WikiDer > PSME3

PSME3
Идентификаторы
Псевдонимы	PSME3, HEL-S-283, Ki, PA28-гамма, PA28G, PA28gamma, REG-GAMMA, субъединица активатора протеасом 3
Внешние идентификаторы	OMIM: 605129 MGI: 1096366 ГомолоГен: 2111 Генные карты: PSME3
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 17 (человек)
Конец	42,843,760 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 11 (мышь)
Конец	101,323,537 бп
Экспрессия РНК шаблон
	; ; ; ;
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• связывание p53; • Связывание с белками семейства MDM2 / MDM4; • активность активатора эндопептидазы; • GO: 0001948 связывание с белками; • идентичное связывание с белками;
Сотовый компонент	• мембрана; • комплекс активатора протеасомы; • нуклеоплазма; • протеасомный комплекс; • ядро клетки; • цитоплазма; • цитозоль;
Биологический процесс	• регуляция катаболического процесса протеасомных белков; • регуляция клеточного обмена аминокислот; • процессинг антигена и презентация экзогенного пептидного антигена через MHC класса I, TAP-зависимый; • регуляция стабильности мРНК; • положительная регуляция канонического сигнального пути Wnt; • отрицательная регуляция внешнего апоптотического сигнального пути; • полиубиквитинирование белков; • стимулирующий сигнальный путь рецептора лектина С-типа; • сигнальный путь, опосредованный фактором некроза опухоли; • Каскад MAPK; • Сигнальный путь рецептора Fc-эпсилон; • регуляция G1 / S перехода митотического клеточного цикла; • Сигнализация NIK / NF-kappaB; • клеточный цикл; • комплексно-зависимый катаболический процесс, стимулирующий анафазу; • Путь передачи сигналов рецептора Т-клеток; • отрицательная регуляция канонического сигнального пути Wnt; • положительная регуляция активности эндопептидазы; • протеасомный убиквитин-зависимый белковый катаболический процесс; • апоптотический процесс; • Путь передачи сигналов Wnt, путь планарной полярности клеток; • отрицательная регуляция перехода G2 / M митотического клеточного цикла; • деубиквитинирование белков; • SCF-зависимый протеасомный убиквитин-зависимый белковый катаболический процесс; • трансмембранный транспорт; • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II в ответ на гипоксию; • посттрансляционная модификация; • регуляция дифференцировки гемопоэтических стволовых клеток; • сигнальный путь, опосредованный интерлейкином-1; • регуляция фазового перехода митотического клеточного цикла;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	10197
	19192
	ENSG00000131467
	ENSMUSG00000078652
	P61289
	P61290
	NM_001267045; NM_005789; NM_176863; NM_001330229
	NM_011192
	NP_001253974; NP_001317158; NP_005780; NP_789839
	NP_035322
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

PSME3

Субъединица 3 комплекса активатора протеасомы это белок что у людей кодируется PSME3 ген.^[5]^[6]

Функция

Протеасома 26S представляет собой мультикаталитический протеиназный комплекс с высокоупорядоченной структурой, состоящей из 2 комплексов, ядра 20S и регулятора 19S. Ядро 20S состоит из 4 колец по 28 неидентичных субъединиц; 2 кольца состоят из 7 альфа-субъединиц и 2 кольца состоят из 7 бета-субъединиц. Регулятор 19S состоит из основания, которое содержит 6 субъединиц АТФазы и 2 субъединицы не АТФазы, и крышки, которая содержит до 10 субъединиц не АТФазы. Протеасомы в высокой концентрации распределяются по эукариотическим клеткам и расщепляют пептиды в АТФ / убиквитин-зависимом процессе нелизосомного пути. Важной функцией модифицированной протеасомы, иммунопротеасомы, является процессинг пептидов MHC класса I. Иммунопротеасома содержит альтернативный регулятор, называемый регулятором 11S или PA28, который заменяет регулятор 19S. Идентифицированы три субъединицы (альфа, бета и гамма) регулятора 11S. Этот ген кодирует гамма-субъединицу регулятора 11S. Шесть гамма-субъединиц объединяются, образуя гомогексамерное кольцо. Идентифицированы два варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы.^[6]

Взаимодействия

PSME3 был показан взаимодействовать с участием P53^[7] и Mdm2.^[7]

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000131467 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000078652 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ Альбертсен Х.М., Смит С.А., Мазойер С., Фудзимото Э., Стивенс Дж., Уильямс Б., Родригес П., Кропп С.С., Слиепчевич П., Карлсон М. (декабрь 1994 г.). «Физическая карта и гены-кандидаты в области BRCA1 на хромосоме 17q12-21». Нат Жене. 7 (4): 472–9. Дои:10.1038 / ng0894-472. PMID 7951316. S2CID 11075629.
^ ^а ^б «Ген Entrez: субъединица 3 активатора протеасомы PSME3 (просома, макропаин) (PA28 гамма; Ki)».
^ ^а ^б Zhang Z, Zhang R (март 2008 г.). «Активатор протеасомы PA28 гамма регулирует p53, усиливая его MDM2-опосредованную деградацию». EMBO J. 27 (6): 852–64. Дои:10.1038 / emboj.2008.25. ЧВК 2265109. PMID 18309296.

