WikiDer > HMGA1
Белок группы высокой подвижности HMG-I / HMG-Y это белок что у людей кодируется HMGA1 ген.[5][6]
Функция
Этот ген кодирует негистоновый белок хроматина, участвующий во многих клеточных процессах, включая регуляцию транскрипции индуцибельных генов, репликацию ДНК, гетерохроматин организация интеграция ретровирусов в хромосомы и метастатическое прогрессирование раковых клеток.
Белки HMGA1 - это довольно маленькие (~ 10-12 кДа) и основные молекулы, состоящие из трех AT-крючки с ядром RGRP (Arg-Gly-Arg-Pro) мотив, Роман сшивание домен, расположенный между вторым и третьим AT-хуком, и C-терминал кислотный хвост характерен для HMG семейство, включающее белки HMGA, HMGB и HMGN.
Слитые белки HMGA1-GFP обладают высокой динамикой in vivo (определено с использованием FRAP анализ), но, напротив, также демонстрируют наномолярное сродство к AT-богатой ДНК in vitro (определено биохимически), что можно объяснить обширным посттранскрипционные модификации in vivo. HMGA1 предпочтительно связывается с малой бороздкой АТ-богатых областей в двухцепочечной ДНК с помощью своих АТ-крючков. Он имеет небольшую вторичную структуру в растворе, но принимает различные конформации при связывании с субстратами, такими как ДНК или другие белки. Белки HMGA1 содержат большое количество разнообразных посттрансляционные модификации и расположены в основном в ядре, особенно в гетерохроматине, но также в митохондриях и цитоплазме.
Недавно было показано, что белки HMGA1, HMGA1a и HMGA1b, могут сшивать волокна ДНК. in vitro и может вызывать кластеризацию хроматина in vivo предполагая структурную роль белков HMGA1 в организации гетерохроматина.[7]
Для этого гена обнаружено по крайней мере семь вариантов транскрипта, кодирующих две разные изоформы (HMGA1a, HMGA1b).[8] Вариант сплайсинга HMGA1c только с двумя AT-крючками и без кислотного хвоста обсуждается как настоящий член семейства HMGA.
Мыши, лишенные своего варианта HMGA1, т.е. Hmga1 - / - мыши диабетик, демонстрируют гипертрофию сердца и выражают низкий уровень рецептор инсулина.[9]
Взаимодействия
Было показано, что HMGA1 взаимодействовать с CEBPB[10] и Фактор транскрипции Sp1.[10]
Смотрите также
Рекомендации
- ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000137309 - Ансамбль, Май 2017
- ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000046711 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ Friedmann M, Holth LT, Zoghbi HY, Reeves R (сентябрь 1993 г.). «Организация, индуцибельная экспрессия и хромосомная локализация гена негистонового белка HMG-I (Y) человека». Исследования нуклеиновых кислот. 21 (18): 4259–67. Дои:10.1093 / nar / 21.18.4259. ЧВК 310059. PMID 8414980.
- ^ Ривз Р., Беккербауэр Л. (май 2001 г.). «Белки HMGI / Y: гибкие регуляторы транскрипции и структуры хроматина». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Структура и экспрессия гена. 1519 (1–2): 13–29. Дои:10.1016 / S0167-4781 (01) 00215-9. PMID 11406267.
- ^ Фогель Б., Лёшбергер А., Зауэр М., Хок Р. (сентябрь 2011 г.). «Поперечное сшивание ДНК через HMGA1 предполагает наличие каркаса ДНК». Исследования нуклеиновых кислот. 39 (16): 7124–33. Дои:10.1093 / nar / gkr396. ЧВК 3167630. PMID 21596776.
- ^ "Entrez Gene: HMGA1 группа высокой мобильности AT-hook 1".
- ^ Семпл РК (2009). «От искажения ДНК до диабета: любопытный случай HMGA1». Журнал биологии. 8 (7): 64. Дои:10.1186 / jbiol164. ЧВК 2736670. PMID 19664187.
