WikiDer > PTPRR

PTPRR
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	2A8B
Идентификаторы
Псевдонимы	PTPRR, EC-PTP, PCPTP1, PTP-SL, PTPBR7, PTPRQ, протеинтирозинфосфатаза, рецептор типа R, протеинтирозинфосфатазный рецептор типа R
Внешние идентификаторы	OMIM: 602853 MGI: 109559 ГомолоГен: 2135 Генные карты: PTPRR
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 12 (человек)
Конец	70,920,738 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 10 (мышь)
Конец	116,274,932 бп
Экспрессия РНК шаблон
	; ;
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• фосфопротеинфосфатазная активность; • фосфатазная активность; • GO: 0001948 связывание с белками; • активность протеинтирозинфосфатазы; • активность трансмембранного рецептора протеина тирозинфосфатазы; • связывание протеинкиназы; • гидролазная активность;
Сотовый компонент	• неотъемлемый компонент мембраны; • мембрана; • клеточная мембрана; • соединение клеток; • перинуклеарная область цитоплазмы; • внеклеточный; • цитоплазма; • цитозоль;
Биологический процесс	• дефосфорилирование белков; • внутриутробное эмбриональное развитие; • Путь передачи сигналов ERBB2; • регуляция адгезии гомофильных клеток; • отрицательная регуляция каскада ERK1 и ERK2; • дефосфорилирование пептидилтирозина; • отрицательная регуляция миграции эпителиальных клеток; • дефосфорилирование;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	5801
	19279
	ENSG00000153233
	ENSMUSG00000020151
	Q15256
	Q62132
	NM_001207015; NM_001207016; NM_002849; NM_130846
NM_001161837; NM_001161838; NM_001161839; NM_001161840; NM_011217;
	NM_001358484
	NP_001193944; NP_001193945; NP_002840; NP_570897
NP_001155309; NP_001155310; NP_001155311; NP_001155312; NP_035347;
	NP_001345413
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

PTPRR

Рецептор белковой тирозинфосфатазы типа R является фермент что у людей кодируется PTPRR ген.^[5]^[6]^[7]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства протеинтирозинфосфатаз (PTP). Известно, что ПТР представляют собой сигнальные молекулы, которые регулируют множество клеточных процессов, включая рост, дифференцировку, митотический цикл и онкогенную трансформацию. Этот PTP обладает внеклеточной областью, одной трансмембранной областью и одним внутриклеточным каталитическим доменом и, таким образом, представляет собой PTP рецепторного типа. Подобный ген преимущественно экспрессируется в мозг мыши Было обнаружено, что они связаны с MAP-киназами и, таким образом, регулируют их активность и клеточную локализацию. Сообщалось, что крысиный аналог этого гена регулируется фактором роста нервов, что предполагает функцию этого гена в росте и дифференцировке нейронов.^[7]

Взаимодействия

Было показано, что PTPRR взаимодействовать с участием MAPK7.^[8]

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000153233 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020151 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ Сиодзука К., Ватанабе Й, Икеда Т., Хашимото С., Кавасима Х. (ноябрь 1995 г.). «Клонирование и экспрессия PCPTP1, кодирующего протеинтирозинфосфатазу». Ген. 162 (2): 279–84. Дои:10.1016 / 0378-1119 (95) 00306-Q. PMID 7557444.
^ ван ден Маагденберг AM, Schepens JT, Schepens MT, Merkx GF, Darroudi F, Wieringa B, Geurts van Kessel A, Hendriks WJ (июль 1999 г.). «Отнесение1 гена PTP-SL / PTPBR7 (Ptprr / PTPRR) к области 8A2 хромосомы мыши путем гибридизации in situ». Cytogenet Cell Genet. 84 (3–4): 243–4. Дои:10.1159/000015268. PMID 10393441. S2CID 35964382.
^ ^а ^б «Ген Entrez: протеинтирозинфосфатаза PTPRR, рецепторный тип, R».
^ Бушбек М., Айкхофф Дж., Соммер М.Н., Ульрих А. (август 2002 г.). «Фосфотирозин-специфическая фосфатаза PTP-SL регулирует путь передачи сигнала ERK5». J. Biol. Chem. 277 (33): 29503–9. Дои:10.1074 / jbc.M202149200. PMID 12042304.

