WikiDer > SPI1

SPI1
SPI1
Белок SPI1 PDB 1pue.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыSPI1, OF, PU.1, SFPI1, SPI-1, SPI-A, протоонкоген Spi-1
Внешние идентификаторыOMIM: 165170 MGI: 98282 ГомолоГен: 2346 Генные карты: SPI1
Расположение гена (человек)
Хромосома 11 (человек)
Chr.Хромосома 11 (человек)[1]
Хромосома 11 (человек)
Геномное расположение SPI1
Геномное расположение SPI1
Группа11p11.2Начинать47,354,860 бп[1]
Конец47,378,576 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE SPI1 205312 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001080547
NM_003120

NM_011355
NM_001378898
NM_001378899

RefSeq (белок)

NP_001074016
NP_003111

NP_035485
NP_001365827
NP_001365828

Расположение (UCSC)Chr 11: 47.35 - 47.38 МбChr 2: 91.08 - 91.12 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Фактор транскрипции PU.1 это белок что у людей кодируется SPI1 ген.[5]

Функция

Этот ген кодирует фактор транскрипции ETS-домена, который активирует экспрессию гена во время развития миелоидных и B-лимфоидных клеток.[6] Ядерный белок связывается с богатой пуринами последовательностью, известной как PU-бокс, обнаруженной на энхансерах генов-мишеней, и регулирует их экспрессию в координации с другими факторами транскрипции и кофакторами. Белок также может регулировать альтернативный сплайсинг генов-мишеней. Для этого гена было обнаружено множество вариантов транскриптов, кодирующих разные изоформы.[7]

Структура

Домен ETS представляет собой ДНК-связывающий модуль PU.1 и других факторов транскрипции семейства ETS.

Взаимодействия

SPI1 показал себя взаимодействовать с:

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000066336 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000002111 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Ray D, Culine S, Tavitain A, Moreau-Gachelin F (июль 1990 г.). «Человеческий гомолог предполагаемого протоонкогена Spi-1: характеристика и экспрессия в опухолях». Онкоген. 5 (5): 663–668. PMID 1693183.
  6. ^ Оикава, Т. Yamada, T; Кихара-Негиси, Ф; Ямамото, H; Кондо, N; Hitomi, Y; Хашимото, Y (июль 1999 г.). «Роль фактора транскрипции PU.1 семейства Ets в дифференцировке, пролиферации и апоптозе гемопоэтических клеток». Разница в гибели клеток. 6 (7): 599–608. Дои:10.1038 / sj.cdd.4400534. PMID 10453070.
  7. ^ «Ген Entrez: онкоген spi1 провирусной интеграции вируса фокуса селезенки SPI1 (SFFV)».
  8. ^ Hallier M, Lerga A, Barnache S, Tavitian A, Moreau-Gachelin F (февраль 1998 г.). «Фактор транскрипции Spi-1 / PU.1 взаимодействует с потенциальным фактором сплайсинга TLS». J. Biol. Chem. 273 (9): 4838–4842. Дои:10.1074 / jbc.273.9.4838. PMID 9478924.
  9. ^ Zhang P, Behre G, Pan J, Iwama A, Wara-Aswapati N, Radomska HS, Auron PE, Tenen DG, Sun Z (июль 1999 г.). «Отрицательный перекрестный обмен между регуляторами кроветворения: белки GATA репрессируют PU.1». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 96 (15): 8705–8710. Bibcode:1999PNAS ... 96.8705Z. Дои:10.1073 / пнас.96.15.8705. ЧВК 17580. PMID 10411939.
  10. ^ Брасс А.Л., Чжу А.К., Сингх Х. (февраль 1999 г.). «Требования к сборке комплексов активатора PU.1-Pip (IRF-4): ингибирующая функция in vivo с использованием слитых димеров». EMBO J. 18 (4): 977–991. Дои:10.1093 / emboj / 18.4.977. ЧВК 1171190. PMID 10022840.
  11. ^ Escalante CR, Shen L, Escalante MC, Brass AL, Edwards TA, Singh H, Aggarwal AK (июль 2002 г.). «Кристаллизация и характеристика тройного комплекса PU.1 / IRF-4 / ДНК». J. Struct. Биол. 139 (1): 55–59. Дои:10.1016 / с1047-8477 (02) 00514-2. PMID 12372320.
  12. ^ Hallier M, Tavitian A, Moreau-Gachelin F (май 1996 г.). «Фактор транскрипции Spi-1 / PU.1 связывает РНК и мешает РНК-связывающему белку p54nrb». J. Biol. Chem. 271 (19): 11177–11181. Дои:10.1074 / jbc.271.19.11177. PMID 8626664.

дальнейшее чтение

внешняя ссылка