- ^ а б Фоти Д., Юлиано Р., Чифнари Е., Брунетти А. (апрель 2003 г.). «Нуклеопротеидный комплекс, содержащий Sp1, C / EBP бета и HMGI-Y, контролирует транскрипцию гена рецептора человеческого инсулина». Молекулярная и клеточная биология. 23 (8): 2720–32. Дои:10.1128 / MCB.23.8.2720-2732.2003. ЧВК 152545. PMID 12665574.
дальнейшее чтение
- Хуэй Х., Перфетти Р. (февраль 2002 г.). «Гомеобокс-1 поджелудочной железы двенадцатиперстной кишки регулирует развитие поджелудочной железы во время эмбриогенеза и функцию островковых клеток в зрелом возрасте». Европейский журнал эндокринологии. 146 (2): 129–41. Дои:10.1530 / eje.0.1460129. PMID 11834421.
- Ван Маэле Б., Дебизер З. (2005). «Интеграция ВИЧ-1: взаимодействие интегразы ВИЧ-1, клеточных и вирусных белков». Обзоры СПИДа. 7 (1): 26–43. PMID 15875659.
- Ван Маэле Б., Бусшотс К., Вандекеркхове Л., Христос Ф., Дебизер З. (февраль 2006 г.). «Клеточные кофакторы интеграции ВИЧ-1». Тенденции в биохимических науках. 31 (2): 98–105. Дои:10.1016 / j.tibs.2005.12.002. PMID 16403635.
- Ривз Р., Ниссен М.С. (май 1990 г.). «A.T-ДНК-связывающий домен хромосомных белков группы I с высокой подвижностью млекопитающих. Новый пептидный мотив для распознавания структуры ДНК». Журнал биологической химии. 265 (15): 8573–82. PMID 1692833.
- Ниссен М.С., Ланган Т.А., Ривз Р. (октябрь 1991 г.). «Фосфорилирование киназой cdc2 модулирует ДНК-связывающую активность негистонового белка хроматина группы I с высокой подвижностью». Журнал биологической химии. 266 (30): 19945–52. PMID 1939057.
- Экнер Р., Бирнштиль М.Л. (август 1989 г.). «Клонирование кДНК, кодирующих человеческие белки HMG I и HMG Y: оба способны связываться с мотивом последовательности октамера». Исследования нуклеиновых кислот. 17 (15): 5947–59. Дои:10.1093 / nar / 17.15.5947. ЧВК 318252. PMID 2505228.
- Джонсон К. Р., Лен Д. А., Ривз Р. (май 1989 г.). «Альтернативный процессинг мРНК, кодирующих белки хромосомных высокоподвижных групп млекопитающих HMG-I и HMG-Y». Молекулярная и клеточная биология. 9 (5): 2114–23. Дои:10.1128 / mcb.9.5.2114. ЧВК 363005. PMID 2701943.
- Палвимо Дж., Линнала-Канккунен А. (октябрь 1989 г.). «Идентификация сайтов на хромосомном белке HMG-I, фосфорилированном казеинкиназой II». Письма FEBS. 257 (1): 101–4. Дои:10.1016 / 0014-5793 (89) 81796-X. PMID 2806554. S2CID 7960951.
- Карлсон Дж. Р., Мёрк Э., Холтлунд Дж., Лаланд С. Г., Лунд Т. (февраль 1989 г.). «Аминокислотная последовательность хромосомного белка HMG-Y, ее отношение к HMG-I и возможные домены для предпочтительного связывания белков с участками пар оснований A-T». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 158 (3): 646–51. Дои:10.1016 / 0006-291X (89) 92770-8. PMID 2920035.
- Lund T, Dahl KH, Mørk E, Holtlund J, Laland SG (июль 1987 г.). «Хромосомный белок человека HMG I содержит две идентичные аминокислотные последовательности палиндрома». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 146 (2): 725–30. Дои:10.1016 / 0006-291X (87) 90589-4. PMID 3619901.