дальнейшее чтение

Coux O, Tanaka K, Goldberg AL (1996). «Структура и функции протеасом 20S и 26S». Анну. Преподобный Biochem. 65: 801–47. Дои:10.1146 / annurev.bi.65.070196.004101. PMID 8811196.
Гофф СП (2003). «Смерть от дезаминирования: новая система ограничения хозяина для ВИЧ-1». Ячейка. 114 (3): 281–3. Дои:10.1016 / S0092-8674 (03) 00602-0. PMID 12914693. S2CID 16340355.
Никайдо Т., Шимада К., Шибата М., Хата М., Сакамото М., Такасаки Ю., Сато К., Такахаши Т., Нишида Ю. (1990). «Клонирование и нуклеотидная последовательность кДНК антигена Ki, высококонсервативного ядерного белка, обнаруженного с помощью сывороток пациентов с системной красной волчанкой». Clin. Exp. Иммунол. 79 (2): 209–14. Дои:10.1111 / j.1365-2249.1990.tb05180.x. ЧВК 1534747. PMID 1968796.
Мики Ю., Свенсен Дж., Шаттук-Эйденс Д., Футреал ПА, Харшман К., Тавтиджан С., Лю К., Кокран С., Беннетт Л. М., Динг В. (1994). «Сильный кандидат на ген восприимчивости к раку груди и яичников BRCA1». Наука. 266 (5182): 66–71. Bibcode:1994Научный ... 266 ... 66М. Дои:10.1126 / science.7545954. PMID 7545954.
Харшман К., Белл Р., Розенталь Дж., Катчер Х., Мики Й., Свенсон Дж., Голами З., Фрай С., Динг В., Даянант П. (1995). «Сравнение методов позиционного клонирования, используемых для выделения гена BRCA1». Гм. Мол. Genet. 4 (8): 1259–66. Дои:10.1093 / hmg / 4.8.1259. PMID 7581362.
Джейкоб А., Кандпал Г., Патанджали С.Р., Кандпал Р.П. (1995). «Молекулярное клонирование и паттерн экспрессии генов из области 470 Kb рядом с локусом BRCA1 на хромосоме 17q21». Онкоген. 11 (5): 981–6. PMID 7675458.
Сигер М., Феррелл К., Франк Р., Дубиль В. (1997). «ВИЧ-1 tat ингибирует 20 S протеасому и ее активацию, опосредованную 11 S». J. Biol. Chem. 272 (13): 8145–8. Дои:10.1074 / jbc.272.13.8145. PMID 9079628.
Кандил Э., Кохда К., Ишибаши Т., Танака К., Касахара М. (1997). «Субъединицы PA28 протеасомы мыши: первичные структуры и хромосомная локализация генов». Иммуногенетика. 46 (4): 337–44. Дои:10.1007 / s002510050281. PMID 9218537. S2CID 22101213.
Маккаскер Д., Джонс Т., Шир Д., Троусдейл Дж. (1998). «Генетические отношения генов, кодирующих бета-субъединицы протеасомы человека и протеасомный комплекс PA28». Геномика. 45 (2): 362–7. Дои:10.1006 / geno.1997.4948. PMID 9344661.
Knowlton JR, Johnston SC, Whitby FG, Realini C, Zhang Z, Rechsteiner M, Hill CP (1998). «Структура протеасомного активатора REGalpha (PA28alpha)». Природа. 390 (6660): 639–43. Bibcode:1997Натура.390..639K. Дои:10.1038/37670. PMID 9403698. S2CID 4309279.
Кохда К., Ишибаши Т., Шимбара Н., Танака К., Мацуда Й., Касахара М. (1998). «Характеристика семейства генов активаторного комплекса PA28 мыши: полная организация трех генов-членов и физическая карта области размером примерно 150 т.п.н., содержащей гены альфа- и бета-субъединиц». J. Immunol. 160 (10): 4923–35. PMID 9590240.
Мадани Н., Кабат Д. (1998). «Эндогенный ингибитор вируса иммунодефицита человека в лимфоцитах человека преодолевается вирусным белком Vif». Дж. Вирол. 72 (12): 10251–5. Дои:10.1128 / JVI.72.12.10251-10255.1998. ЧВК 110608. PMID 9811770.
Wójcik C, Tanaka K, Paweletz N, Naab U, Wilk S (1999). «Субъединицы активатора протеасомы (PA28), альфа, бета и гамма (Ki антиген) в клетках-предшественниках нейронов NT2 и клетках HeLa S3». Евро. J. Cell Biol. 77 (2): 151–60. Дои:10.1016 / s0171-9335 (98) 80083-6. PMID 9840465.
Саймон Дж. Х., Гаддис NC, Фушье Р. А., Малим М. Х. (1998). «Доказательства недавно открытого клеточного фенотипа против ВИЧ-1». Nat. Med. 4 (12): 1397–400. Дои:10.1038/3987. PMID 9846577. S2CID 25235070.
Малдер LC, Muesing MA (2000). «Деградация интегразы ВИЧ-1 по пути правила N-конца». J. Biol. Chem. 275 (38): 29749–53. Дои:10.1074 / jbc.M004670200. PMID 10893419.
Арая Р., Такахаши Р., Номура Ю. (2002). «Скрининг двугибридных дрожжей с использованием конститутивно-активной каспазы-7 в качестве приманки для идентификации PA28gamma в качестве эффекторного субстрата каспазы». Разница в гибели клеток. 9 (3): 322–8. Дои:10.1038 / SJ.CDD.4400949. PMID 11859414.
Шихи AM, Гаддис NC, Чой JD, Малим MH (2002). «Выделение человеческого гена, который подавляет инфекцию ВИЧ-1 и подавляется вирусным белком Vif». Природа. 418 (6898): 646–50. Bibcode:2002Натура.418..646С. Дои:10.1038 / природа00939. PMID 12167863. S2CID 4403228.
Хуанг X, Зайферт У., Зальцманн У., Хенкляйн П., Прейсснер Р., Хенке В., Сийтс А.Дж., Клётцель П.М., Дубиль В. (2002). «Сайт RTP, общий для белка Tat ВИЧ-1 и субъединицы регулятора 11S альфа, имеет решающее значение для их эффектов на функцию протеасом, включая процессинг антигена». J. Mol. Биол. 323 (4): 771–82. Дои:10.1016 / S0022-2836 (02) 00998-1. PMID 12419264.

