодействовать с:
- BRCA1,[6][7][8][9]
- CREBBP,[10]
- CTDP1,[7]
- CDK8,[10]
- GTF2B,[7]
- GTF2F1,[7][10]
- GTF2H4,[7]
- MED21,[7][10][11]
- MED26,[12]
- PCAF,[10]
- POLR2C,[13]
- POLR2E,[13]
- POLR2H,[13]
- POLR2L,[13]
- PQBP1,[14]
- SMARCA2,[10][15][16]
- SMARCA4[15][16][17]
- SMARCB1,[10][15][16]
- SMYD3,[18]
- SND1,[19]
- SUPT5H,[20][21]
- TAF11,[7]
- TBP,[7]
- TCEA1,[22][23][24]
- TCERG1,[25] и
- ZNF74.[26]
Рекомендации
- ^ а б c ENSG00000181222 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000284832, ENSG00000181222 - Ансамбль, Май 2017
- ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000005198 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ «Ген Entrez: полипептид А полимеразы POLR2A (РНК) II (ДНК-направленный), 220 кДа».
- ^ Крам С.А., Миранда Г.А., Лин К., Лейн Т.Ф. (декабрь 2003 г.). «BRCA1 связывается с процессивной РНК-полимеразой II». J. Biol. Chem. 278 (52): 52012–20. Дои:10.1074 / jbc.M308418200. PMID 14506230.
- ^ а б c d е ж грамм час Скалли Р., Андерсон С.Ф., Чао Д.М., Вей В., Е Л., Янг Р.А., Ливингстон Д.М., Парвин Д.Д. (май 1997 г.). «BRCA1 является компонентом холофермента РНК-полимеразы II». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 94 (11): 5605–10. Дои:10.1073 / пнас.94.11.5605. ЧВК 20825. PMID 9159119.
- ^ Чиба Н., Парвин Дж. Д. (октябрь 2001 г.). «Перераспределение BRCA1 среди четырех различных белковых комплексов после блокировки репликации». J. Biol. Chem. 276 (42): 38549–54. Дои:10.1074 / jbc.M105227200. PMID 11504724.
- ^ Krum SA, Womack JE, Lane TF (сентябрь 2003 г.). «BRCA1 крупного рогатого скота демонстрирует классические ответы на генотоксический стресс, но имеет низкую активность активации транскрипции in vitro». Онкоген. 22 (38): 6032–44. Дои:10.1038 / sj.onc.1206515. PMID 12955082.
- ^ а б c d е ж грамм Чо Х, Орфанид Г, Сан Х, Ян Х Дж, Огрызко В., Лис Э, Накатани Й, Рейнберг Д. (сентябрь 1998 г.). «Комплекс человеческой РНК-полимеразы II, содержащий факторы, изменяющие структуру хроматина». Мол. Клетка. Биол. 18 (9): 5355–63. Дои:10.1128 / MCB.18.9.5355. ЧВК 109120. PMID 9710619.
- ^ Suñé C, Hayashi T, Liu Y, Lane WS, Young RA, Garcia-Blanco MA (октябрь 1997 г.). «CA150, ядерный белок, связанный с холоферментом РНК-полимеразы II, участвует в транскрипции Tat-активированного вируса иммунодефицита человека типа 1». Мол. Клетка. Биол. 17 (10): 6029–39. Дои:10.1128 / MCB.17.10.6029. ЧВК 232452. PMID 9315662.
- ^ Сато С., Томомори-Сато К., Пармели Т.Дж., Флоренс Л., Зыбаилов Б., Суонсон С.К., Бэнкс Калифорния, Джин Дж., Цай Й., Уошберн М.П., Конавей Д.В., Конавей Р.К. (июнь 2004 г.). «Набор консенсусных медиаторных субъединиц млекопитающих, идентифицированных с помощью технологии многомерной идентификации белков». Мол. Клетка. 14 (5): 685–91. Дои:10.1016 / j.molcel.2004.05.006. PMID 15175163.
- ^ а б c d Акер Дж., Де Грааф М., Чейнел И., Хазак В., Кединджер С., Виньерон М. (июль 1997 г.). «Взаимодействие между субъединицами РНК-полимеразы II человека». J. Biol. Chem. 272 (27): 16815–21. Дои:10.1074 / jbc.272.27.16815. PMID 9201987.
- ^ Humbert S, Saudou F (май 2002 г.). «К клеточной специфичности в SCA1». Нейрон. 34 (5): 669–70. Дои:10.1016 / s0896-6273 (02) 00715-8. PMID 12062012. S2CID 15993809.
- ^ а б c Сиф С., Саурин А.Дж., Имбальзано А.Н., Кингстон Р.Е. (март 2001 г.). «Очистка и характеристика mSin3A-содержащих Brg1 и hBrm комплексов ремоделирования хроматина». Genes Dev. 15 (5): 603–18. Дои:10.1101 / gad.872801. ЧВК 312641. PMID 11238380.
- ^ а б c Ван В., Коте Дж., Сюэ Й., Чжоу С., Хавари П.А., Биггар С.Р., Мухардт С., Калпана Г.В., Гофф С.П., Янив М., Уоркман Дж.Л., Крабтри Г.Р. (октябрь 1996 г.). «Очистка и биохимическая гетерогенность комплекса SWI-SNF млекопитающих». EMBO J. 15 (19): 5370–82. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1996.tb00921.x. ЧВК 452280. PMID 8895581.
- ^ Чжао К., Ван В., Рандо О.Дж., Сюэ Ю., Свидерек К., Куо А., Крэбтри Г.Р. (ноябрь 1998 г.). «Быстрое и фосфоинозитол-зависимое связывание SWI / SNF-подобного комплекса BAF с хроматином после передачи сигналов рецептора Т-лимфоцитов». Клетка. 95 (5): 625–36. Дои:10.1016 / s0092-8674 (00) 81633-5. PMID 9845365. S2CID 3184211.
