WikiDer > ДНК-геликаза Т7

T7 DNA helicase
ДНК-примаза / геликаза
Идентификаторы
ОрганизмЭнтеробактерии фаг Т7
Символ4
UniProtP03692

ДНК-геликаза Т7 (gp4) представляет собой гексамерный моторный белок, кодируемый Фаги Т7 который использует энергию от dTTP гидролиз для однонитевой обработки по одножильным ДНК, разделяя (геликаза) две нити по мере продвижения. Это также прима, образуя короткие участки РНК, которые инициируют синтез ДНК.[1] Образует комплекс с ДНК-полимераза Т7. Его гомологи обнаружены в митохрондриях (как Мерцать) и хлоропласты.[2][3]

Кристальная структура

Кристаллическая структура была решена с разрешением 3,0 Å в 2000 году, как показано на рисунке в ссылке.[4] В (A) обратите внимание, что отдельные субъединицы, по-видимому, закреплены за счет взаимодействия между альфа-спираль и соседняя субъединица. В (B) шесть наборов по три петли. Красная петля, известная как петля II, содержит три остатка лизина и, как полагают, участвует в связывании оцДНК, которая проходит через центр фермента.

Механизм последовательного гидролиза dTTP

Crampton et al. предложили механизм оцДНК-зависимого гидролиза dTTP ДНК-геликазой Т7, как показано на рисунке ниже.[5] В их модели белковые петли, расположенные на каждой гексамерной субъединице, каждая из которых содержит три лизин остатки, последовательно взаимодействуют с отрицательно заряженным фосфатным остовом оцДНК. Это взаимодействие предположительно вызывает конформационные изменения в активно связанной субъединице, обеспечивая эффективное высвобождение dTDP из его сайта связывания dTTP. В процессе высвобождения dTDP оцДНК передается соседней субъединице, которая подвергается аналогичному процессу. Предыдущие исследования уже показали, что оцДНК способна связываться с двумя гексамерными субъединицами одновременно.[6]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ Ли SJ, Ричардсон CC (октябрь 2011 г.). «Хореография репликации ДНК бактериофага Т7». Современное мнение в области химической биологии. 15 (5): 580–6. Дои:10.1016 / j.cbpa.2011.07.024. ЧВК 3195405. PMID 21907611.
  2. ^ Спелбринк Дж. Н., Ли Ф. Я., Тиранти В., Никали К., Юань К. П., Тарик М. и др. (Июль 2001 г.). «Делеции митохондриальной ДНК человека, связанные с мутациями в гене, кодирующем Twinkle, 4-подобный белок фага Т7, локализованный в митохондриях». Природа Генетика. 28 (3): 223–31. Дои:10.1038/90058. PMID 11431692.
  3. ^ Дирай-Арс, Дж; Лю, Б; Купп, JD; Хант, Т; Нильсен, Б.Л. (4 марта 2013 г.). «Ген At1g30680 Arabidopsis кодирует гомолог белка gp4 фага T7, который обладает активностью как ДНК-примазы, так и ДНК-геликазы». BMC Биология растений. 13: 36. Дои:10.1186/1471-2229-13-36. ЧВК 3610141. PMID 23452619.
  4. ^ Синглтон MR, Sawaya MR, Ellenberger T, Wigley DB (июнь 2000 г.). «Кристаллическая структура геликазы 4-го кольца гена Т7 указывает на механизм последовательного гидролиза нуклеотидов». Клетка. 101 (6): 589–600. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80871-5. PMID 10892646.
  5. ^ Crampton DJ, Mukherjee S, Richardson CC (январь 2006 г.). «ДНК-индуцированный переход от независимого к последовательному гидролизу dTTP в ДНК-геликазе бактериофага Т7». Мол. Клетка. 21 (2): 165–74. Дои:10.1016 / j.molcel.2005.11.027. PMID 16427007.
  6. ^ Yu X, Hingorani MM, Patel SS, Egelman EH (сентябрь 1996 г.). «ДНК связана в центральном отверстии с одной или двумя из шести субъединиц ДНК-геликазы Т7». Nat. Struct. Биол. 3 (9): 740–3. Дои:10.1038 / nsb0996-740. PMID 8784344.

внешняя ссылка