WikiDer > SLC22A5

SLC22A5
SLC22A5
Идентификаторы
ПсевдонимыSLC22A5, CDSP, OCTN2, семейство переносчиков растворенных веществ 22, член 5
Внешние идентификаторыOMIM: 603377 MGI: 1329012 ГомолоГен: 68295 Генные карты: SLC22A5
Расположение гена (человек)
Хромосома 5 (человек)
Chr.Хромосома 5 (человек)[1]
Хромосома 5 (человек)
Геномное расположение SLC22A5
Геномное расположение SLC22A5
Группа5q31.1Начинать132,369,752 бп[1]
Конец132,395,614 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE SLC22A5 205074 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001308122
NM_003060

NM_011396
NM_001362711
NM_001362712

RefSeq (белок)

NP_001295051
NP_003051

NP_035526
NP_001349640
NP_001349641

Расположение (UCSC)Chr 5: 132,37 - 132,4 МбChr 11: 53,86 - 53,89 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

SLC22A5 это мембранный транспортный белок связана с первичный дефицит карнитина. Этот белок участвует в активном поглощении клетками карнитин. Он действует как сторонник, перемещение натрия ионы и другие органические катионы через мембрану вместе с карнитином. Такой полиспецифический переносчики органических катионов в печени, почках, кишечнике и других органах имеют решающее значение для удаления многих эндогенных малых органических катионов, а также широкого спектра лекарств и токсинов окружающей среды.[5] Мутации в SLC22A5 генная причина системный первичный дефицит карнитина, что может привести к сердечная недостаточность.[6]

Структура

В SLC22A5 ген, содержащий 10 экзонов,[7] расположен на q плече хромосома 5 в позиции 31.1 и охватывает 25 910 пар оснований.[5] Ген производит белок 63 кДа, состоящий из 557 аминокислоты.[8][9] Белок имеет 12 предполагаемых трансмембранные доменыс длинной внеклеточной петлей из 107 аминокислот между первыми двумя трансмембранными доменами и внутриклеточной петлей между четвертым и пятым трансмембранными доменами. Эта длинная внеклеточная петля имеет три потенциальных сайта для N-гликозилирование, а внутриклеточная петля имеет Мотив связывания АТФ / ГТФ. В предполагаемых внутриклеточных доменах есть пять потенциальных сайтов для протеинкиназа С-зависимая фосфорилирование и один для протеинкиназа А-зависимое фосфорилирование.[10]

Функция

В SLC22A5 генные коды для плазмы интегральный мембранный белок который функционирует как переносчик органических катионов и натрий-зависимое высокое сродство карнитин транспортер.[5] Кодируемый белок участвует в активном поглощении клетками карнитина, транспортируя его. ион натрия с одной молекулой карнитина. Органические катионы, переносимые этим белком, включают: тетраэтиламмоний (TEA) без участия натрия. Относительное отношение активности поглощения карнитина к TEA составляет 11,3.[11]

Клиническое значение

Главный фенотипический эффект аутосомно-рецессивных мутаций, либо составной гетерозиготный или же гомозиготный,[6] в SLC22A5 ген системный первичный дефицит карнитина,[7] характеризуется нарушением транспорта карнитина, истощением карнитина в моче, низким уровнем карнитина в сыворотке, сниженным внутриклеточным накоплением карнитина, нарушением бета-окисление, и цитозольный жирная кислота накопление.[6] У пациентов часто наблюдается метаболическая декомпенсация, гипокетотическая гипогликемия, печеночная энцефалопатия, Синдром Рейе, и внезапная смерть младенца в первый год, с последующим наступлением кардиомиопатия или же скелетный миопатия, аритмии, мышечная слабость и сердечная недостаточность в раннем детстве.[6][12][13] Пациенты могут быть бессимптомный, около 70% бессимптомных пациентов имеют миссенс-мутация или же удаление в кадре; бессмысленная мутация частота увеличивается у симптомных пациентов.[14] Симптомы и исход заболевания можно значительно улучшить с помощью заместительной терапии L-карнитином.[15] По оценкам, частота первичного дефицита карнитина у новорожденных составляет около 1 на 40 000.[16]

