WikiDer > PTPRS

PTPRS
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	2FH7, 2YD2, 2YD3, 2YD9, 4БПК, 4PBX
Идентификаторы
Псевдонимы	PTPRS, PTPSIGMA, протеинтирозинфосфатаза, рецептор типа S, R-PTP-S, R-PTP-sigma, рецептор протеинтирозинфосфатазы типа S
Внешние идентификаторы	OMIM: 601576 MGI: 97815 ГомолоГен: 20626 Генные карты: PTPRS
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 19 (человек)
Конец	5,340,803 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 17 (мышь)
Конец	56,476,483 бп
Экспрессия РНК шаблон
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• фосфатазная активность; • GO: 0001948 связывание с белками; • гидролазная активность; • фосфопротеинфосфатазная активность; • активность протеинтирозинфосфатазы; • связывание гепарина; • связывание хондроитинсульфата; • гепарансульфат связывание протеогликанов;
Сотовый компонент	• неотъемлемый компонент мембраны; • неотъемлемый компонент плазматической мембраны; • внеклеточная экзосома; • мембрана; • клеточная мембрана; • неотъемлемый компонент мембраны синаптических пузырьков; • неотъемлемый компонент постсинаптической плотной мембраны; • GO: 0097483, GO: 0097481 постсинаптическая плотность; • соединение клеток; • аксон; • мембрана синаптических везикул; • цитоплазматический пузырек; • проекция клетки; • проекция нейрона; • перикарион; • синапс; • постсинаптическая мембрана; • Коллатераль Шаффера - синапс CA1; • глутаматергический синапс; • неотъемлемый компонент пресинаптической мембраны;
Биологический процесс	• клеточная адгезия; • дефосфорилирование; • дефосфорилирование белков; • отрицательное регулирование выработки интерферона-альфа; • отрицательное регулирование выработки интерферона-бета; • отрицательная регуляция сигнального пути толл-подобного рецептора 9; • негативная регуляция развития проекции нейронов; • развитие спинного мозга; • развитие мозжечка; • развитие гиппокампа; • развитие коры головного мозга; • развитие мозолистого тела; • отрицательная регуляция удлинения аксона; • дефосфорилирование пептидилтирозина; • отрицательное регулирование побочного прорастания; • отрицательная регуляция регенерации аксонов; • негативная регуляция развития дендритного позвоночника; • установление эндотелиального кишечного барьера; • модуляция химической синаптической передачи; • организация синапсов; • регуляция постсинаптической плотности сборки; • адгезия синаптической мембраны;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	5802
	19280
	ENSG00000105426
	ENSMUSG00000013236
	Q13332
	B0V2N1
	NM_002850; NM_130853; NM_130854; NM_130855
	NM_001252453; NM_001252455; NM_001252456; NM_011218
	NP_002841; NP_570923; NP_570924; NP_570925
	NP_001239382; NP_001239384; NP_001239385; NP_035348
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

PTPRS

Тирозин-протеинфосфатаза рецепторного типа S, также известен как Р-ПТП-С, Р-ПТП-сигма, или PTPσ, является фермент что у людей кодируется PTPRS ген.^[5]^[6]^[7]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства протеинтирозинфосфатаз (PTP). Известно, что PTP являются сигнальными молекулами, которые регулируют различные клеточные процессы, включая рост клеток, дифференциация, митотический цикл, и онкогенный трансформация. Этот PTP содержит внеклеточную область, единственный трансмембранный сегмент и два тандемных внутрицитоплазматических каталитических домена (D1 и D2), и, таким образом, представляет собой PTP рецепторного типа. D1 каталитически активен, а D2 каталитически неактивен. Внеклеточная область этого белка состоит из множества Ig-подобных и фибронектин домены типа III. Передача сигналов Rem2 влияет на структуру и функцию нейронов частично за счет регуляции экспрессии генов. Молекулярная и клеточная нейробиология Исследования аналогичного гена у мышей показали, что этот PTP может участвовать в межклеточное взаимодействие, первичный аксоногенез, и наведение аксонов во время эмбриогенез. Этот PTP также участвует в молекулярном контроле восстановления нервов у взрослых. Четыре альтернативно сращенный Сообщалось о вариантах транскриптов, которые кодируют разные белки.^[7]

