WikiDer > BARD1 - Википедия

BARD1 - Wikipedia
BARD1
Protein BARD1 PDB 1jm7.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыBARD1, BRCA1 связанный домен RING 1
Внешние идентификаторыOMIM: 601593 MGI: 1328361 ГомолоГен: 400 Генные карты: BARD1
Расположение гена (человек)
Хромосома 2 (человек)
Chr.Хромосома 2 (человек)[1]
Хромосома 2 (человек)
Genomic location for BARD1
Genomic location for BARD1
Группа2q35Начинать214,725,646 бп[1]
Конец214,809,683 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE BARD1 205345 at fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

580

12021

Ансамбль

ENSG00000138376

ENSMUSG00000026196

UniProt

Q99728

O70445

RefSeq (мРНК)

NM_000465
NM_001282543
NM_001282545
NM_001282548
NM_001282549

NM_007525

RefSeq (белок)

NP_031551

Расположение (UCSC)Chr 2: 214,73 - 214,81 МбChr 1: 71.03 - 71.1 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

BRCA1-ассоциированный белок 1 домена RING это белок что у людей кодируется BARD1 ген.[5][6][7] Белок BARD1 человека составляет 777 аминокислоты длинный и содержит RING finger домен (остатки 46-90), четыре анкирин повторы (остатки 420-555) и два тандемных BRCT домены (остатки 568-777).[8]

Функция

Большинство, если не все, BRCA1 гетеродимеризуется с BARD1 in vivo.[9] BARD1 и BRCA1 образуют гетеродимер через свои N-концевой RING finger домены. Взаимодействие BARD1-BRCA1 наблюдается in vivo и in vitro и важно для стабильности BRCA1. BARD1 имеет гомологию с двумя наиболее консервативными областями BRCA1: N-концевым мотивом RING и C-концевым доменом BRCT. Мотив RING представляет собой богатую цистеином последовательность, обнаруженную во множестве белков, которые регулируют рост клеток, включая продукты подавитель опухолей гены и доминант протоонкогены, и важные для развития гены, такие как поликомбина группа генов. Белок BARD1 также содержит три тандема Анкирин повторяет.[10][11]

Взаимодействие BARD1 / BRCA1 нарушается онкогенными аминокислотными заменами в BRCA1, подразумевая, что образование стабильного комплекса между этими белками может быть важным аспектом супрессии опухоли BRCA1. BARD1 может быть целью онкогенных мутаций при раке груди или яичников.[10] Мутации в белке BARD1, влияющие на его структуру, появляются во многих грудь, яичник, и рак матки, предполагая, что мутации отключат BARD1 подавитель опухолей функция.[8] Три миссенс-мутации, каждый из которых влияет на домен BRCT BARD1, как известно, причастны к раку: C645R связан с раком груди и яичников, V695L связан с раком груди, а S761N связан с раком груди и матки.[8] Экспрессия BARD1 активируется генотоксическим стрессом и участвует в апоптозе посредством связывания и стабилизации p53 независимо от BRCA1.[12]

BARD1 жизненно важен для быстрого перемещения BRCA1 к участкам повреждения ДНК.[13] Тандемные мотивы С-конца BRCA1 (BRCT) BARD1 складываются в карман для связывания с помощью ключа лизин остаток (K619) и связывается с поли (АДФ-рибозой) (PAR), который нацеливает гетеродимер BRCA1 / BARD1 на поврежденные участки ДНК.[13] Двухцепочечные разрывы (DSB) в ДНК запускают поли (ADPribose) полимеразу 1 (PARP1), чтобы катализировать образование поли (ADPribose) (PAR), так что PAR может затем связываться с массивом белков ответа ДНК, включая гетеродимер BRCA1 / BARD1 , и нацелить их на участки повреждения ДНК.[14] Когда гетеродимер BRCA1 / BARD1 транспортируется к поврежденному участку ДНК, он действует как E3 убиквитинлигаза.[9] Гетеродимер BRCA1 / BARD1 убиквитинирует РНК-полимеразу II, предотвращая транскрипцию поврежденной ДНК и восстанавливая генетическую стабильность.[15]

Взаимодействия

BARD1 был показан взаимодействовать с:

Значение в лечении рака

Если бы способность раковой клетки восстанавливать повреждения ДНК была бы ограничена, лечение рака было бы более эффективным. Запрещение перемещению гетеродимера BRCA1 / BARD1 раковых клеток к участкам повреждения ДНК скорее приведет к гибели опухолевых клеток, чем к их восстановлению. Одной из возможностей ингибирования является ключевой остаток лизина BARD1 BRCT (K619). Ингибирование способности этого остатка лизина связывать поли (АДФ-рибозу) предотвратит локализацию гетеродимера BRCA1 / BARD1 в сайтах повреждения ДНК и, следовательно, предотвратит восстановление повреждений ДНК. Это сделало бы такие методы лечения рака, как химиотерапия и лучевая терапия, намного более эффективными.[48]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000138376 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026196 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ а б Wu LC, Wang ZW, Tsan JT, Spillman MA, Phung A, Xu XL, Yang MC, Hwang LY, Bowcock AM, Baer R (декабрь 1996 г.). «Идентификация белка RING, который может взаимодействовать in vivo с продуктом гена BRCA1». Природа Генетика. 14 (4): 430–40. Дои:10.1038 / ng1296-430. PMID 8944023. S2CID 22728511.
  6. ^ Thai TH, Du F, Tsan JT, Jin Y, Phung A, Spillman MA, Massa HF, Muller CY, Ashfaq R, Mathis JM, Miller DS, Trask BJ, Baer R, Bowcock AM (февраль 1998 г.). «Мутации в гене BRCA1-ассоциированного домена RING (BARD1) при первичном раке груди, яичников и матки». Молекулярная генетика человека. 7 (2): 195–202. Дои:10.1093 / hmg / 7.2.195. PMID 9425226.
  7. ^ а б Fabbro M, Savage K, Hobson K, Deans AJ, Powell SN, McArthur GA, Khanna KK (июль 2004 г.). «Комплексы BRCA1-BARD1 необходимы для фосфорилирования p53Ser-15 и остановки G1 / S после повреждения ДНК, вызванного ионизирующим излучением». Журнал биологической химии. 279 (30): 31251–8. Дои:10.1074 / jbc.M405372200. PMID 15159397.
  8. ^ а б c Бирран Дж., Варма А. К., Сони А., Леди Дж. А. (июль 2007 г.). «Кристаллическая структура BRCT-доменов BARD1». Биохимия. 46 (26): 7706–12. Дои:10.1021 / bi700323t. PMID 17550235.
  9. ^ а б Баер Р., Людвиг Т. (февраль 2002 г.). «Гетеродимер BRCA1 / BARD1, опухолевый супрессорный комплекс с убиквитиновой лигазной активностью E3». Текущее мнение в области генетики и развития. 12 (1): 86–91. Дои:10.1016 / s0959-437x (01) 00269-6. PMID 11790560.
  10. ^ а б "Энтрез Ген: BARD1 BRCA1 связанный RING домен 1".
  11. ^ Фокс, Дэвид; Ле Тронг, Изольда; Раджагопал, Понни; Brzovic, Peter S .; Стенкамп, Рональд Э .; Клевит, Рэйчел Э. (25 июля 2008 г.). «Кристаллическая структура домена анкиринового повтора BARD1 и ее функциональные последствия». Журнал биологической химии. 283 (30): 21179–21186. Дои:10.1074 / jbc.M802333200. ISSN 0021-9258. ЧВК 2475683. PMID 18480049.
  12. ^ Ирмингер-Фингер I, Люнг В.К., Ли Дж., Дюбуа-Дофин М., Харб Дж., Феки А., Джеффорд К.Э., Сориано СП, Джакони М., Монтесано Р., Краузе К.Х. (декабрь 2001 г.). «Идентификация BARD1 как посредника между проапоптотическим стрессом и p53-зависимым апоптозом». Молекулярная клетка. 8 (6): 1255–66. Дои:10.1016 / с1097-2765 (01) 00406-3. PMID 11779501.
  13. ^ а б Ли М., Ю X (май 2013 г.). «Функция BRCA1 в ответе на повреждение ДНК опосредуется ADP-рибозилированием». Раковая клетка. 23 (5): 693–704. Дои:10.1016 / j.ccr.2013.03.025. ЧВК 3759356. PMID 23680151.
