WikiDer > PAX5 - Википедия

PAX5
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	1К78, 1MDM
Идентификаторы
Псевдонимы	PAX5, ALL3, BSAP, парный бокс 5
Внешние идентификаторы	OMIM: 167414 MGI: 97489 ГомолоГен: 56419 Генные карты: PAX5
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 9 (человек)
Конец	37,034,268 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 4 (мышь)
Конец	44,710,487 бп
Экспрессия РНК шаблон
	; ;
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• Связывание ДНК; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции; • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Активность ДНК-связывающего активатора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II; • GO: 0000980 Связывание ДНК, специфичное для последовательности цис-регуляторной области РНК-полимеразы II; • GO: 0001948 связывание с белками; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II;
Сотовый компонент	• ядро клетки; • фибриллярный центр; • цитозоль; • внутриклеточная мембраносвязанная органелла; • нуклеоплазма;
Биологический процесс	• дифференциация клеток; • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон; • развитие бокового желудочка; • старение; • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II; • транскрипция, ДНК-шаблон; • развитие нервной системы; • развитие многоклеточного организма; • поведение взрослых; • гуморальный иммунный ответ; • сперматогенез; • отрицательная регуляция метилирования гистона H3-K9; • развитие коры головного мозга; • морфогенез органов животных; • дифференциация клеток скелетных мышц; • морфогенез эмбрионального черепного скелета; • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II; • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II; • регуляция сигнального пути рецептора В-клеток;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	5079
	18507
	ENSG00000196092
	ENSMUSG00000014030
	Q02548
	Q02650
NM_001280547; NM_001280548; NM_001280549; NM_001280550; NM_001280551;
	NM_001280552; NM_001280553; NM_001280554; NM_001280555; NM_001280556; NM_016734
	NM_008782
NP_001267476; NP_001267477; NP_001267478; NP_001267479; NP_001267480;
	NP_001267481; NP_001267482; NP_001267483; NP_001267484; NP_001267485; NP_057953; NP_001267480.1
	NP_032808
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

PAX5 - Wikipedia

Парный коробчатый протеин Pax-5 это белок что у людей кодируется PAX5 ген.^[5]^[6]^[7]

Функция

Ген PAX5 является членом парный бокс (PAX) семейство факторов транскрипции. Центральным признаком этого семейства генов является новый, высококонсервативный ДНК-связывающий домен, известный как парная коробка. Белки PAX являются важными регуляторами на раннем этапе развития, и считается, что изменения в экспрессии их генов способствуют неопластическая трансформация. Ген PAX5 кодирует В-клетка белок-активатор, специфичный для клонов (BSAP), который экспрессируется на ранних, но не на поздних стадиях дифференцировки B-клеток. Его экспрессия также была обнаружена в развивающихся ЦНС и семенниках, поэтому продукт гена PAX5 может играть важную роль не только в дифференцировке В-клеток, но также в нервном развитии и сперматогенез.^[7]

Клиническое значение

Ген PAX5 расположен в районе хромосомы 9p13, который участвует в транслокациях t (9; 14) (p13; q32), повторяющихся в небольших лимфоцитарные лимфомы из плазмацитоид подтипа и в производных крупноклеточных лимфомах. Эта транслокация приносит мощный усилитель E-mu Локус гена IgH в непосредственной близости от промоторов PAX5, предполагая, что нарушение регуляции транскрипции гена PAX5 способствует патогенез этих лимфом.^[7]

До 97% Клетки Рида-Штернберга из Лимфома Ходжкина экспресс Pax-5.^[8]

Взаимодействия

PAX5 был показан взаимодействовать с TLE4^[9]^[10] и Связанный со смертью белок 6.^[11]