дальнейшее чтение

Шарма Э., Ломброзо П.Дж. (1995). «Нейрональная протеинтирозинфосфатаза, индуцированная фактором роста нервов». J. Biol. Chem. 270 (1): 49–53. Дои:10.1074 / jbc.270.1.49. PMID 7814416.
Огата М., Савада М., Фуджино Ю., Хамаока Т. (1995). «Клонирование кДНК и характеристика новой протеинтирозинфосфатазы рецепторного типа, экспрессируемой преимущественно в головном мозге». J. Biol. Chem. 270 (5): 2337–43. Дои:10.1074 / jbc.270.5.2337. PMID 7836467.
Пулидо Р., Суньига А., Ульрих А. (1999). «PTP-SL и STEP протеинтирозинфосфатазы регулируют активацию киназ ERK1 и ERK2, регулируемых внеклеточными сигналами, путем ассоциации через мотив взаимодействия с киназой». EMBO J. 17 (24): 7337–50. Дои:10.1093 / emboj / 17.24.7337. ЧВК 1171079. PMID 9857190.
Огата М., О-хора М., Косуги А., Хамаока Т. (1999). «Инактивация митоген-активированных протеинкиназ с помощью тирозин-специфической фосфатазы млекопитающих, PTPBR7». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 256 (1): 52–6. Дои:10.1006 / bbrc.1999.0278. PMID 10066421.
Суньига А., Торрес Дж., Убеда Дж., Пулидо Р. (1999). «Взаимодействие митоген-активированных протеинкиназ с мотивом взаимодействия киназ тирозинфосфатазы PTP-SL обеспечивает субстратную специфичность и удерживает ERK2 в цитоплазме». J. Biol. Chem. 274 (31): 21900–7. Дои:10.1074 / jbc.274.31.21900. PMID 10419510.
Бланко-Апарисио С., Торрес Дж., Пулидо Р. (2000). «Новый регуляторный механизм активации киназ MAP и ядерной транслокации, опосредованный PKA и тирозинфосфатазой PTP-SL». J. Cell Biol. 147 (6): 1129–36. Дои:10.1083 / jcb.147.6.1129. ЧВК 2168101. PMID 10601328.
Августин К.А., Сильбигер С.М., Букай Н., Улиас Л., Бойнтон А., Требаски Л.Д., Медлок Е.С. (2000). «Семейство протеинтирозинфосфатаз (PC12, Br7, S1): характеристика экспрессии у взрослого человека и мыши». Анат. Rec. 258 (3): 221–34. Дои:10.1002 / (SICI) 1097-0185 (20000301) 258: 3 <221 :: AID-AR1> 3.0.CO; 2-W. PMID 10705342.
Бектас А., Хьюз Дж. Н., Варрам Дж. Х., Кролевски А. С., Дориа А. (2001). «Локус диабета 2 типа на 12q15. Дальнейшее картирование и скрининг мутаций двух генов-кандидатов». Сахарный диабет. 50 (1): 204–8. Дои:10.2337 / диабет.50.1.204. PMID 11147789.
Szedlacsek SE, Aricescu AR, Fulga TA, Renault L, Scheidig AJ (2001). «Кристаллическая структура каталитического домена PTP-SL / PTPBR7: значение для регуляции MAP-киназы». J. Mol. Биол. 311 (3): 557–68. Дои:10.1006 / jmbi.2001.4890. PMID 11493009.
Buschbeck M, Eickhoff J, Sommer MN, Ullrich A (2002). «Фосфотирозин-специфическая фосфатаза PTP-SL регулирует путь передачи сигнала ERK5». J. Biol. Chem. 277 (33): 29503–9. Дои:10.1074 / jbc.M202149200. PMID 12042304.
Шин Б.К., Ван Х., Йим А.М., Ле Наур Ф., Брихори Ф., Джанг Дж.Х., Чжао Р., Пуравс Э., Тра Дж., Майкл К.В., Мисек Д.Э., Ханаш С.М. (2003). «Глобальное профилирование протеома клеточной поверхности раковых клеток раскрывает множество белков с функцией шаперона». J. Biol. Chem. 278 (9): 7607–16. Дои:10.1074 / jbc.M210455200. PMID 12493773.
Таррега С., Риос П., Сехудо-Марин Р., Бланко-Апарисио С., ван ден Берк Л., Шепенс Дж., Хендрикс В., Табернеро Л., Пулидо Р. (2006). «ERK2 демонстрирует рестриктивный и локально селективный механизм распознавания его инактиваторами тирозинфосфатазы, не разделяемыми его активатором MEK1». J. Biol. Chem. 280 (45): 37885–94. Дои:10.1074 / jbc.M504366200. PMID 16148006.
Эсваран Дж, фон Крис Дж. П., Марсден Б., Лонгман Е., Дебречени Дж. Э., Угочукву Е., Тернбулл А., Ли WH, Кнапп С., Барр А. Дж. (2006). «Кристаллические структуры и идентификация ингибиторов PTPN5, PTPRR и PTPN7: семейство человеческих MAPK-специфических протеинтирозинфосфатаз». Biochem. J. 395 (3): 483–91. Дои:10.1042 / BJ20051931. ЧВК 1462698. PMID 16441242.

Эта статья о ген на хромосома человека 12 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000153233 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020151 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid7557444-5] Сиодзука К., Ватанабе Й, Икеда Т., Хашимото С., Кавасима Х. (ноябрь 1995 г.). «Клонирование и экспрессия PCPTP1, кодирующего протеинтирозинфосфатазу». Ген. 162 (2): 279–84. Дои:10.1016 / 0378-1119 (95) 00306-Q. PMID 7557444.

[pmid10393441-6] ван ден Маагденберг AM, Schepens JT, Schepens MT, Merkx GF, Darroudi F, Wieringa B, Geurts van Kessel A, Hendriks WJ (июль 1999 г.). «Отнесение1 гена PTP-SL / PTPBR7 (Ptprr / PTPRR) к области 8A2 хромосомы мыши путем гибридизации in situ». Cytogenet Cell Genet. 84 (3–4): 243–4. Дои:10.1159/000015268. PMID 10393441. S2CID 35964382.

[entrez-7] а ^б «Ген Entrez: протеинтирозинфосфатаза PTPRR, рецепторный тип, R».

[pmid12042304-8] Бушбек М., Айкхофф Дж., Соммер М.Н., Ульрих А. (август 2002 г.). «Фосфотирозин-специфическая фосфатаза PTP-SL регулирует путь передачи сигнала ERK5». J. Biol. Chem. 277 (33): 29503–9. Дои:10.1074 / jbc.M202149200. PMID 12042304.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

Navigation