  14. ^ Баер Р. (май 2013 г.). «Заманивание BRCA1 на место преступления». Раковая клетка. 23 (5): 565–7. Дои:10.1016 / j.ccr.2013.04.013. ЧВК 3746756. PMID 23680142.
  15. ^ Ирмингер-Фингер I, Джеффорд CE (май 2006 г.). «Есть ли что-то большее в BARD1, чем BRCA1?». Обзоры природы. Рак. 6 (5): 382–91. Дои:10.1038 / nrc1878. PMID 16633366. S2CID 13543420.
  16. ^ а б c d Райзер С., Дизин Э., Джеффорд С.Э., Делаваль Б., Гагос С., Христодулиду А., Краузе К.Х., Бирнбаум Д., Ирмингер-Фингер I (февраль 2009 г.). «Определенные роли изоформ BARD1 в митозе: полноразмерный BARD1 опосредует деградацию Aurora B, связанные с раком каркасы BARD1beta Aurora B и BRCA2». Исследования рака. 69 (3): 1125–34. Дои:10.1158 / 0008-5472.CAN-08-2134. PMID 19176389.
  17. ^ Дехенд Р., Хирано Ф., Леманн К., Хейсмайер В., Ансио С., Вульчин Ф. Г., Шайдерайт С., Лойц А. (июнь 1999 г.). «Онкопротеин Bcl-3 действует как связующий фактор между NF-kappaB / Rel и ядерными ко-регуляторами». Онкоген. 18 (22): 3316–23. Дои:10.1038 / sj.onc.1202717. PMID 10362352.
  18. ^ а б c d е ж грамм Донг Й., Хакими М.А., Чен Х, Кумарасвами Э., Куч Н.С., Годвин А.К., Шихаттар Р. (ноябрь 2003 г.). «Регулирование BRCC, холоферментного комплекса, содержащего BRCA1 и BRCA2, с помощью субъединицы, подобной сигнаносоме, и ее роль в репарации ДНК». Молекулярная клетка. 12 (5): 1087–99. Дои:10.1016 / S1097-2765 (03) 00424-6. PMID 14636569.
  19. ^ а б c Маллери Д.Л., Ванденберг С.Дж., Хиом К. (декабрь 2002 г.). «Активация функции лигазы E3 комплекса BRCA1 / BARD1 полиубиквитиновыми цепями». Журнал EMBO. 21 (24): 6755–62. Дои:10.1093 / emboj / cdf691. ЧВК 139111. PMID 12485996.
  20. ^ а б Кенцис А., Гордон Р. Э., Борден К. Л. (ноябрь 2002 г.). «Контроль биохимических реакций через самосборку супрамолекулярного домена RING». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 99 (24): 15404–9. Bibcode:2002PNAS ... 9915404K. Дои:10.1073 / pnas.202608799. ЧВК 137729. PMID 12438698.
  21. ^ а б c Чен А., Клейман Ф. Е., Мэнли Дж. Л., Оучи Т., Пан З. К. (июнь 2002 г.). «Аутоубиквитинирование убиквитинлигазы BRCA1 * BARD1 RING». Журнал биологической химии. 277 (24): 22085–92. Дои:10.1074 / jbc.M201252200. PMID 11927591.
  22. ^ а б c Сато К., Хаями Р., Ву В., Нисикава Т., Нисикава Х., Окуда Й., Огата Х., Фукуда М., Охта Т. (июль 2004 г.). «Нуклеофозмин / B23 является кандидатом в субстрат для убиквитинлигазы BRCA1-BARD1». Журнал биологической химии. 279 (30): 30919–22. Дои:10.1074 / jbc.C400169200. PMID 15184379.
  23. ^ а б Wu-Baer F, Lagrazon K, Yuan W, Baer R (сентябрь 2003 г.). «Гетеродимер BRCA1 / BARD1 собирает полиубиквитиновые цепи через нетрадиционную связь, включающую остаток лизина K6 убиквитина». Журнал биологической химии. 278 (37): 34743–6. Дои:10.1074 / jbc.C300249200. PMID 12890688.
  24. ^ а б c Ванденберг С.Дж., Гергей Ф., Онг С.Й., Пейс П., Маллери Д.Л., Хиом К., Патель К.Дж. (июль 2003 г.). "BRCA1-независимое убиквитинирование FANCD2". Молекулярная клетка. 12 (1): 247–54. Дои:10.1016 / S1097-2765 (03) 00281-8. PMID 12887909.
  25. ^ а б Хашизумэ Р., Фукуда М., Маэда И., Нисикава Х., Ояке Д., Ябуки И., Огата Х., Охта Т. (май 2001 г.). «Гетеродимер RING BRCA1-BARD1 представляет собой убиквитинлигазу, инактивированную мутацией, вызванной раком груди». Журнал биологической химии. 276 (18): 14537–40. Дои:10.1074 / jbc.C000881200. PMID 11278247.