Взаимодействия

SLC22A5 взаимодействует с ПДЗК1.[11]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000197375 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000018900 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ а б c «Ген Entrez: семейство 22 переносчиков растворенных веществ SLC22A5 (переносчик органических катионов), член 5». Получено 2018-07-25.
  6. ^ а б c d Lahrouchi N, Lodder EM, Mansouri M, Tadros R, Zniber L, Adadi N, Clur SB, van Spaendonck-Zwarts KY, Postma AV, Sefiani A, Ratbi I, Bezzina CR (июнь 2017 г.). «Секвенирование экзома выявляет первичный дефицит карнитина в семье с кардиомиопатией и внезапной смертью». Европейский журнал генетики человека. 25 (6): 783–787. Дои:10.1038 / ejhg.2017.22. ЧВК 5477358. PMID 28295041.
  7. ^ а б Интернет-Менделирующее наследование в человеке, OMIM®. Университет Джона Хопкинса, Балтимор, Мэриленд. Номер MIM: {603377}: {29.04.2015}:. URL-адрес в Интернете: https://omim.org/
  8. ^ Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, Deng N, Kim AK, Choi JH, Zelaya I, Liem D, Meyer D, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J , Дуан Х., Улен М., Йетс Дж. Р., Апвейлер Р., Ге Дж., Хермякоб Х., Пинг П. (октябрь 2013 г.). «Интеграция биологии кардиального протеома и медицины посредством специализированной базы знаний». Циркуляционные исследования. 113 (9): 1043–53. Дои:10.1161 / CIRCRESAHA.113.301151. ЧВК 4076475. PMID 23965338.
  9. ^ "SLC22A5 - Семейство 22 носителей растворенного вещества, член 5". Атлас кардиоорганических белков (COPaKB).
  10. ^ Ву X, Прасад П.Д., Лейбах Ф.Х., Ганапати V (май 1998 г.). «Последовательность кДНК, транспортная функция и геномная организация человеческого OCTN2, нового члена семейства органических переносчиков катионов». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 246 (3): 589–95. Дои:10.1006 / bbrc.1998.8669. PMID 9618255.
  11. ^ а б "SLC22A5 - член 5 семейства 22 носителей растворенного вещества - Homo sapiens (человек) - ген и белок SLC22A5". www.uniprot.org. Получено 2018-07-25.
  12. ^ Йилмаз Т.Ф., Атай М., Топрак Х., Гюлер С., Араласмак А., Алкан А. (10.03.2014). «Результаты МРТ при энцефалопатии с первичным дефицитом карнитина: отчет о болезни». Журнал нейровизуализации. 25 (2): 325–328. Дои:10.1111 / jon.12102. PMID 24612242. S2CID 35640542.
  13. ^ Мадзини М., Тадрос Т., Сивик Д., Джозеф Л., Бристоу М., Цинь Ф., Коэн Р., Монахан К., Кляйн М., Колуччи В. (2011). «Первичный дефицит карнитина и внезапная смерть: доказательства in vivo перекисного окисления липидов миокарда и сульфонилирования кальциевой АТФазы 2 саркоэндоплазматического ретикулума». Кардиология. 120 (1): 52–8. Дои:10.1159/000333127. PMID 22116472. S2CID 207687571.
  14. ^ Юн Я., Ли DH, Ки С.С., Ли С.И., Ким Дж.В., Ли Ю.В., Пак HD (2012). «Мутации SLC22A5 у пациента с системным первичным дефицитом карнитина: первый случай в Корее, подтвержденный биохимическими и молекулярными исследованиями». Анналы клинической и лабораторной науки. 42 (4): 424–8. PMID 23090741.
  15. ^ Агнетти А., Биттон Л., Чана Б., Раймонд А., Карано Н. (январь 2013 г.). «Первичная карнитиновая недостаточность дилатационной кардиомиопатии: наблюдение через 28 лет». Международный журнал кардиологии. 162 (2): e34–5. Дои:10.1016 / j.ijcard.2012.05.038. PMID 22658351.
  16. ^ Коидзуми А., Нодзаки Дж., Охура Т., Кайо Т., Вада Й, Незу Дж., Охаши Р., Тамай И., Сёдзи И., Такада Дж., Кибира С., Мацуиси Т., Цудзи А. (ноябрь 1999 г.). «Генетическая эпидемиология гена транспортера карнитина OCTN2 в японской популяции и фенотипическая характеристика в японских родословных с первичным системным дефицитом карнитина». Молекулярная генетика человека. 8 (12): 2247–54. Дои:10.1093 / hmg / 8.12.2247. PMID 10545605.

дальнейшее чтение

внешняя ссылка

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.