WikiDer > HLA-A3
 | Эта статья может быть слишком техническим для большинства читателей, чтобы понять. Пожалуйста помогите улучшить это к сделать понятным для неспециалистов, не снимая технических деталей. (Май 2017 г.) (Узнайте, как и когда удалить этот шаблон сообщения) |
| HLA-A3 | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| (MHC Класс I, А антиген клеточной поверхности) | ||||||||||
 HLA-A3 | ||||||||||
| Около | ||||||||||
| Протеин | трансмембранный рецептор/лиганд | |||||||||
| Структура | αβ гетеродимер | |||||||||
| Подразделения | HLA-A*03--, β2-микроглобулин | |||||||||
| Старые имена | HL-A3 | |||||||||
| Подтипы | ||||||||||
| ||||||||||
| Редкие аллели | ||||||||||
| ||||||||||
| Ссылка на все аллели на IMGT / HLA база данных в EBI | ||||||||||
HLA-A3 (A3) - это человеческий лейкоцитарный антиген серотип в HLA-A группа серотипа. Серотип определяется по распознаванию антителом α3 подмножество α-цепей HLA-A. Для A3 альфа, "A", цепочка кодируется HLA-A.*03 аллельная группа и β-цепь кодируются B2M локус.[1] В настоящее время в этой группе преобладает A * 0301. A3 и A*03 почти синонимичны по значению. А3 более распространен в Европе, он является частью самого длинного известного мультигенного гаплотип, A3-B7-DR15-DQ6.[2]
Серотип
| A * 03 | A3 | Образец |
| аллель | % | размер (N) |
| *0301 | 99 | 3504 |
| *0302 | 78 | 342 |
| *0305 | 20 | 5 |
A3 в основном состоит из A * 0301 и * 0302, которые хорошо серотипируются с антителами против A3. Существует 26 несинонимичных вариантов A * 03, 4 нулевых и 22 варианта белка.
Сопутствующие заболевания
Серотип A3 является вторичным фактором риска миастения[4] и ниже CD8+ уровни в гемохроматоз пациенты.[5][6] Локус HFE (гемохроматоз) находится между A3 и B7 в супергаплотипе A3 :: DQ6.[7]
В ВИЧ
HLA-A3 выбирает эволюцию ВИЧ по эпитопу мутации Gag KK9 и приводит к быстрому снижению Т-клеточного ответа CD8. CD8 Т-клетки отвечают за быстрое уничтожение ВИЧ-инфицированных CD4 + клеток.[8] Этот тип развитой реакции может не быть специфичным для HLA-A3, и поскольку ВИЧ способен быстро адаптироваться in situ к факторам отбора.
Аллели
| Изучение населения | Freq. (в %)[9] |
|---|---|
| Финляндия | 25.0 |
| Индия Тамил Наду Надар | 20.5 |
| Чехия | 18.9 |
| Бельгия | 17.1 |
| Ирландия Северная | 14.3 |
| Австралия Новый Южный Уэльс | 13.8 |
| Грузия Сванети Сваны | 13.8 |
| Грузия Тибилиси Грузинская… | 13.8 |
| Пакистан Бурушо | 13.0 |
| Кабо-Верде, северо-запад I… | 12.0 |
| Южная Ирландия | 11.6 |
| румынский | 11.6 |
| Хорватия | 11.0 |
| Кавказцы США (3) | 10.8 |
| Северная Италия (1) | 9.7 |
| Афроамериканцы в США (2) | 9.4 |
| Индия Мумбаи Маратхи | 9.3 |
| Индия Вест Бхилс | 9.0 |
| Центр Португалии | 9.0 |
| Пакистан Патан | 8.7 |