Смотрите также

Гены pax

дальнейшее чтение

Хагман Дж., Пшеничный В., Фитцсиммонс Д., Ходсдон В., Негри Дж., Дизон Ф. (1999). «Pax-5 / BSAP: регулятор специфической экспрессии и дифференцировки генов в B-лимфоцитах». Актуальные темы микробиологии и иммунологии. 245 (1): 169–94. Дои:10.1007/978-3-642-57066-7_5. ISBN 978-3-642-63017-0. PMID 10533313.
Calame KL, Lin KI, Tunyaplin C (2003). «Регуляторные механизмы, определяющие развитие и функцию плазматических клеток». Ежегодный обзор иммунологии. 21: 205–30. Дои:10.1146 / annurev.immunol.21.120601.141138. PMID 12524387.
Carotta S, Holmes ML, Pridans C, Nutt SL (ноябрь 2006 г.). «Pax5 поддерживает клеточную идентичность, подавляя экспрессию генов на протяжении дифференцировки В-клеток». Клеточный цикл. 5 (21): 2452–6. Дои:10.4161 / cc.5.21.3396. PMID 17102626.
Стэплтон П., Вейт А., Урбанек П., Козмик З., Басслингер М. (апрель 1993 г.). «Хромосомная локализация семи генов PAX и клонирование нового члена семьи, PAX-9». Природа Генетика. 3 (4): 292–8. Дои:10.1038 / ng0493-292. PMID 7981748. S2CID 21338655.
Busslinger M, Klix N, Pfeffer P, Graninger PG, Kozmik Z (июнь 1996 г.). «Нарушение регуляции PAX-5 путем транслокации энхансера Emu локуса IgH рядом с двумя альтернативными промоторами PAX-5 в диффузной крупноклеточной лимфоме». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 93 (12): 6129–34. Bibcode:1996PNAS ... 93.6129B. Дои:10.1073 / пнас.93.12.6129. ЧВК 39201. PMID 8650231.
Iida S, Rao PH, Nallasivam P, Hibshoosh H, Butler M, Louie DC, Dyomin V, Ohno H, Chaganti RS, Dalla-Favera R (декабрь 1996 г.). «Хромосомная транслокация t (9; 14) (p13; q32), связанная с лимфоплазмацитоидной лимфомой, включает ген PAX-5». Кровь. 88 (11): 4110–7. Дои:10.1182 / кровь.V88.11.4110.4110. PMID 8943844.
Канеко Х., Ариясу Т., Иноуэ Р., Фукао Т., Касахара К., Терамото Т., Мацуи Е., Хаякава С., Кондо Н. (февраль 1998 г.). «Экспрессия гена Pax5 в гемопоэтических клетках и тканях человека: сравнение с иммунодефицитными донорами». Клиническая и экспериментальная иммунология. 111 (2): 339–44. Дои:10.1046 / j.1365-2249.1998.00509.x. ЧВК 1904901. PMID 9486401.
Веркоци Л.К., Беринштейн Н.Л. (октябрь 1998 г.). «Выделение генов, отрицательно или положительно коэкспрессированных с геном 1 активации рекомбинации человека (RAG1), с помощью ПЦР с дифференциальным дисплеем (DD RT-PCR)». Исследования нуклеиновых кислот. 26 (19): 4497–507. Дои:10.1093 / nar / 26.19.4497. ЧВК 147860. PMID 9742255.
Пшеница У., Фицсиммонс Д., Леннокс Х., Крауткрамер С.Р., Джентиле Л.Н., Макинтош Л.П., Хагман Дж. (Март 1999 г.). «Высококонсервативная бета-шпилька парного ДНК-связывающего домена необходима для сборки тройных комплексов Pax-Ets». Молекулярная и клеточная биология. 19 (3): 2231–41. Дои:10.1128 / mcb.19.3.2231. ЧВК 84016. PMID 10022910.
Эберхард Д., Басслингер М. (апрель 1999 г.). «Частичный гомеодомен фактора транскрипции Pax-5 (BSAP) является мотивом взаимодействия ретинобластомы и TATA-связывающих белков». Исследования рака. 59 (7 Прил.): 1716–1724 гг., Обсуждение 1724–1725 гг. PMID 10197586.
Либерманн Т.А., Пан З., Акбарали Ю., Хетерингтон С.Дж., Болтакс Дж., Йерго Д.А., Чжан Д.Е. (август 1999 г.). «AML1 (CBFalpha2) взаимодействует со специфическим для В-клеток активирующим белком (BSAP / PAX5) при активации промотора гена BLK, специфичного для В-клеток». Журнал биологической химии. 274 (35): 24671–6. Дои:10.1074 / jbc.274.35.24671. PMID 10455134.
Nutt SL, Heavey B, Rolink AG, Busslinger M (октябрь 1999 г.). «Приверженность к B-лимфоидной линии зависит от фактора транскрипции Pax5». Природа. 401 (6753): 556–62. Bibcode:1999Натура.401..556Н. Дои:10.1038/44076. PMID 10524622. S2CID 4414876.
Rolink AG, Nutt SL, Melchers F, Busslinger M (октябрь 1999 г.). «Долгосрочное восстановление развития Т-клеток in vivo с помощью Pax5-дефицитных предшественников В-клеток». Природа. 401 (6753): 603–6. Bibcode:1999Натура.401..603Р. Дои:10.1038/44164. PMID 10524629. S2CID 12257992.
Ковач Ч.Р., Емельянов А., Сингх М., Ашуян Н., Бирштейн Б.К. (июнь 2000 г.). «Взаимодействие BSAP (Pax5) -импортин альфа 1 (Rch1) идентифицирует последовательность ядерной локализации». Журнал биологической химии. 275 (22): 16752–7. Дои:10.1074 / jbc.M001551200. PMID 10748034.
Эберхард Д., Хименес Г., Хивей Б., Басслингер М. (май 2000 г.). «Репрессия транскрипции с помощью Pax5 (BSAP) посредством взаимодействия с корепрессорами семейства Граучо». Журнал EMBO. 19 (10): 2292–303. Дои:10.1093 / emboj / 19.10.2292. ЧВК 384353. PMID 10811620.
Робертс Е.К., Дид Р.В., Иноуэ Т., Нортон Д.Д., Шаррокс А.Д. (январь 2001 г.). «Белки Id спираль-петля-спираль противодействуют активности фактора транскрипции pax, ингибируя связывание ДНК». Молекулярная и клеточная биология. 21 (2): 524–33. Дои:10.1128 / MCB.21.2.524-533.2001. ЧВК 86614. PMID 11134340.
Паскуалуччи Л., Ноймейстер П., Гуссенс Т., Нанджангуд Дж., Чаганти Р.С., Кюпперс Р., Далла-Фавера Р. (июль 2001 г.). «Гипермутация множества протоонкогенов в B-клеточных диффузных крупноклеточных лимфомах». Природа. 412 (6844): 341–6. Bibcode:2001Натура.412..341П. Дои:10.1038/35085588. PMID 11460166. S2CID 4373198.