- Leger H, Sock E, Renner K, Grummt F, Wegner M (июль 1995 г.). «Функциональное взаимодействие между белком домена POU Tst-1 / Oct-6 и белком группы высокой подвижности HMG-I / Y». Молекулярная и клеточная биология. 15 (7): 3738–47. Дои:10.1128 / mcb.15.7.3738. ЧВК 230612. PMID 7791781.
- Джон С., Ривз Р. Б., Лин Дж. Х., Чайлд Р., Лейден Дж. М., Томпсон С. Б., Леонард В. Дж. (Март 1995 г.). «Регулирование экспрессии гена альфа-цепи рецептора интерлейкина-2, специфичного для клеточного типа: потенциальная роль физических взаимодействий между Elf-1, HMG-I (Y) и белками семейства NF-каппа B». Молекулярная и клеточная биология. 15 (3): 1786–96. Дои:10.1128 / mcb.15.3.1786. ЧВК 230403. PMID 7862168.
- Фарнет К.М., Бушменский федеральный округ (февраль 1997 г.). «Интеграция кДНК ВИЧ-1: потребность в белке HMG I (Y) для функционирования прединтеграционных комплексов in vitro». Клетка. 88 (4): 483–92. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 81888-7. PMID 9038339. S2CID 14476092.
- Миллер, доктор медицины, Фарнет К.М., Бушман, федеральный округ (июль 1997 г.). «Преинтеграционные комплексы вируса иммунодефицита человека 1 типа: исследования организации и состава». Журнал вирусологии. 71 (7): 5382–90. Дои:10.1128 / JVI.71.7.5382-5390.1997. ЧВК 191777. PMID 9188609.
- Huth JR, Bewley CA, Nissen MS, Evans JN, Reeves R, Gronenborn AM, Clore GM (август 1997 г.). «Структура раствора комплекса HMG-I (Y) -DNA определяет новый архитектурный мотив связывания малых бороздок». Структурная биология природы. 4 (8): 657–65. Дои:10.1038 / nsb0897-657. PMID 9253416. S2CID 2183841.
- Карри Р.А. (декабрь 1997 г.). «Функциональное взаимодействие между доменом тримеризации ДНК-связывающей субъединицы NF-Y и белком группы высокой подвижности HMG-I (Y)». Журнал биологической химии. 272 (49): 30880–8. Дои:10.1074 / jbc.272.49.30880. PMID 9388234.
- Чин М. Т., Пеллакани А., Ван Х, Лин С. С., Джайн М. К., Перрелла М. А., Ли МЭ (апрель 1998 г.). «Усиление транскрипции, зависящей от сывороточного фактора ответа, и связывания ДНК с помощью архитектурного фактора транскрипции HMG-I (Y)». Журнал биологической химии. 273 (16): 9755–60. Дои:10.1074 / jbc.273.16.9755. PMID 9545312.
- Chiappetta G, Tallini G, De Biasio MC, Manfioletti G, Martinez-Tello FJ, Pentimalli F, de Nigris F, Mastro A, Botti G, Fedele M, Berger N, Santoro M, Giancotti V, Fusco A (сентябрь 1998 г.). «Обнаружение белка HMGI (Y) группы I с высокой подвижностью в диагностике опухолей щитовидной железы: экспрессия HMGI (Y) представляет собой потенциальный диагностический индикатор карциномы». Исследования рака. 58 (18): 4193–8. PMID 9751634.
- Фогель Б., Лёшбергер А., Зауэр М., Хок Р. (сентябрь 2011 г.). «Поперечное сшивание ДНК через HMGA1 предполагает наличие каркаса ДНК». Исследования нуклеиновых кислот. 39 (16): 7124–33. Дои:10.1093 / nar / gkr396. ЧВК 3167630. PMID 21596776.
внешняя ссылка
- HMGA1 + белок, + человеческий в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)
- Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: P17096 (Белок группы высокой подвижности HMG-I / HMG-Y) на PDBe-KB.
Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.