Клиническое значение

A PTPRS белковый миметик может улучшить мышечный контроль и контроль мочевого пузыря у крыс с повреждениями спинного мозга.^[8]^[9]

Взаимодействия

PTPRS был показан взаимодействовать с участием:

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000105426 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000013236 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ Вагнер Дж., Гордон Л.А., Хенг Х.Х., Тремблей М.Л., Олсен А.С. (март 1997 г.). «Физическое картирование сигма-протеина тирозинфосфатазы рецепторного типа (PTPRS) на хромосому 19p13.3 человека». Геномика. 38 (1): 76–8. Дои:10.1006 / geno.1996.0594. PMID 8954782.
^ ^а ^б Пулидо Р., Серра-Пажес С., Тан М., Штреули М. (январь 1996 г.). «Подсемейство LAR / PTP-дельта / PTP-сигма трансмембранных протеин-тирозин-фосфатаз: множественные изоформы LAR, PTP-дельта и PTP-сигма человека экспрессируются тканеспецифическим образом и связываются с LAR-взаимодействующим белком LIP.1». Proc Natl Acad Sci U S A. 92 (25): 11686–90. Дои:10.1073 / pnas.92.25.11686. ЧВК 40467. PMID 8524829.
^ ^а ^б «Ген Entrez: протеинтирозинфосфатаза PTPRS, рецепторный тип, S».
^ ^а ^б Ланг Б.Т., Крегг Дж. М., Депол М. А., Тран А. П., Сюй К., Дайк С. М., Мадалена К. М., Браун Б. П., Вен Й, Ли С., Карими-Абдолрезаи С., Буш С. А., Шен И., Сильвер Дж. (2014). «Модуляция протеогликанового рецептора PTPσ способствует восстановлению после травмы спинного мозга». Природа. 518 (7539): 404–8. Дои:10.1038 / природа13974. ЧВК 4336236. PMID 25470046.
^ Мэгги Фокс (3 декабря 2014 г.). "'Беспрецедентный: лекарство может помочь вылечить поврежденный позвоночник ». NBC. Получено 8 декабря, 2014.
^ Уоллес MJ, Fladd C, Batt J, Rotin D (май 1998 г.). «Второй каталитический домен протеинтирозинфосфатазы дельта (PTP дельта) связывается с первым каталитическим доменом сигма PTP и ингибирует его». Мол. Cell. Биол. 18 (5): 2608–16. Дои:10.1128 / MCB.18.5.2608. ЧВК 110640. PMID 9566880.
^ Серра-Пажес С., Медли QG, Тан М., Харт А., Стрели М. (июнь 1998 г.). «Липрины, семейство белков, взаимодействующих с трансмембранной протеин-тирозинфосфатазой LAR». J. Biol. Chem. 273 (25): 15611–20. Дои:10.1074 / jbc.273.25.15611. PMID 9624153.
^ Хамасаки Х., Фудзитани М., Ямасита Т. (март 2016 г.). «NME2 связывается с PTPσ для передачи сигналов от протеогликанов хондроитинсульфата». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 471 (4): 522–7. Дои:10.1016 / j.bbrc.2016.02.042. PMID 26896769.