  26. ^ а б c Kleiman FE, Manley JL (март 2001 г.). «Взаимодействие BARD1-CstF-50 связывает образование 3'-конца мРНК с повреждением ДНК и подавлением опухоли». Клетка. 104 (5): 743–53. Дои:10.1016 / S0092-8674 (01) 00270-7. PMID 11257228.
  27. ^ а б c Kleiman FE, Manley JL (сентябрь 1999 г.). «Функциональное взаимодействие BRCA1-ассоциированного BARD1 с фактором полиаденилирования CstF-50». Наука. 285 (5433): 1576–9. Дои:10.1126 / science.285.5433.1576. PMID 10477523.
  28. ^ Ван К., Чжан Х., Геррет С., Чен Дж., Мазурек А., Уилсон Т., Слупянек А., Скорски Т., Фишел Р., Грин М. И. (август 2001 г.). «Аденозиновый нуклеотид модулирует физическое взаимодействие между hMSH2 и BRCA1». Онкоген. 20 (34): 4640–9. Дои:10.1038 / sj.onc.1204625. PMID 11498787.
  29. ^ Фаббро М., Родригес Дж. А., Баер Р., Хендерсон Б. Р. (июнь 2002 г.). «BARD1 индуцирует образование внутриядерных очагов BRCA1 за счет увеличения RING-зависимого ядерного импорта BRCA1 и ингибирования ядерного экспорта BRCA1». Журнал биологической химии. 277 (24): 21315–24. Дои:10.1074 / jbc.M200769200. PMID 11925436.
  30. ^ Родригес JA, Schüchner S, Au WW, Fabbro M, Henderson BR (март 2004 г.). «Ядерно-цитоплазматическое перемещение BARD1 способствует его проапоптотической активности и регулируется димеризацией с помощью BRCA1». Онкоген. 23 (10): 1809–20. Дои:10.1038 / sj.onc.1207302. PMID 14647430.
  31. ^ Брзович П.С., Киф Дж. Р., Нишикава Х., Миямото К., Фокс Д., Фукуда М., Охта Т., Клевит Р. (май 2003 г.). «Связывание и распознавание в сборке активного комплекса убиквитин-лигаза BRCA1 / BARD1». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 100 (10): 5646–51. Bibcode:2003ПНАС..100.5646Б. Дои:10.1073 / pnas.0836054100. ЧВК 156255. PMID 12732733.
  32. ^ Нисикава Х., Оока С., Сато К., Арима К., Окамото Дж., Клевит Р. Э., Фукуда М., Охта Т. (февраль 2004 г.). «Масс-спектрометрический и мутационный анализы выявили полиубиквитиновые цепи, связанные с Lys-6, катализируемые убиквитинлигазой BRCA1-BARD1». Журнал биологической химии. 279 (6): 3916–24. Дои:10.1074 / jbc.M308540200. PMID 14638690.
  33. ^ Chiba N, Parvin JD (октябрь 2001 г.). «Перераспределение BRCA1 среди четырех различных белковых комплексов после блокировки репликации». Журнал биологической химии. 276 (42): 38549–54. Дои:10.1074 / jbc.M105227200. PMID 11504724.
  34. ^ Моррис-младший, Keep NH, Solomon E (март 2002 г.). «Идентификация остатков, необходимых для взаимодействия BARD1 с BRCA1». Журнал биологической химии. 277 (11): 9382–6. Дои:10.1074 / jbc.M109249200. PMID 11773071.
  35. ^ Бржович PS, Meza JE, King MC, Klevit RE (ноябрь 2001 г.). «Мутации, предрасполагающие к раку в домене BRCA1 RING. Структурные последствия и влияние на белок-белковые взаимодействия». Журнал биологической химии. 276 (44): 41399–406. Дои:10.1074 / jbc.M106551200. PMID 11526114.
  36. ^ Ся Й, Пао Г.М., Чен Х.В., Верма И.М., Хантер Т. (февраль 2003 г.). «Повышение активности убиквитинлигазы BRCA1 E3 за счет прямого взаимодействия с белком BARD1». Журнал биологической химии. 278 (7): 5255–63. Дои:10.1074 / jbc.M204591200. PMID 12431996.
  37. ^ Meza JE, Brzovic PS, King MC, Klevit RE (февраль 1999 г.). «Картирование функциональных доменов BRCA1. Взаимодействие доменов безымянного пальца BRCA1 и BARD1». Журнал биологической химии. 274 (9): 5659–65. Дои:10.1074 / jbc.274.9.5659. PMID 10026184.