| Камерун Бети | 8.6 |
| Камерун Бамилеке | 7.8 |
| Пакистанские калаши | 7.5 |
| Саудовская Аравия Гурайат и… | 7.5 |
| США испаноязычный | 7.3 |
| Индия Северный Дели | 7.2 |
| Мадейра | 7.0 |
| Россия Тува (2) | 6.9 |
| Тунис | 6.7 |
| США Уроженец Северной Америки… | 6.7 |
| Кабо-Верде Юго-восток I… | 6.5 |
| Азорские острова Санта-Мария и Са ... | 6.4 |
| Пакистанский белудж | 6.3 |
| Гвинея-Бисау | 6.2 |
| Израильские арабские друзы | 6.0 |
| Южноафриканский Натал Зулу | 6.0 |
| США Южный Техас, латиноамериканцы | 6.0 |
| Индусы Северной Индии | 5.8 |
| Замбия Лусака | 5.8 |
| Иран Белудж | 5.6 |
| Уганда Кампала | 5.5 |
| Иордания Амман | 5.2 |
| Кения | 5.2 |
| Бразилия | 5.1 |
| Оман | 5.1 |
| Камерунский карликовый бака | 5.0 |
| Грузия Тибилиси Курды | 5.0 |
| Суданский | 4.8 |
| Болгария | 4.6 |
| Пакистан Брахуи | 4.6 |
| Китай Пекин | 4.5 |
| Австралия Индиг. Мыс Йор… | 4.4 |
| Китай Внутренняя Монголия | 4.4 |
| Мали Бандиагара | 4.4 |
| Пакистанский синдхи | 4.4 |
| Китай Цинхай Хуэй | 4.1 |
| Зимбабве Хараре Шона | 4.0 |
| Камерун Сава | 3.8 |
| Сенегал Ниохоло Манденка | 3.8 |
| Кения Луо | 3.6 |
| Марокко Надор Металса Кла… | 3.4 |
| Кения Нанди | 3.1 |
| Мекс. Гвадалахара Метис… | 3.1 |
| Китай Гуанчжоу | 2.9 |
| Китай Северная Хань | 2.9 |
| Монголия Бурят | 2.9 |
| Китайские тибетцы | 2.5 |
| Китай Юньнань Ну | 2.5 |
| Мексика Местис | 2.4 |
| американское Самоа | 2.0 |
| Сингапур яванский индон… | 2.0 |
| Частоты аллелей представлены, только | |
| Изучение населения | Freq. (в %)[9] |
|---|---|
| Грузия Тибилиси Курды | 8.3 |
| Марокко Надор Металса Кла… | 4.1 |
| Пакистан Карачи Парси | 2.8 |
| Израильские арабские друзы | 2.5 |
| Индия Нью-Дели | 2.3 |
| Суданский | 2.3 |
| Индия Северный Дели | 2.2 |
| Парсы западного побережья Индии | 2.0 |
| Центр Португалии | 2.0 |
| Индия Андхра-Прадеш Голл… | 1.7 |
| Пакистанские калаши | 1.7 |
| Пакистанский белудж | 1.6 |
| Грузия Тибилиси Грузинская… | 1.4 |
| Саудовская Аравия Гурайат и… | 1.4 |
| Оман | 1.3 |
| Пакистанский синдхи | 1.3 |
| Индусы Северной Индии | 1.0 |
| Пакистан Патан | 1.0 |
| Южная Африка Натал Тамил | 1.0 |
| США Южный Техас, латиноамериканцы | 0.8 |
| Частоты аллелей представлены, только | |
Сопутствующие заболевания
A * 0301 модулирует повышенный риск рассеянный склероз[10]
Гаплотипы A3-B
A3-B7 является частью супергаплотипа A3 :: DQ2 A3-B8 (Румыния, svanS)
A3-B35 (Болгария, Хорватия, восточное Черное море)
A3-B55 (E. Черное море)
A3-Cw7-B7
A3-B7 является бимодальным по частоте в Европе с одним узлом в Ирландии, а другой в Швейцарии, относительно Швейцарии, кажется, выше. A3-Cw7-B7 - один из наиболее распространенных мультигенных гаплотипов в западном мире, особенно в Центральной и Восточной Европе.
