WikiDer > ATF5 - Википедия

ATF5
Идентификаторы
Псевдонимы	ATF5, ATFX, HMFN0395, активирующий фактор транскрипции 5
Внешние идентификаторы	OMIM: 606398 MGI: 2141857 ГомолоГен: 32142 Генные карты: ATF5
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 19 (человек)
Конец	49,933,935 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 7 (мышь)
Конец	44,816,658 бп
Экспрессия РНК шаблон
	; ;
	Дополнительные данные эталонного выражения
Онтология генов
Молекулярная функция	• последовательное связывание ДНК; • Связывание ДНК; • Связывание ДНК, специфичное для последовательности регуляторной области РНК-полимеразы II; • GO: 0001106 транскрипционная корепрессорная активность; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции; • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Активность ДНК-связывающего активатора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II; • связывание хроматина; • связывание тубулина; • связывание киназы; • GO: 0001948 связывание с белками; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II;
Сотовый компонент	• центросома; • комплекс регуляторов транскрипции; • нуклеоплазма; • центр организации микротрубочек; • цитоскелет; • ядро клетки; • цитоплазма; • цитозоль;
Биологический процесс	• отрицательная регуляция клеточного цикла фазового перехода G2 / M; • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон; • дифференцировка интернейронов обонятельной луковицы; • рост многоклеточного организма; • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II; • отрицательная регуляция апоптотического процесса; • постэмбриональное развитие; • транскрипция, ДНК-шаблон; • пролиферация предшественников гранулярных клеток мозжечка; • положительная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон; • регуляция центросомного цикла; • циркадный ритм; • развитие интернейронов обонятельной луковицы; • регуляция экспрессии генов; • развитие обонятельной доли; • отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон; • дифференцировка жировых клеток; • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II; • отрицательное регулирование пролиферации клеток; • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	22809
	107503
	ENSG00000169136
	ENSMUSG00000038539
	Q9Y2D1
	O70191
	NM_001193646; NM_001290746; NM_012068
	NM_030693
	NP_001180575; NP_001277675; NP_036200
	NP_109618
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

ATF5 - Wikipedia

Активация фактора транскрипции 5, также известный как ATF5, это белок что у людей кодируется ATF5 ген.^[5]

Функция

Впервые описано Нисидзавой и Нагатой,^[6] ATF5 был классифицирован как член активирующего фактора транскрипции (ATF) / белок, связывающий элемент ответа цАМФ (CREB) семья.^[7]^[8]

Транскрипты и белок ATF5 экспрессируются в самых разных тканях, в частности, высокая экспрессия транскриптов в печени. Он также присутствует в различных типах опухолевых клеток.

Экспрессия ATF5 регулируется как на уровне транскрипции, так и на уровне трансляции.

ATF5 экспрессируется в VZ и SVZ во время развития мозга.

Белок ATF5 человека состоит из 282 аминокислот.

ATF5 - это фактор транскрипции, содержащий домен bZip.

Смотрите также

Активирующий фактор транскрипции

Взаимодействия

ATF5 показал взаимодействовать с ДИСК1^[9] и TRIB3.^[10]