дальнейшее чтение

Адачи М., Секия М., Аримура Ю., Такекава М., Ито Ф., Хинода Ю., Имаи К., Ячи А. (1992). «Экспрессия протеин-тирозинфосфатазы в пре-B-клетках NALM-6». Рак Res. 52 (3): 737–40. PMID 1370651.
Эндо Н., Рутледж С.Дж., Опас Э.Е., Фогель Р., Родан Г.А., Шмидт А. (1997). «Человеческий белок тирозинфосфатаза-сигма: альтернативный сплайсинг и ингибирование бисфосфонатами». J. Bone Miner. Res. 11 (4): 535–43. Дои:10.1002 / jbmr.5650110415. PMID 8992885. S2CID 84496716.
Норрис К., Норрис Ф., Коно Д.Х., Вестергаард Х., Педерсен О., Теофилопулос А.Н., Мёллер Н.П. (1997). «Экспрессия протеин-тирозинфосфатаз в основных тканях-мишенях инсулина». FEBS Lett. 415 (3): 243–8. Дои:10.1016 / S0014-5793 (97) 01133-2. PMID 9357975. S2CID 9414519.
Уоллес MJ, Fladd C, Batt J, Rotin D (1998). «Второй каталитический домен протеинтирозинфосфатазы дельта (PTP дельта) связывается с первым каталитическим доменом сигма PTP и ингибирует его». Мол. Cell. Биол. 18 (5): 2608–16. Дои:10.1128 / MCB.18.5.2608. ЧВК 110640. PMID 9566880.
Серра-Пажес C, Medley QG, Tang M, Hart A, Streuli M (1998). «Липрины, семейство белков, взаимодействующих с трансмембранной протеин-тирозинфосфатазой LAR». J. Biol. Chem. 273 (25): 15611–20. Дои:10.1074 / jbc.273.25.15611. PMID 9624153.
Хаворт К., Шу К.К., Стокс А., Моррис Р., Стокер А. (1998). «Экспрессия рецепторных тирозинфосфатаз зависит от раздавливания седалищного нерва». Мол. Cell. Неврологи. 12 (3): 93–104. Дои:10.1006 / mcne.1998.0707. PMID 9790732. S2CID 41195720.
Elchebly M, Wagner J, Kennedy TE, Lanctôt C, Michaliszyn E, Itié A, Drouin J, Tremblay ML (1999). «Нейроэндокринная дисплазия у мышей, лишенных сигма протеинтирозинфосфатазы». Nat. Genet. 21 (3): 330–3. Дои:10.1038/6859. PMID 10080191. S2CID 19356972.
Уоллес MJ, Batt J, Fladd CA, Henderson JT, Skarnes W, Rotin D (1999). «Нейрональные дефекты и гипоплазия задней доли гипофиза у мышей, лишенных рецептора тирозинфосфатазы PTPsigma». Nat. Genet. 21 (3): 334–8. Дои:10.1038/6866. PMID 10080192. S2CID 7889181.
Суарес Пестана Е., Тенев Т., Гросс С., Стоянов Б., Огата М., Бёмер Ф.Д. (1999). «Трансмембранная протеинтирозинфосфатаза RPTPsigma модулирует передачу сигналов рецептора эпидермального фактора роста в клетках A431». Онкоген. 18 (28): 4069–79. Дои:10.1038 / sj.onc.1202794. PMID 10435588.
Blanchetot C, Tertoolen LG, Overvoorde J, den Hertog J (2003). «Внутри- и межмолекулярные взаимодействия между внутриклеточными доменами рецепторных протеин-тирозинфосфатаз». J. Biol. Chem. 277 (49): 47263–9. Дои:10.1074 / jbc.M205810200. PMID 12376545.
Бранденбергер Р., Вей Х, Чжан С., Лей С., Мурадж Дж., Фиск Дж. Дж., Ли И, Сюй С., Фанг Р., Гуглер К., Рао М. С., Мандалам Р., Лебковски Дж., Стэнтон Л. В. (2005). «Характеристика транскриптома проясняет сигнальные сети, которые контролируют рост и дифференцировку ES-клеток человека». Nat. Биотехнология. 22 (6): 707–16. Дои:10.1038 / nbt971. PMID 15146197. S2CID 27764390.
Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Секерра Р., Дусетт-Штамм Л., Кьюсик М.Э., Хилл Д.Е., Рот П.П., Видаль М. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Ху Ю.Ф., Чжан Х.Л., Цай Т., Харашима С., Ноткинс А.Л. (2006). «Интерактом ИА-2» (PDF). Диабетология. 48 (12): 2576–81. Дои:10.1007 / s00125-005-0037-у. PMID 16273344. S2CID 9765497.
Лю Т., Цянь В.Дж., Гриценко М.А., Лагерь Д.Г., Монро М.Э., Мур Р.Дж., Смит Р.Д. (2006). «Анализ N-гликопротеома плазмы человека методом иммуноаффинного вычитания, химии гидразидов и масс-спектрометрии». J. Proteome Res. 4 (6): 2070–80. Дои:10.1021 / pr0502065. ЧВК 1850943. PMID 16335952.
Ладжус С., Ланг Дж. (2006). «Вариант сплайсинга 3, но не 2 сигма рецепторной протеин-тирозинфосфатазы может опосредовать стимуляцию секреции инсулина альфа-латротоксином». J. Cell. Биохим. 98 (6): 1552–9. Дои:10.1002 / jcb.20871. PMID 16552719. S2CID 84223719.
Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф, Ли Х, Тейлор П., Клими С., Макбрум-Цераевски Л., Робинсон, доктор медицины, О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дхарси М., Хо Й, Хейлбут А., Мур Л., Чжан S, Орнатски O, Бухман YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams С.Л., Моран М.Ф., Морин Г.Б., Топалоглоу Т., Фигейз Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Мол. Syst. Биол. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК 1847948. PMID 17353931.