  38. ^ Брзович П.С., Раджагопал П., Хойт Д.В., Кинг М.С., Клевит Р.Э. (октябрь 2001 г.). «Структура гетеродимерного комплекса RING-RING BRCA1-BARD1». Структурная биология природы. 8 (10): 833–7. Дои:10.1038 / nsb1001-833. PMID 11573085. S2CID 37617901.
  39. ^ Yu X, Wu LC, Bowcock AM, Aronheim A, Baer R (сентябрь 1998 г.). «С-концевые (BRCT) домены BRCA1 взаимодействуют in vivo с CtIP, белком, участвующим в пути CtBP репрессии транскрипции». Журнал биологической химии. 273 (39): 25388–92. Дои:10.1074 / jbc.273.39.25388. PMID 9738006.
  40. ^ Джин И, Сюй XL, Ян МС, Вэй Ф, Айи Т.С., Боукок АМ, Баэр Р. (октябрь 1997 г.). «Зависимая от клеточного цикла совместная локализация белков BARD1 и BRCA1 в дискретных ядерных доменах». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 94 (22): 12075–80. Bibcode:1997PNAS ... 9412075J. Дои:10.1073 / пнас.94.22.12075. ЧВК 23707. PMID 9342365.
  41. ^ Скалли Р., Ганесан С., Власакова К., Чен Дж., Соколовский М., Ливингстон Д.М. (декабрь 1999 г.). «Генетический анализ функции BRCA1 в определенной линии опухолевых клеток». Молекулярная клетка. 4 (6): 1093–9. Дои:10.1016 / S1097-2765 (00) 80238-5. PMID 10635334.
  42. ^ Tascou S, Kang TW, Trappe R, Engel W., Burfeind P (сентябрь 2003 г.). «Идентификация и характеристика NIF3L1 BP1, нового партнера цитоплазматического взаимодействия белка NIF3L1». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 309 (2): 440–8. Дои:10.1016 / j.bbrc.2003.07.008. PMID 12951069.
  43. ^ Бенезра М., Шевалье Н., Моррисон Д. Д., Маклахлан Т. К., Эль-Дейри В. С., Лихт Д. Д. (июль 2003 г.). «BRCA1 усиливает транскрипцию фактора транскрипции NF-kappaB путем связывания с доменом Rel субъединицы p65 / RelA». Журнал биологической химии. 278 (29): 26333–41. Дои:10.1074 / jbc.M303076200. PMID 12700228.
  44. ^ Cantor SB, Bell DW, Ganesan S, Kass EM, Drapkin R, Grossman S, Wahrer DC, Sgroi DC, Lane WS, Haber DA, Livingston DM (апрель 2001 г.). «BACH1, новый геликазоподобный белок, напрямую взаимодействует с BRCA1 и способствует его функции репарации ДНК». Клетка. 105 (1): 149–60. Дои:10.1016 / S0092-8674 (01) 00304-X. PMID 11301010.
  45. ^ Ван Кью, Чжан Х., Каджино К., Грин М.И. (октябрь 1998 г.). «BRCA1 связывает c-Myc и ингибирует его транскрипционную и трансформирующую активность в клетках». Онкоген. 17 (15): 1939–48. Дои:10.1038 / sj.onc.1202403. PMID 9788437.
  46. ^ Нисикава Х., Ву В., Коике А., Кодзима Р., Гоми Х., Фукуда М., Охта Т. (январь 2009 г.). «BRCA1-ассоциированный белок 1 препятствует активности гетеродимера BRCA1 / BARD1 RING». Исследования рака. 69 (1): 111–9. Дои:10.1158 / 0008-5472.CAN-08-3355. PMID 19117993.
  47. ^ Спан Л., Петерманн Р., Силиган С., Шмид Дж. А., Арье Д. Н., Ковар Х. (август 2002 г.). «Взаимодействие NH2-конца EWS с BARD1 связывает ген саркомы Юинга с общим путем подавления опухоли». Исследования рака. 62 (16): 4583–7. PMID 12183411.
  48. ^ Венкитараман AR (январь 2002 г.). «Восприимчивость к раку и функции BRCA1 и BRCA2». Клетка. 108 (2): 171–82. Дои:10.1016 / S0092-8674 (02) 00615-3. PMID 11832208.

внешняя ссылка

  • Человек BARD1 расположение генома и BARD1 страница сведений о гене в Браузер генома UCSC.
  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: Q99728 (BRCA1-ассоциированный белок 1 домена RING) на PDBe-KB.

дальнейшее чтение