дальнейшее чтение

Пати Д., Мейстрих М.Л., Плон С.Е. (1999). «Человеческие Cdc34 и Rad6B убиквитин-конъюгированные ферменты нацелены на репрессоры циклической AMP-индуцированной транскрипции для протеолиза». Мол. Клетка. Биол. 19 (7): 5001–13. Дои:10.1128 / mcb.19.7.5001. ЧВК 84326. PMID 10373550.
White JH, McIllhinney RA, Wise A, Ciruela F, Chan WY, Emson PC, Billinton A, Marshall FH (2001). «Рецептор GABAB напрямую взаимодействует с родственными факторами транскрипции CREB2 и ATFx». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 97 (25): 13967–13972. Дои:10.1073 / pnas.240452197. ЧВК 17684. PMID 11087824.
Питерс С.С., Лян Х, Ли С., Каннан С., Пэн И, Тауб Р., Даймонд Р.Х. (2001). «ATF-7, новый белок bZIP, взаимодействует с протеинтирозинфосфатазой PRL-1». J. Biol. Chem. 276 (17): 13718–26. Дои:10.1074 / jbc.M011562200. PMID 11278933.
Моррис Дж. А., Кандпал Г., Ма Л., Остин С. П. (2004). «DISC1 (Disrupted-In-Schizophrenia 1) представляет собой связанный с центросомами белок, который взаимодействует с MAP1A, MIPT3, ATF4 / 5 и NUDEL: регуляция и потеря взаимодействия с мутацией». Гм. Мол. Genet. 12 (13): 1591–1608. Дои:10.1093 / hmg / ddg162. PMID 12812986.
Ямада С, Охира М, Хорие Х, Андо К., Такаясу Х, Сузуки Й, Сугано С, Хирата Т, Гото Т, Мацунага Т, Хияма Э, Хаяси Й, Андо Х, Суита С, Канеко М, Сасаки Ф, Хашизуме К. , Охнума Н., Накагавара А. (2004). «Профилирование экспрессии и дифференциальный скрининг между гепатобластомами и соответствующей нормальной печенью: идентификация высокой экспрессии онкогена PLK1 как плохого прогностического индикатора гепатобластом». Онкоген. 23 (35): 5901–5911. Дои:10.1038 / sj.onc.1207782. PMID 15221005.
Лю В., Сун М., Цзян Дж., Шен Х, Сун Цюй, Лю В., Шен Х, Гу Дж. (2004). «Циклин D3 взаимодействует с человеческим активирующим фактором транскрипции 5 и усиливает его транскрипционную активность». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 321 (4): 954–960. Дои:10.1016 / j.bbrc.2004.07.053. PMID 15358120.
Форгакс Э., Гупта СК, Керри Дж. А., Семмес О. Дж. (2005). «Фактор транскрипции bZIP ATFx связывает Tax вируса Т-клеточного лейкоза типа 1 (HTLV-1) и подавляет транскрипцию, опосредованную длинным концевым повтором HTLV-1». Дж. Вирол. 79 (11): 6932–6939. Дои:10.1128 / JVI.79.11.6932-6939.2005. ЧВК 1112100. PMID 15890932.
Аль Саррадж Дж, Винсон С., Тиль Дж. (2005). «Регулирование транскрипции гена аспарагинсинтетазы с помощью основных факторов транскрипции лейциновой молнии ATF5 и CHOP». Биол. Chem. 386 (9): 873–879. Дои:10.1515 / BC.2005.102. PMID 16164412. S2CID 24061972.
Angelastro JM, Canoll PD, Kuo J, Weicker M, Costa A, Bruce JN, Greene LA (2006). «Селективное разрушение клеток глиобластомы путем вмешательства в активность или экспрессию ATF5». Онкоген. 25 (6): 907–916. Дои:10.1038 / sj.onc.1209116. PMID 16170340.
Вэй И, Цзян Дж, Сун М., Чен Х, Ван Х, Гу Дж (2006). «ATF5 увеличивает индуцированный цисплатином апоптоз за счет повышения регуляции транскрипции циклина D3 в клетках HeLa». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 339 (2): 591–596. Дои:10.1016 / j.bbrc.2005.11.054. PMID 16300731.
Какиучи К., Исивата М., Нанко С., Кунуги Х., Минабе Й, Накамура К., Мори Н., Фуджи К., Ямада К., Йошикава Т., Като Т. (2007). «Анализ ассоциации ATF4 и ATF5, генов взаимодействующих белков DISC1, при биполярном расстройстве». Neurosci. Латыш. 417 (3): 316–321. Дои:10.1016 / j.neulet.2007.02.054. PMID 17346882. S2CID 7488805.
Вататани Ю., Итикава К., Наканиси Н., Фудзимото М., Такеда Н., Кимура Н., Хиросе Н., Такахаши С., Такахаши Ю. (2008). «Стресс-индуцированная трансляция мРНК ATF5 регулируется 5'-нетранслируемой областью». J. Biol. Chem. 283 (5): 2543–2553. Дои:10.1074 / jbc.M707781200. PMID 18055463.

внешняя ссылка

ATF5 + белок, + человеческий в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)
Человек ATF5 расположение генома и ATF5 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.

Эта статья о ген на хромосома человека 19 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000169136 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000038539 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[entrez-5] «Ген Entrez: ATF5, активирующий фактор транскрипции 5».

[pmid10373550-6] Пати Д., Мейстрих М.Л., Плон С.Е. (июль 1999 г.). «Человеческие Cdc34 и Rad6B убиквитин-конъюгированные ферменты нацелены на репрессоры циклической AMP-индуцированной транскрипции для протеолиза». Мол. Клетка. Биол. 19 (7): 5001–13. Дои:10.1128 / mcb.19.7.5001. ЧВК 84326. PMID 10373550.

[pmid11483355-7] Хай Т., Хартман М.Г. (июль 2001 г.). «Молекулярная биология и номенклатура активирующего фактора транскрипции / cAMP-чувствительного элемента связывающего семейства факторов транскрипции: активирующие белки фактора транскрипции и гомеостаз». Ген. 273 (1): 1–11. Дои:10.1016 / S0378-1119 (01) 00551-0. PMID 11483355.

[pmid12192032-8] Винсон С., Мякишев М., Ачарья А., Мир А.А., Молл Дж. Р., Бонович М. (сентябрь 2002 г.). «Классификация белков B-ZIP человека на основе свойств димеризации». Мол. Клетка. Биол. 22 (18): 6321–6335. Дои:10.1128 / MCB.22.18.6321-6335.2002. ЧВК 135624. PMID 12192032.

[pmid12812986-9] Моррис Дж. А., Кандпал Г., Ма Л., Остин С. П. (июль 2003 г.). «DISC1 (Disrupted-In-Schizophrenia 1) представляет собой связанный с центросомами белок, который взаимодействует с MAP1A, MIPT3, ATF4 / 5 и NUDEL: регуляция и потеря взаимодействия с мутацией». Гм. Мол. Genet. 12 (13): 1591–1608. Дои:10.1093 / hmg / ddg162. PMID 12812986.

[pmid18276110-10] Чжоу Ю., Ли Л., Лю Цюй, Син Г, Куай Х, Сунь Дж, Инь Х, Ван Дж, Чжан Л., Хэ Ф (май 2008 г.). «Убиквитинлигаза E3 SIAH1 опосредует убиквитинирование и деградацию TRB3». Клетка. Сигнал. 20 (5): 942–948. Дои:10.1016 / j.cellsig.2008.01.010. PMID 18276110.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

Navigation