WikiDer > Глицин — тРНК лигаза

Glycine—tRNA ligase
ГАРС1
Протеин GARS PDB 2 pme.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыGARS1, CMT2D, DSMAV, GlyRS, HMN5, SMAD1, глицил-тРНК синтетаза, GARS, глицил-тРНК синтетаза 1
Внешние идентификаторыOMIM: 600287 MGI: 2449057 ГомолоГен: 1547 Генные карты: GARS1
Расположение гена (человек)
Хромосома 7 (человек)
Chr.Хромосома 7 (человек)[1]
Хромосома 7 (человек)
Геномное расположение GARS1
Геномное расположение GARS1
Группа7п14.3Начинать30,594,838 бп[1]
Конец30,634,033 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE GARS 208693 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_002047
NM_001316772

NM_180678

RefSeq (белок)

NP_001303701
NP_002038

NP_851009

Расположение (UCSC)Chr 7: 30.59 - 30.63 МбChr 6: 55.04 - 55.08 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Глицин — тРНК лигаза также известен как глицил-тРНК синтетаза является фермент что у людей кодируется ГАРС ген.[5][6][7]

Функция

Этот ген кодирует глицил-тРНК синтетазу, одну из аминоацил-тРНК синтетаз, которые заряжают тРНК родственными им аминокислотами. Кодируемый фермент представляет собой димер (альфа) 2, который принадлежит к семейству тРНК синтетаз класса II.[7]

Реакция

глицин-тРНК лигаза
Идентификаторы
Номер ЕС6.1.1.14
Количество CAS9037-62-1
Базы данных
IntEnzПросмотр IntEnz
БРЕНДАBRENDA запись
ExPASyПросмотр NiceZyme
КЕГГЗапись в KEGG
MetaCycметаболический путь
ПРИАМпрофиль
PDB структурыRCSB PDB PDBe PDBsum
Генная онтологияAmiGO / QuickGO

В энзимология, а глицин-тРНК лигаза (EC 6.1.1.14) является фермент который катализирует то химическая реакция

АТФ + глицин + tRNAGly AMP + дифосфат + глицил-tRNAGly

3 субстраты этого фермента АТФ, глицин, и тРНК (Gly), а его 3 товары находятся AMP, дифосфат, и глицил-тРНК (Gly).

Этот фермент принадлежит к семейству лигазы, а именно те, которые образуют углерод-кислородные связи в аминоацил-тРНК и родственных соединениях. В систематическое название этого класса ферментов глицин: лигаза tRNAGly (AMP-образующая). Другие широко используемые имена включают глицил-тРНК синтетаза, рибонуклеатсинтетаза с переносом глицила, глицил-переносящая РНК-синтетаза, синтетаза рибонуклеиновой кислоты с переносом глицила, и глицил транслаза. Этот фермент участвует в метаболизм глицина, серина и треонина и биосинтез аминоацил-трнк.

Взаимодействия

Было показано, что глицил-тРНК синтетаза взаимодействовать с EEF1D.[8] Мутантные формы белка, ассоциированные с периферический нерв было показано, что болезнь аберрантно связывается с белками трансмембранного рецептора нейропилин 1[9] и Рецепторы Trk А-С.[10]

Клиническая значимость

Было показано, что глицил-тРНК-синтетаза является мишенью аутоантител при аутоиммунных заболеваниях человека, полимиозит или же дерматомиозит.[7]

Заболевания периферических нервов Болезнь Шарко-Мари-Тута тип 2D (CMT2D) и дистальная спинномозговая мышечная атрофия V типа (dSMA-V) были склонны к доминантным мутациям в ГАРС.[11][12] CMT2D обычно проявляется в подростковом возрасте и приводит к мышечной слабости преимущественно в руках и ногах.[13] Две мышиные модели CMT2D были использованы для лучшего понимания болезни, и было установлено, что нарушение вызвано токсическим усилением функции мутантного белка глицин-тРНК-лигазы.[14] У мышей CMT2D обнаружен периферический нерв. аксон вырождение [15][16] и дефектная разработка[17] и функция[18]> из нервномышечное соединение.

