WikiDer > Протон-зависимый переносчик олигопептидов
| Семья POT | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | PTR2 | ||||||||
| Pfam | PF00854 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR000109 | ||||||||
| PROSITE | PDOC00784 | ||||||||
| TCDB | 2.A.17 | ||||||||
| OPM суперсемейство | 15 | ||||||||
| Белок OPM | 2xut | ||||||||
| |||||||||
Белки Семейство протон-зависимых переносчиков олигопептидов (POT) (также называемый Семейство PTR (пептидный транспорт)) содержатся в животных, растениях, дрожжах, археи и оба Грамотрицательный и Грамположительные бактерии, и являются частью суперсемейство главных фасилитаторов. Транспортировка пептидов в клетки - это хорошо задокументированный биологический феномен, который осуществляется специфическими энергозависимыми переносчиками, обнаруженными у ряда организмов, столь же разнообразных, как бактерии и люди. В протон-зависимый переносчик олигопептидов (PTR) семейство белков отличается от Пептидные переносчики ABC-типа и был обнаружен анализом последовательности ряда недавно открытых белков-переносчиков пептидов.[1] Эти белки, по-видимому, в основном участвуют в поглощении небольших пептидов с сопутствующим захватом протона.[2]
Функция
В то время как большинство членов семейства POT катализируют пептид транспорт, один нитрат пермеаза и можно транспортировать гистидин, а также пептиды. Некоторые переносчики пептидов также могут транспортировать антибиотики. Они работают протонами Симпорт, но подложка: H+ стехиометрия варьируется: носитель PepT2 крысы с высоким сродством катализирует поглощение 2 и 3 H+ с нейтральными и анионными дипептидами, соответственно, в то время как носитель PepT1 с низким сродством катализирует поглощение одного H+ на нейтральный пептид.[3][4]
Транспортная реакция
Обобщенная транспортная реакция, катализируемая белками семейства POT:
подложка (выход) + H (выход) → подложка (вход) H+ (в)
Структура и механизм
Белки имеют длину около 450-600 аминоацильных остатков, при этом эукариотические белки в целом длиннее, чем бактериальные белки. Они показывают 12 предполагаемых или установленных трансмембранные α-спиральные ключи.
Пара соляной мост взаимодействия между трансмембранными спиралями работают в тандеме, чтобы организовать транспорт альтернативного доступа в семействе PTR.[5] Ключевые роли остатков, консервативных между бактериальными и эукариотическими гомологами, предполагают консервативный механизм распознавания и транспорта пептидов, который в некоторых случаях был слегка модифицирован у отдельных видов.
Подсемейства
- Переносчик олигопептидов, пептид: H + симпортер ИнтерПро: IPR004768
- Переносчик аминокислот / пептидов ИнтерПро: IPR005279
Белки человека, содержащие этот домен
FP12591; PEPT1; PTR4; SLC15A1; SLC15A2; SLC15A3; SLC15A4; hPEPT1-RF;
Рекомендации
- ^ Найдер Ф., Беккер Дж. М., Штайнер Х. Ю. (1995). «Семейство PTR: новая группа переносчиков пептидов». Мол. Микробиол. 16 (5): 825–834. Дои:10.1111 / j.1365-2958.1995.tb02310.x. PMID 7476181.
- ^ Скуррей Р.А., Полсен ИТ (1994). «Семейство транспортных белков POT». Trends Biochem. Наука. 19 (10): 404. Дои:10.1016/0968-0004(94)90087-6. PMID 7817396.
- ^ Бакинг, Кэрол; Шульте, Патрисия М. (01.04.2012). «Экологическая и питательная регуляция экспрессии и функции изоформ двух пептидных переносчиков (PepT1) в эвригалинной костистости». Сравнительная биохимия и физиология. Часть A, Молекулярная и интегративная физиология. 161 (4): 379–387. Дои:10.1016 / j.cbpa.2011.12.008. ISSN 1531-4332. PMID 22227314.
- ^ Чен, Син-Чжэнь (29 января 1999 г.). «Стехиометрия и кинетика высокоаффинного H + -связанного пептидного переносчика PepT2». Журнал биологической химии. 274 (5): 2773–2779. Дои:10.1074 / jbc.274.5.2773. PMID 9915809.
- ^ Доки, Синтаро; Kato, Hideaki E .; Солкан, Николае; Иваки, Масайо; Кояма, Мичио; Хаттори, Мотоюки; Ивасе, Норихико; Цукадзаки, Томоя; Сугита, Юджи (09.07.2013). «Структурная основа динамического механизма протон-связанного симпорта пептидного транспортера POT». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 110 (28): 11343–11348. Bibcode:2013PNAS..11011343D. Дои:10.1073 / pnas.1301079110. ISSN 1091-6490. ЧВК 3710879. PMID 23798427.
По состоянию на это редактирование, в этой статье используется контент из «2.A.17 Семейство протон-зависимых переносчиков олигопептидов (POT / PTR)», который лицензирован таким образом, чтобы разрешить повторное использование в соответствии с Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 Непортированная лицензия, но не под GFDL. Все соответствующие условия должны быть соблюдены.
 | Этот мембранный белок–Связанная статья является заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это. |