А*0301 : C*0702 : B*0702 : DRB1*1501 : DQA1*0102 : DQB1*0602
Рекомендации
- ^ Арсе-Гомес Б., Джонс Э.А., Барнстейбл С.Дж., Соломон Э., Бодмер В.Ф. (февраль 1978 г.). «Генетический контроль антигенов HLA-A и B в гибридах соматических клеток: потребность в бета2-микроглобулине». Тканевые антигены. 11 (2): 96–112. Дои:10.1111 / j.1399-0039.1978.tb01233.x. PMID 77067.
- ^ Хортон Р., Гибсон Р., Коггилл П. и др. (Январь 2008 г.). «Вариационный анализ и аннотация генов восьми гаплотипов MHC: проект гаплотипов MHC». Иммуногенетика. 60 (1): 1–18. Дои:10.1007 / s00251-007-0262-2. ЧВК 2206249. PMID 18193213.
- ^ Аллельная форма запроса IMGT / HLA - Европейский институт биоинформатики
- ^ Machens A, Löliger C, Pichlmeier U, Emskötter T, Busch C, Izbicki J (1999). «Корреляция патологии тимуса с HLA при миастении». Клиническая иммунология. 91 (3): 296–301. Дои:10.1006 / Clim.1999.4710. PMID 10370374.
- ^ Бартон Дж, Винер Х, Актон Р, Иди Р (2005). «Гаплотип HLA A * 03-B * 07 у пробандов гемохроматоза с гомозиготностью HFE C282Y: несоответствие частоты у мужчин и женщин и отсутствие связи с серьезностью перегрузки железом». Клетки крови Мол Дис. 34 (1): 38–47. Дои:10.1016 / j.bcmd.2004.08.022. PMID 15607698.
- ^ Круз Э., Виейра Дж., Алмейда С., Ласерда Р., Гартнер А, Кардосо С., Алвес Х, Порту Дж. (2006). «Исследование 82 расширенных гаплотипов HLA у субъектов с гомозиготным гемохроматозом HFE-C282Y: связь с генетическим контролем количества CD8 + Т-лимфоцитов и тяжестью перегрузки железом». BMC Med Genet. 7: 16. Дои:10.1186/1471-2350-7-16. ЧВК 1413516. PMID 16509978.
- ^ Олссон К.С., Риттер Б., Ханссон Н., Чоудхури Р.Р. (июль 2008 г.). «HLA-гаплотипическая карта популяций речных долин с гемохроматозом, прослеженная на протяжении пяти веков в Центральной Швеции». Евро. J. Haematol. 81 (1): 36–46. Дои:10.1111 / j.1600-0609.2008.01078.x. PMID 18363869.
- ^ Аллен Т.М., Альтфельд М., Ю XG и др. (Июль 2004 г.). «Отбор, передача и реверсия мутации ускользания цитотоксических Т-лимфоцитов, обрабатывающей антиген, при инфекции вирусом иммунодефицита человека типа 1». Дж. Вирол. 78 (13): 7069–78. Дои:10.1128 / JVI.78.13.7069-7078.2004. ЧВК 421658. PMID 15194783.
- ^ а б Миддлтон, Д .; Menchaca, L .; Rood, H .; Комеровский, Р. (2003). «Новая база данных частот аллелей: http://www.allelefrequencies.net». Тканевые антигены. 61 (5): 403–407. Дои:10.1034 / j.1399-0039.2003.00062.x. PMID 12753660.
- ^ Фогделл-Хан А., Лигерс А., Грённинг М., Хиллер Дж., Олеруп О. (2000). «Рассеянный склероз: модифицирующее влияние генов HLA класса I на аутоиммунное заболевание, ассоциированное с HLA класса II». Тканевые антигены. 55 (2): 140–8. Дои:10.1034 / j.1399-0039.2000.550205.x. PMID 10746785.