WikiDer > Vpu белок

Vpu protein
Для других вариантов использования «VPU» см. ВПУ (значения).
Впу
PDB 1pje EBI.jpg
структура каналообразующего трансмембранного домена вирусного белка «u» (vpu) из ВИЧ-1
Идентификаторы
СимволВпу
PfamPF00558
ИнтерПроIPR008187
SCOP21впу / Объем / СУПФАМ
TCDB1.A.40
OPM суперсемейство262
Белок OPM2k7y
Уникальный вирусный белок
Идентификаторы
ОрганизмВИЧ-1
Символвпу
Entrez155945
RefSeq (Prot)NP_057855.1
UniProtP05919
Прочие данные
Хромосомавирусный геном: 0,01 - 0,01 МБ

Впу является вспомогательный белок что в ВИЧ кодируется впу ген. Vpu означает «вирусный протеин U». Белок Vpu участвует в деградации CD4 в эндоплазматический ретикулум и в усилении вирион освобождение от плазматическая мембрана инфицированных клетки.[1] Vpu вызывает деградацию вирусного рецептора CD4 и, следовательно, участвует в общем подавлении экспрессии CD4 в ходе ВИЧ-инфекции. Считается, что Vpu-опосредованная деградация CD4 предотвращает CD4-Env связывание в эндоплазматическом ретикулуме для облегчения правильной сборки Env в вирионы.[2] Он находится в мембранах инфицированных клеток, но не в самих вирусных частицах.

Ген Vpu обнаружен исключительно в ВИЧ-1 и некоторых вирусах обезьяньего иммунодефицита, связанных с ВИЧ-1 (SIV) изоляты, такие как SIVcpz, SIVgsn, и SIVпн, но не в ВИЧ-2 или большинстве изолятов SIV.[3] Структурное сходство между Vpu и другим небольшим вирусным белком, M2, кодируемым вирусом гриппа A, было впервые отмечено вскоре после открытия Vpu. С тех пор было показано, что Vpu формирует катион-селективную ионные каналы когда выражено в Xenopus ооциты или клетки млекопитающих, а также при очистке и восстановлении в плоские липидные бислои.[4] Vpu также проницает мембраны бактерий и клеток млекопитающих для малых молекул.[5] Поэтому он считается членом Виропорины семья.[6]

Выражение

Впу и Env выражаются из того же бицистронная мРНК зависящим от Rev., предположительно, за счет неплотного сканирования рибосомы через впу кодон инициации.[7] Фактически, ген Vpu перекрывается на своем 3'-конце с геном env. Было обнаружено, что несколько изолятов ВИЧ-1 несут точечные мутации в кодоне инициации трансляции Vpu, но в остальном имеют интактные гены vpu. Поскольку удаление инициирующего кодона Vpu приводит к усилению экспрессии нижележащего гена env, возможно, что ВИЧ-1 действительно использует этот механизм в качестве молекулярного переключателя для регулирования относительной экспрессии Vpu или Env в инфицированных клетках. Возможные преимущества такого регулирования неясны.[8]

Функция

На белок Vpu возложены две основные функции. Известно, что первая функция индуцирует деградацию молекулы вирусного рецептора CD4, а вторая функция заключается в усилении высвобождения вновь образованных вирионов с поверхности клетки. Vpu выполняет эти две функции с помощью двух различных механизмов. В случае CD4 Vpu действует как молекулярный адаптер для подключения CD4 к Убиквитинлигаза E3 комплекс, приводящий к деградации CD4 клеточными протеасомы. Для этого требуются сигналы, расположенные в Vpu цитоплазматический домен. С другой стороны, усиление высвобождения вируса включает нейтрализацию клеточного фактора хозяина, BST-2 (также известного как CD317, HM1.24 или привязь) и требует домена TM Vpu.[9] однако точный механизм того, как Vpu противодействует BST-2, до сих пор неясен.[8] При отсутствии Vpu, привязь связывается с вирусной оболочкой и связывает ее с клеточной мембраной и другими вирусными частицами, препятствуя высвобождению вирусных частиц. Недавние данные показывают, что трансмембранный домен BST-2 является критическим для интерференции с помощью Vpu. Взаимодействие Vpu и BST-2 приводит к подавлению активности BST-2 с поверхности клетки.[10]