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000106105 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000029777 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Николс Р.К., Пай С.И., Ге К., Таргофф И.Н., Плотц П.Х., Лю П. (ноябрь 1995 г.). «Локализация двух генов аутоантигена человека с помощью ПЦР-скрининга и гибридизации in situ - глицил-тРНК-синтетаза находится в 7p15, а аланил-тРНК-синтетаза - в 16q22». Геномика. 30 (1): 131–2. Дои:10.1006 / geno.1995.0028. PMID 8595897.
  6. ^ Ионасеску В., Сирби С., Шеффилд В.К., Роклина Т., Нисимура Д., Ионасеску Р. (сентябрь 1996 г.). «Аутосомно-доминантная аксональная нейропатия Шарко-Мари-Тута, отображенная на хромосоме 7p (CMT2D)». Молекулярная генетика человека. 5 (9): 1373–5. CiteSeerX 10.1.1.588.4502. Дои:10.1093 / hmg / 5.9.1373. PMID 8872480.
  7. ^ а б c "Энтрез Ген: GARS глицил-тРНК синтетаза".
  8. ^ Сан Ли Дж, Гю Пак С., Пак Х, Соль В., Ли С., Ким С. (февраль 2002 г.). «Сеть взаимодействия человеческих аминоацил-тРНК синтетаз и субъединиц комплекса фактора элонгации 1». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 291 (1): 158–64. Дои:10.1006 / bbrc.2002.6398. PMID 11829477.
  9. ^ He W, Bai G, Zhou H, Wei N, White NM, Lauer J, Liu H, Shi Y, Dumitru CD, Lettieri K, Shubayev V, Jordanova A, Guergueltcheva V, Griffin PR, Burgess RW, Pfaff SL, Yang XL (2015). «CMT2D нейропатия связана с неоморфной связывающей активностью глицил-тРНК синтетазы». Природа. 526 (7575): 710–4. Bibcode:2015Натура.526..710H. Дои:10.1038 / природа15510. ЧВК 4754353. PMID 26503042.
  10. ^ Sleigh JN, Dawes JM, West SJ, Wei N, Spaulding EL, Gómez-Martín A, Zhang Q, Burgess RW, Cader MZ, Talbot K, Yang XL, Bennett DL, Schiavo G (2017). «Передача сигналов рецептора Trk и судьба сенсорных нейронов нарушаются при нейропатии человека, вызванной мутациями Gars». Proc Natl Acad Sci U S A. 114 (16): E3324 – E3333. Дои:10.1073 / pnas.1614557114. ЧВК 5402433. PMID 28351971.
  11. ^ Motley WW, Talbot K, Fischbeck KH (февраль 2010 г.). «Аксонопатия GARS: не каждая нейронная чаша тРНК». Тенденции в неврологии. 33 (2): 59–66. Дои:10.1016 / j.tins.2009.11.001. ЧВК 2822721. PMID 20152552.
  12. ^ Антонеллис А., Эллсворт Р. Э., Самбуугин Н., Пульс I, Абель А., Ли-Лин С. К., Жорданова А., Кременский И., Христодулу К., Миддлтон Л. Т., Сивакумар К., Ионасеску В., Фуналот Б., Вэнс Дж. М., Гольдфарб Л. Г., Фишбек К. Х., Зеленый ED (2003). «Мутации глицил тРНК синтетазы при болезни Шарко-Мари-Тута типа 2D и дистальной спинномозговой мышечной атрофии типа V». Американский журнал генетики человека. 72 (5): 1293–9. Дои:10.1086/375039. ЧВК 1180282. PMID 12690580.
  13. ^ Сивакумар К., Кириакидес Т., Пульс I, Николсон Г.А., Фуналот Б., Антонеллис А., Самбуугин Н., Христодулу К., Беггс Д.Л., Замба-Папаниколау Э., Ионасеску В., Далакас М.С., Грин ED, Фишбек К.Х., Голдфарб Л.Г. (октябрь 2005 г.) . «Фенотипический спектр нарушений, связанных с мутациями глицил-тРНК синтетазы». Мозг. 128 (Pt 10): 2304–14. Дои:10.1093 / мозг / awh590. PMID 16014653.
  14. ^ Motley WW, Seburn KL, Nawaz MH, Miers KE, Cheng J, Antonellis A, Green ED, Talbot K, Yang XL, Fischbeck KH, Burgess RW (декабрь 2011 г.). «Мутантный GARS, связанный с Шарко-Мари-Тутом, токсичен для периферических нейронов независимо от уровней GARS дикого типа». PLOS Genetics. 7 (12): e1002399. Дои:10.1371 / journal.pgen.1002399. ЧВК 3228828. PMID 22144914.
  15. ^ Себурн К.Л., Нангл Л.А., Кокс Г.А., Шиммель П., Берджесс Р.В. (сентябрь 2006 г.). «Активная доминантная мутация глицил-тРНК синтетазы вызывает невропатию в 2D мышиной модели Шарко-Мари-Тута». Нейрон. 51 (6): 715–26. Дои:10.1016 / j.neuron.2006.08.027. PMID 16982418. S2CID 11035583.
  16. ^ Achilli F, Bros-Facer V, Williams HP, Banks GT, AlQatari M, Chia R, Tucci V, Groves M, Nickols CD, Seburn KL, Kendall R, Cader MZ, Talbot K, van Minnen J, Burgess RW, Brandner S , Мартин Дж. Э., Кольценбург М., Гринсмит Л., Нолан П. М., Фишер Е. М. (июль – август 2009 г.). «ЭНУ-индуцированная мутация глицил-тРНК синтетазы мыши (GARS) вызывает периферические сенсорные и моторные фенотипы, создавая модель периферической нейропатии типа 2D Шарко-Мари-Тута». Модели и механизмы заболеваний. 2 (7–8): 359–73. Дои:10.1242 / дмм.002527. ЧВК 2707104. PMID 19470612.
  17. ^ Сани Дж. Н., Грайс С. Дж., Берджесс Р. У., Талбот К., Кадер М. З. (май 2014 г.). «Дефекты созревания нервно-мышечного соединения предшествуют нарушению связи нижних мотонейронов у мышей типа Шарко-Мари-Тута 2D». Молекулярная генетика человека. 23 (10): 2639–50. Дои:10.1093 / hmg / ddt659. ЧВК 3990164. PMID 24368416.
  18. ^ Сполдинг Е.Л., Сани Дж. Н., Морелли К. Х., Пинтер М. Дж., Берджесс Р. В., Себурн К. Л. (2016). «Синаптический дефицит в нервно-мышечных соединениях в двух моделях мышей Шарко-Мари-Тута типа 2d». Журнал неврологии. 36 (11): 3254–67. Дои:10.1523 / JNEUROSCI.1762-15.2016. ЧВК 4792937. PMID 26985035.

дальнейшее чтение

внешняя ссылка