внешняя ссылка

PAX5 + белок, + человек в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)
FactorBook PAX5
Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: Q02548 (Парный коробчатый белок Pax-5) на PDBe-KB.

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000196092 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000014030 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid1516825-5] Адамс Б., Дёрфлер П., Агуцци А., Козмик З., Урбанек П., Маурер-Фоги I, Басслингер М. (сентябрь 1992 г.). «Pax-5 кодирует фактор транскрипции BSAP и экспрессируется в B-лимфоцитах, развивающейся ЦНС и яичках взрослых». Гены и развитие. 6 (9): 1589–607. Дои:10.1101 / gad.6.9.1589. PMID 1516825.

[pmid8431641-6] Pilz AJ, Povey S, Gruss P, Abbott CM (март 1993 г.). «Картирование человеческих гомологов мышей, содержащих парные коробки». Геном млекопитающих. 4 (2): 78–82. Дои:10.1007 / BF00290430. PMID 8431641. S2CID 30845070.

[entrez-7] а ^б ^c «Ген Entrez: PAX5 парный бокс-ген 5 (активатор, специфичный к линии B-клеток)».

[pmid12360049-8] Торлакович Э., Торлакович Г, Нгуен П.Л., Брунинг Р.Д., Делаби Дж. (Октябрь 2002 г.). «Значение иммуноокрашивания против pax-5 в обычных фиксированных и залитых парафином срезах: новый пан-маркер пре-B и B-клеток». Американский журнал хирургической патологии. 26 (10): 1343–50. Дои:10.1097/00000478-200210000-00011. PMID 12360049. S2CID 7703197.

[pmid10811620-9] Эберхард Д., Хименес Г., Хивей Б., Басслингер М. (май 2000 г.). «Репрессия транскрипции с помощью Pax5 (BSAP) посредством взаимодействия с корепрессорами семейства Граучо». Журнал EMBO. 19 (10): 2292–303. Дои:10.1093 / emboj / 19.10.2292. ЧВК 384353. PMID 10811620.

[pmid12153506-10] Милили М., Готье Л., Веран Дж., Маттей М.Г., Шифф К. (август 2002 г.). «Новый белок Groucho TLE4 может регулировать репрессивную активность Pax5 в B-лимфоцитах человека». Иммунология. 106 (4): 447–55. Дои:10.1046 / j.1365-2567.2002.01456.x. ЧВК 1782747. PMID 12153506.

[pmid11799127-11] Емельянов А.В., Ковач ЧР, Сепульведа М.А., Бирштейн Б.К. (март 2002 г.). «Взаимодействие Pax5 (BSAP) с Daxx может привести к активации транскрипции в B-клетках». Журнал биологической химии. 277 (13): 11156–64. Дои:10.1074 / jbc.M111763200. PMID 11799127.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

Navigation