внешние ссылки

PSME3 расположение человеческого гена в Браузер генома UCSC.
PSME3 детали человеческого гена в Браузер генома UCSC.

Эта статья о ген на хромосома человека 17 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000131467 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000078652 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid7951316-5] Альбертсен Х.М., Смит С.А., Мазойер С., Фудзимото Э., Стивенс Дж., Уильямс Б., Родригес П., Кропп С.С., Слиепчевич П., Карлсон М. (декабрь 1994 г.). «Физическая карта и гены-кандидаты в области BRCA1 на хромосоме 17q12-21». Нат Жене. 7 (4): 472–9. Дои:10.1038 / ng0894-472. PMID 7951316. S2CID 11075629.

[entrez-6] а ^б «Ген Entrez: субъединица 3 активатора протеасомы PSME3 (просома, макропаин) (PA28 гамма; Ki)».

[pmid18309296-7] а ^б Zhang Z, Zhang R (март 2008 г.). «Активатор протеасомы PA28 гамма регулирует p53, усиливая его MDM2-опосредованную деградацию». EMBO J. 27 (6): 852–64. Дои:10.1038 / emboj.2008.25. ЧВК 2265109. PMID 18309296.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

v т е Комплекс протеасомных эндопептидаз субъединицы (EC 3.4.25.1)
А (альфа-субъединицы)	PSMA1 PSMA2 PSMA3 PSMA4 PSMA5 PSMA6 PSMA7 PSMA8
B (бета-субъединицы)	PSMB1 PSMB2 PSMB3 PSMB4 PSMB5 PSMB6 PSMB7 PSMB8 PSMB9 PSMB10
C (АТФазы)	PSMC1 PSMC2 PSMC3 PSMC4 PSMC5 PSMC6
D (не-АТФазы)	PSMD1 PSMD2 PSMD3 PSMD4 PSMD5 PSMD6 PSMD7 PSMD8 PSMD9 PSMD10 PSMD11 PSMD12 PSMD13 PSMD14
E (субъединицы активатора)	PSME1 PSME2 PSME3 PSME4
F (субъединица ингибитора)	PSMF1

Navigation