Эта статья о ген на хромосома человека 19 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000105426 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000013236 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid8954782-5] Вагнер Дж., Гордон Л.А., Хенг Х.Х., Тремблей М.Л., Олсен А.С. (март 1997 г.). «Физическое картирование сигма-протеина тирозинфосфатазы рецепторного типа (PTPRS) на хромосому 19p13.3 человека». Геномика. 38 (1): 76–8. Дои:10.1006 / geno.1996.0594. PMID 8954782.

[pmid8524829-6] а ^б Пулидо Р., Серра-Пажес С., Тан М., Штреули М. (январь 1996 г.). «Подсемейство LAR / PTP-дельта / PTP-сигма трансмембранных протеин-тирозин-фосфатаз: множественные изоформы LAR, PTP-дельта и PTP-сигма человека экспрессируются тканеспецифическим образом и связываются с LAR-взаимодействующим белком LIP.1». Proc Natl Acad Sci U S A. 92 (25): 11686–90. Дои:10.1073 / pnas.92.25.11686. ЧВК 40467. PMID 8524829.

[entrez-7] а ^б «Ген Entrez: протеинтирозинфосфатаза PTPRS, рецепторный тип, S».

[Lang_2014-8] а ^б Ланг Б.Т., Крегг Дж. М., Депол М. А., Тран А. П., Сюй К., Дайк С. М., Мадалена К. М., Браун Б. П., Вен Й, Ли С., Карими-Абдолрезаи С., Буш С. А., Шен И., Сильвер Дж. (2014). «Модуляция протеогликанового рецептора PTPσ способствует восстановлению после травмы спинного мозга». Природа. 518 (7539): 404–8. Дои:10.1038 / природа13974. ЧВК 4336236. PMID 25470046.

[9] Мэгги Фокс (3 декабря 2014 г.). "'Беспрецедентный: лекарство может помочь вылечить поврежденный позвоночник ». NBC. Получено 8 декабря, 2014.

[pmid9566880-10] Уоллес MJ, Fladd C, Batt J, Rotin D (май 1998 г.). «Второй каталитический домен протеинтирозинфосфатазы дельта (PTP дельта) связывается с первым каталитическим доменом сигма PTP и ингибирует его». Мол. Cell. Биол. 18 (5): 2608–16. Дои:10.1128 / MCB.18.5.2608. ЧВК 110640. PMID 9566880.

[pmid9624153-11] Серра-Пажес С., Медли QG, Тан М., Харт А., Стрели М. (июнь 1998 г.). «Липрины, семейство белков, взаимодействующих с трансмембранной протеин-тирозинфосфатазой LAR». J. Biol. Chem. 273 (25): 15611–20. Дои:10.1074 / jbc.273.25.15611. PMID 9624153.

[12] Хамасаки Х., Фудзитани М., Ямасита Т. (март 2016 г.). «NME2 связывается с PTPσ для передачи сигналов от протеогликанов хондроитинсульфата». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 471 (4): 522–7. Дои:10.1016 / j.bbrc.2016.02.042. PMID 26896769.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

Navigation