- ^ Хамамото Р., Фурукава Ю., Морита М., Иимура Ю., Сильва Ф. П., Ли М., Ягю Р., Накамура И. (август 2004 г.). «SMYD3 кодирует гистон-метилтрансферазу, участвующую в пролиферации раковых клеток». Nat. Cell Biol. 6 (8): 731–40. Дои:10.1038 / ncb1151. PMID 15235609. S2CID 13456531.
- ^ Янг Дж., Айттомаки С., Песу М., Картер К., Сааринен Дж., Калккинен Н., Кифф Е., Сильвеннойнен О. (сентябрь 2002 г.). «Идентификация p100 как коактиватора для STAT6, который связывает STAT6 с РНК-полимеразой II». EMBO J. 21 (18): 4950–8. Дои:10.1093 / emboj / cdf463. ЧВК 126276. PMID 12234934.
- ^ Ким Дж. Б., Ямагути Ю., Вада Т., Ханда Х, Шарп, Пенсильвания (сентябрь 1999 г.). «Белок Tat-SF1 связывается с белками RAP30 и SPT5 человека». Мол. Клетка. Биол. 19 (9): 5960–8. Дои:10.1128 / mcb.19.9.5960. ЧВК 84462. PMID 10454543.
- ^ Вада Т., Такаги Т., Ямагути Ю., Фердоус А., Имаи Т., Хиросе С., Сугимото С., Яно К., Харцог Г.А., Уинстон Ф., Буратовски С., Ханда Х (февраль 1998 г.). «DSIF, новый фактор элонгации транскрипции, который регулирует процессивность РНК-полимеразы II, состоит из гомологов Spt4 и Spt5 человека». Genes Dev. 12 (3): 343–56. Дои:10.1101 / gad.12.3.343. ЧВК 316480. PMID 9450929.
- ^ Conaway RC, Kong SE, Conaway JW (август 2003 г.). «TFIIS и GreB: два единомышленника фактора элонгации транскрипции с липкими пальцами». Клетка. 114 (3): 272–4. Дои:10.1016 / S0092-8674 (03) 00607-X. PMID 12914690. S2CID 14209300.
- ^ Аршамбо Дж., Пан Дж., Дахмус Г.К., Картье М., Маршалл Н., Чжан С., Дахмус М.Э., Гринблатт Дж. (Октябрь 1998 г.). «FCP1, RAP74-взаимодействующая субъединица протеинфосфатазы человека, которая дефосфорилирует карбокси-концевой домен РНК-полимеразы IIO». J. Biol. Chem. 273 (42): 27593–601. Дои:10.1074 / jbc.273.42.27593. PMID 9765293.
- ^ Пан Дж., Асо Т., Гринблатт Дж. (Сентябрь 1997 г.). «Взаимодействие факторов элонгации TFIIS и элонгина А с холоферментом РНК-полимеразы II человека, способным к промотор-специфической инициации и реагирующим на активаторы транскрипции». J. Biol. Chem. 272 (39): 24563–71. Дои:10.1074 / jbc.272.39.24563. PMID 9305922.
- ^ Карти С.М., Гольдстром А.С., Сунье С., Гарсиа-Бланко М.А., Гринлиф А.Л. (август 2000 г.). «Модули взаимодействия с белками, которые организуют ядерную функцию: домены FF CA150 связывают фосфо-CTD РНК-полимеразы II». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 97 (16): 9015–20. Дои:10.1073 / pnas.160266597. ЧВК 16813. PMID 10908677.
- ^ Грондин Б., Коте Ф, Базине М., Винсент М., Обри М. (октябрь 1997 г.). «Прямое взаимодействие белка цинкового пальца KRAB / Cys2-His2 ZNF74 с гиперфосфорилированной формой наибольшей субъединицы РНК-полимеразы II». J. Biol. Chem. 272 (44): 27877–85. Дои:10.1074 / jbc.272.44.27877. PMID 9346935.
дальнейшее чтение
- Джанг К.Т. (1998). «Tat, Tat-ассоциированная киназа и транскрипция». J. Biomed. Наука. 5 (1): 24–7. Дои:10.1007 / BF02253352. PMID 9570510.
- Янкулов К, Бентли Д (1998). «Транскрипционный контроль: кофакторы Tat и удлинение транскрипции». Curr. Биол. 8 (13): R447–9. Дои:10.1016 / S0960-9822 (98) 70289-1. PMID 9651670. S2CID 15480646.
- Романо Дж., Кастен М., Де Фалько Дж., Микели П., Халили К., Джордано А. (2000). «Регуляторные функции Cdk9 и циклина T1 в экспрессии гена пути трансактивации tat ВИЧ». J. Cell. Биохим. 75 (3): 357–68. Дои:10.1002 / (SICI) 1097-4644 (19991201) 75: 3 <357 :: AID-JCB1> 3.0.CO; 2-K. PMID 10536359.
- Сентирмай М.Н., Савадого М. (2000). «Пространственная организация транскрипции РНК-полимеразы II в ядре». Нуклеиновые кислоты Res. 28 (10): 2019–25. Дои:10.1093 / nar / 28.10.2019. ЧВК 105382. PMID 10773068.
- Марчелло А., Зоппе М., Джакка М. (2002). «Множественные способы регуляции транскрипции трансактиватором HIV-1 Tat». IUBMB Life. 51 (3): 175–81. Дои:10.1080/152165401753544241. PMID 11547919. S2CID 10931640.