БСТ-2, который является интерферон (IFN) -индуцируемый белок клеточной поверхности, по-видимому, «привязывает» ВИЧ к клетке в отсутствие Vpu. БСТ-2 - это сильно гликозилированный От 29 до 33 кДа интегральный мембранный белок с обоими трансмембранный домен и предполагаемый гликозилфосфатидилинозитол якорь (GPI).[11] На поверхности клетки BST2 проживает в липидные рафты через якорь GPI, тогда как его TM-домен лежит вне них, косвенно взаимодействуя с актиновым цитоскелетом. Первичным сайтом действия Vpu является плазматическая мембрана, где этот белок нацелен на BST-2 на клеточной поверхности посредством их взаимного связывания TM-to-TM, что приводит к лизосомам, частично зависящим от βTrCP.[12]

Структура

Вирусный белок «u» (Vpu) представляет собой олигомерный, 81-аминокислота мембранный белок типа I (16 кДа), которая транслируется с бицистронной мРНК vpu-env. В N-конец Vpu, кодирующая трансмембранный (TM) якорь, представляет собой активный домен, важный для регуляции высвобождения вируса, но не деградации CD4. В C-терминал цитоплазматический домен (54 остатка), содержащий пару сериновых остатков (в положениях 52 и 56), конститутивно фосфорилированный казеинкиназа 2. В фосфорилирование двух остатков серина в цитоплазматическом домене имеет решающее значение для деградации CD4 в ER.[13] На основе 2D 1H ЯМР-спектроскопия пептида, соответствующего цитоплазматическому домену Vpu, было предположено, что цитоплазматический домен Vpu содержит два α-спиральный домены, helix-1 и helix-2, которые связаны неструктурированной областью, содержащей два консервативных фосфосерильных остатка. Кроме того, компьютерные модели предсказывают третий α-спиральный домен в трансмембранном домене Vpu, который может играть важную роль в образовании ионные каналы.[14]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ Бур С., Шуберт Ю., Штребель К. (март 1995 г.). «Белок Vpu вируса иммунодефицита человека типа 1 специфически связывается с цитоплазматическим доменом CD4: влияние на механизм деградации». Журнал вирусологии. 69 (3): 1510–20. Дои:10.1128 / JVI.69.3.1510-1520.1995. ЧВК 188742. PMID 7853484.
  2. ^ Estrabaud E, Le Rouzic E, Lopez-Vergès S, Morel M, Belaïdouni N, Benarous R, Transy C, Berlioz-Torrent C, Margottin-Goguet F (июль 2007 г.). «Регулируемая деградация белка Vpu ВИЧ-1 посредством βTrCP-независимого пути ограничивает высвобождение вирусных частиц». PLOS Pathog. 3 (7): e104. Дои:10.1371 / journal.ppat.0030104. ЧВК 1933454. PMID 17676996.
  3. ^ Хуссейн А., Уэсли С., Халид М., Чаудри А., Джамиль С. (январь 2008 г.). «Белок Vpu вируса иммунодефицита человека типа 1 взаимодействует с CD74 и модулирует представление класса II главного комплекса гистосовместимости» (PDF). Журнал вирусологии. 82 (2): 893–902. Дои:10.1128 / JVI.01373-07. ЧВК 2224584. PMID 17959659.
