WikiDer > ПТПРФ

PTPRF
ПТПРФ
Белок PTPRF PDB 1lar.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыПТПРФ, LAR, BNAH2, протеинтирозинфосфатаза, рецептор типа F, протеинтирозинфосфатаза рецептор типа F
Внешние идентификаторыOMIM: 179590 MGI: 102695 ГомолоГен: 20623 Генные карты: ПТПРФ
Расположение гена (человек)
Хромосома 1 (человек)
Chr.Хромосома 1 (человек)[1]
Хромосома 1 (человек)
Геномное расположение PTPRF
Геномное расположение PTPRF
Группа1п34.2Начните43,525,187 бп[1]
Конец43,623,666 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE PTPRF 200636 s at fs.png

PBB GE PTPRF 200635 s at fs.png

PBB GE PTPRF 200637 s на fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_011213

RefSeq (белок)

NP_035343

Расположение (UCSC)Chr 1: 43.53 - 43.62 МбChr 4: 118.21 - 118.29 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Тирозин-протеинфосфатаза рецепторного типа F является фермент что у людей кодируется ПТПРФ ген.[5][6]

Белок, кодируемый этим геном, является членом протеинтирозинфосфатаза (PTP) семья. Известно, что PTP представляют собой сигнальные молекулы, которые регулируют различные клеточные процессы, включая рост клеток, дифференциация, митотический цикл и онкогенная трансформация. Этот PTP обладает внеклеточной областью, одной трансмембранной областью и двумя тандемными внутрицитоплазматическими каталитическими доменами и, таким образом, представляет собой PTP рецепторного типа. Внеклеточная область содержит три Ig-подобных домена и девять не-Ig-подобных доменов, аналогичных домену молекула адгезии нервных клеток. Было показано, что этот PTP участвует в регуляции эпителиальных межклеточных контактов в прилипает к стыкам, а также в управлении бета-катенин сигнализация. Повышенный уровень экспрессии этого белка был обнаружен в инсулин-чувствительная ткань людей с ожирением и инсулинорезистентностью, и может способствовать патогенезу резистентность к инсулину. Два альтернативно сращенный Сообщалось о вариантах транскрипта этого гена, которые кодируют различные белки.[6]

Взаимодействия

PTPRF показал себя взаимодействовать с участием Бета-катенин[7][8] и липрин-альфа-1.[9][10][11]

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000142949 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000033295 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Harder KW, Saw J, Miki N, Jirik F (ноябрь 1995 г.). «Сосуществующие амплификации генов хромосомы 1p32 (PTPRF и MYCL1), кодирующих протеинтирозинфосфатазу LAR и L-myc в линии мелкоклеточного рака легкого». Геномика. 27 (3): 552–3. Дои:10.1006 / geno.1995.1092. PMID 7558042.
  6. ^ а б «Ген Entrez: протеинтирозинфосфатаза PTPRF, рецепторный тип, F».
  7. ^ Bonvini P, An WG, Rosolen A, Nguyen P, Trepel J, Garcia de Herreros A, Dunach M, Neckers LM (февраль 2001 г.). «Гелданамицин отменяет ассоциацию ErbB2 с устойчивым к протеасомам бета-катенином в клетках меланомы, увеличивает ассоциацию бета-катенин-E-кадгерин и снижает чувствительную к бета-катенину транскрипцию». Рак Res. 61 (4): 1671–7. PMID 11245482.
  8. ^ Айхер Б., Лерх М.М., Мюллер Т., Шиллинг Дж., Ульрих А. (август 1997 г.). «Клеточное перераспределение протеинов тирозинфосфатаз LAR и PTPσ путем индуцируемого протеолитического процессинга». J. Cell Biol. 138 (3): 681–96. Дои:10.1083 / jcb.138.3.681. ЧВК 2141638. PMID 9245795.
  9. ^ Пулидо Р., Серра-Пажес С., Тан М., Штреули М. (декабрь 1995 г.). «Подсемейство LAR / PTP-дельта / PTP-сигма трансмембранных протеин-тирозин-фосфатаз: множество изоформ LAR, PTP-дельта и PTP-сигма человека экспрессируются тканеспецифическим образом и связываются с LAR-взаимодействующим белком LIP.1». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 92 (25): 11686–90. Дои:10.1073 / pnas.92.25.11686. ЧВК 40467. PMID 8524829.
  10. ^ Серра-Пажес С., Кедерша Н.Л., Фазикас Л., Медли К., Дебант А., Штреули М. (июнь 1995 г.). «Трансмембранная протеинтирозинфосфатаза LAR и LAR-взаимодействующий белок со спиральной спиралью локализуются в очаговых адгезиях». EMBO J. 14 (12): 2827–38. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1995.tb07282.x. ЧВК 398401. PMID 7796809.
  11. ^ Серра-Пажес С., Медли QG, Тан М., Харт А., Стрели М. (июнь 1998 г.). «Липрины, семейство белков, взаимодействующих с трансмембранной протеин-тирозинфосфатазой LAR». J. Biol. Chem. 273 (25): 15611–20. Дои:10.1074 / jbc.273.25.15611. PMID 9624153.

дальнейшее чтение