WikiDer > Семейство предшественников микроРНК Мир-34

Mir-34 microRNA precursor family
Семейство предшественников микроРНК mir-34
Структура предшественника MicroRNA-34.svg
Идентификаторы
Символмир-34
РфамRF00456
miRBaseMI0000268
Семейство miRBaseMIPF0000039
Прочие данные
РНК типГен; miRNA
Домен (ы)Эукариоты
ИДТИТермин GO должен начинаться с GO: Термин GO должен начинаться с GO:
ТАКSO: 0001244
PDB структурыPDBe

В miR-34 микроРНК семейство предшественников представляют собой некодирующие молекулы РНК, которые у млекопитающих дают три основных зрелых миРНК. Члены семейства miR-34 были обнаружены вычислительными методами.[1] и позже проверено экспериментально.[2][3] Стволовая петля предшественника miRNA процессируется в цитоплазме клетки, причем преобладающая зрелая последовательность miR-34 вырезается из 5 'плеча заколка для волос.[4]

Семейство миР-34

В млекопитающие, три предшественника miR-34 продуцируются из двух транскрипционных единиц.[5] Предшественник miR-34a человека транскрибируется с хромосомы 1. Предшественники miR-34b и miR-34c совместно транскрибируются из области на хромосоме 11, очевидно, как часть транскрипта, известного как BC021736.

Выражение из MIR34A (ген) у мышей наблюдается во всех исследованных тканях, но выше всего в головном мозге. miR-34b и -c относительно менее распространены в большинстве тканей, но являются преобладающими видами miR-34 в легких.[5] Присутствие продуктов miR-34 также было подтверждено в эмбриональные стволовые клетки. miR-34 передается по материнской линии в Дрозофила и рыбок данио, и потеря miR-34 приводит к дефектам в развитии заднего мозга у эмбрионов рыбок данио. Это было первое сообщение о фенотипе нокдауна miR-34 в любом модельном организме, хотя фенотип наблюдался только примерно у 30% эмбрионов рыбок данио.[6]

Мишени miR-34

Ямакучи и другие.. показали, что miR-34a нацелен на тихий регулятор информации 1 (SIRT1) ген:[7]

«Ингибирование miR-34 SIRT1 приводит к увеличению ацетилированного p53 и экспрессии p21 и PUMA, транскрипционных мишеней p53, которые регулируют клеточный цикл и апоптоз, соответственно. Кроме того, подавление miR-34 SIRT1 в конечном итоге приводит к апоптозу у людей WT. клеток рака толстой кишки, но не в клетках рака толстой кишки человека, лишенных p53. Наконец, miR-34a сама по себе является мишенью для транскрипции p53, что позволяет предположить положительный отзыв петля между p53 и miR-34a. Таким образом, miR-34a действует как опухолевый супрессор, частично через путь SIRT1-p53 ».[7]

Недавно Количественная протеомика – СИЛАК подход был использован для идентификации мишеней miR-34a на уровне генома в Клетки HEK293T.[8]

Мир-34 подавляет опухолевые сферы человеческого мутантного p53 рака желудка

p53-дефицитные клетки рака желудка человека, восстановление функциональной miR-34 подавляет рост клеток и вызывает хемосенсибилизацию и апоптоз, что указывает на то, что miR-34 может восстанавливать функцию p53. Восстановление miR-34 ингибирует образование и рост опухолевых сфер, что, как сообщается, коррелирует с самообновлением раковых стволовых клеток. Механизм опосредованного miR-34 подавления самообновления, по-видимому, связан с прямой модуляцией последующих мишеней Bcl-2, Notch и HMGA2, что указывает на то, что miR-34 может участвовать в самообновлении стволовых клеток рака желудка / дифференциация принятия решений.[9][10] miR-34c также был связан с развитием костей и раком костей.[11]

Рекомендации

  1. ^ Lim LP, Glasner ME, Yekta S, Burge CB, Bartel DP (март 2003 г.). «Гены микроРНК позвоночных». Наука. 299 (5612): 1540. Дои:10.1126 / science.1080372. PMID 12624257.
  2. ^ Dostie J, Mourelatos Z, Yang M, Sharma A, Dreyfuss G (февраль 2003 г.). «Многочисленные микроРНП в нейрональных клетках, содержащих новые микроРНК». РНК. 9 (2): 180–6. Дои:10.1261 / rna.2141503. ЧВК 1370383. PMID 12554860.
  3. ^ Houbaviy HB, Мюррей MF, Sharp PA (август 2003 г.). «МикроРНК, специфичные для эмбриональных стволовых клеток». Клетка развития. 5 (2): 351–8. Дои:10.1016 / S1534-5807 (03) 00227-2. PMID 12919684.
  4. ^ He L, He X, Lim LP, de Stanchina E, Xuan Z, Liang Y, Xue W, Zender L, Magnus J, Ridzon D, Jackson AL, Linsley PS, Chen C, Lowe SW, Cleary MA, Hannon GJ (июн. 2007). «Компонент микроРНК в супрессорной сети p53». Природа. 447 (7148): 1130–4. Дои:10.1038 / природа05939. ЧВК 4590999. PMID 17554337.
  5. ^ а б Hermeking H (февраль 2010 г.). «Семейство miR-34 при раке и апоптозе». Гибель клеток и дифференциация. 17 (2): 193–9. Дои:10.1038 / cdd.2009.56. PMID 19461653.
  6. ^ Сони К., Чоудхари А., Патовари А., Сингх А. Р., Бхатиа С., Шивасуббу С., Чандрасекаран С., Пиллай Б. (апрель 2013 г.). «miR-34 передается по материнской линии у Drosophila melanogaster и Danio rerio». Исследования нуклеиновых кислот. 41 (8): 4470–80. Дои:10.1093 / nar / gkt139. ЧВК 3632126. PMID 23470996.
  7. ^ а б Ямакучи М., Ферлито М., Левенштейн С.Дж. (сентябрь 2008 г.). "miR-34a репрессия SIRT1 регулирует апоптоз". Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 105 (36): 13421–6. Дои:10.1073 / pnas.0801613105. ЧВК 2533205. PMID 18755897.
  8. ^ Баргадже Р., Гупта С., Саркешик А., Парк Р., Сюй Т., Саркар М., Халимани М., Рой С.С., Йетс Дж., Пиллай Б. (2012). «Идентификация новых мишеней для miR-29a с использованием протеомики miRNA». PLOS ONE. 7 (8): e43243. Дои:10.1371 / journal.pone.0043243. ЧВК 3428309. PMID 22952654.
  9. ^ Джи Кью, Хао Х, Мэн Й, Чжан М., Десано Дж, Фань Д. и др. (2008). «Восстановление опухолевого супрессора miR-34 ингибирует человеческие p53-мутантные опухоли рака желудка». BMC Рак. 8: 266. Дои:10.1186/1471-2407-8-266. ЧВК 2564978. PMID 18803879.
  10. ^ Путь Мир-34 и р53
  11. ^ Пэ И, Ян Т., Цзэн Х.С., Кампо ПМ, Чен И, Бертин Т., Доусон BC, Мунивес Э., Тао Дж., Ли Б.Х. (июль 2012 г.). «miRNA-34c регулирует передачу сигналов Notch во время развития костей». Молекулярная генетика человека. 21 (13): 2991–3000. Дои:10.1093 / hmg / dds129. ЧВК 3373245. PMID 22498974.

внешняя ссылка