  4. ^ Юарт Г.Д., Сазерленд Т., Гейдж П.В., Кокс, Великобритания (октябрь 1996 г.). «Белок Vpu вируса иммунодефицита человека 1 типа образует катион-селективные ионные каналы». Журнал вирусологии. 70 (10): 7108–15. Дои:10.1128 / JVI.70.10.7108-7115.1996. ЧВК 190763. PMID 8794357.
  5. ^ Гонсалес М.Э., Карраско Л. (сентябрь 1998 г.). «Белок Vpu вируса иммунодефицита человека типа 1 увеличивает проницаемость мембран». Биохимия. 37 (39): 13710–9. Дои:10.1021 / bi981527f. PMID 9753459.
  6. ^ Гонсалес М.Э, Карраско Л. (сентябрь 2003 г.). «Виропорины». Письма FEBS. 552 (1): 28–34. Дои:10.1016 / S0014-5793 (03) 00780-4. PMID 12972148. S2CID 209557930.
  7. ^ Göttlinger HG, Dorfman T, Cohen EA, Haseltine WA (август 1993). «Белок Vpu вируса иммунодефицита человека типа 1 усиливает высвобождение капсидов, продуцируемых генными конструкциями gag широко расходящихся ретровирусов». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 90 (15): 7381–5. Дои:10.1073 / пнас.90.15.7381. ЧВК 47141. PMID 8346259.
  8. ^ а б Штребель К. (декабрь 1996 г.). «Структура и функция ВПУ ВИЧ-1» (PDF). Лос-Аламосская национальная лаборатория.
  9. ^ Эндрю А., Штребель К. (октябрь 2010 г.). «Vpu ВИЧ-1 нацелен на маркеры клеточной поверхности CD4 и BST-2 с помощью различных механизмов». Мол. Аспекты Мед. 31 (5): 407–17. Дои:10.1016 / j.mam.2010.08.002. ЧВК 2967615. PMID 20858517.
  10. ^ Эндрю А.Дж., Мияги Э., Штребель К. (март 2011 г.). «Дифференциальные эффекты Vpu вируса иммунодефицита человека типа 1 на стабильность BST-2 / tetherin». Дж. Вирол. 85 (6): 2611–9. Дои:10.1128 / JVI.02080-10. ЧВК 3067951. PMID 21191020.
  11. ^ Дуглас Дж. Л., Вишванатан К., МакКэрролл М. Н., Гастин Дж. К., Фрю К., Моисей А. В. (август 2009 г.). «Vpu управляет деградацией фактора ограничения вируса иммунодефицита человека BST-2 / Tetherin через {beta} TrCP-зависимый механизм». Дж. Вирол. 83 (16): 7931–47. Дои:10.1128 / JVI.00242-09. ЧВК 2715753. PMID 19515779.
  12. ^ Ивабу Й, Фудзита Х, Киномото М, Канеко К., Ишизака Й, Танака Й, Сата Т, Токунага К. (декабрь 2009 г.). «Дополнительный белок ВИЧ-1 Vpu интернализует BST-2 / тетерин на клеточной поверхности посредством трансмембранных взаимодействий, ведущих к лизосомам». J. Biol. Chem. 284 (50): 35060–72. Дои:10.1074 / jbc.M109.058305. ЧВК 2787367. PMID 19837671.
  13. ^ Номагучи М., Фудзита М., Адачи А. (июль 2008 г.). «Роль белка Vpu ВИЧ-1 в распространении вируса и патогенезе». Микробы заражают. 10 (9): 960–7. Дои:10.1016 / j.micinf.2008.07.006. PMID 18672082.
  14. ^ Коэн Э.А., Тервиллигер Э. Ф., Содроски Дж. Г., Хазелтин В. А. (август 1988 г.). «Идентификация белка, кодируемого геном vpu ВИЧ-1». Природа. 334 (6182): 532–4. Дои:10.1038 / 334532a0. PMID 3043230. S2CID 4372649.

внешняя ссылка

Эта статья включает текст из общественного достояния Pfam и ИнтерПро: IPR008187