WikiDer > DUSP5

DUSP5
DUSP5
Белок DUSP5 PDB 2g6z.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыDUSP5, DUSP, HVH3, фосфатаза двойной специфичности 5
Внешние идентификаторыOMIM: 603069 MGI: 2685183 ГомолоГен: 3256 Генные карты: DUSP5
Расположение гена (человек)
Хромосома 10 (человек)
Chr.Хромосома 10 (человек)[1]
Хромосома 10 (человек)
Геномное расположение DUSP5
Геномное расположение DUSP5
Группа10q25.2Начинать110,497,907 бп[1]
Конец110,511,533 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE DUSP5 209457 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_004419

NM_001085390

RefSeq (белок)

NP_004410

NP_001078859

Расположение (UCSC)Chr 10: 110,5 - 110,51 МбChr 19: 53,53 - 53,54 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Протеинфосфатаза с двойной специфичностью 5 является фермент что у людей кодируется DUSP5 ген.[5][6]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, является членом подсемейства протеинфосфатаз с двойной специфичностью. Эти фосфатазы инактивируют свои киназы-мишени путем дефосфорилирования остатков фосфосерина / треонина и фосфотирозина. Они негативно регулируют членов суперсемейства киназ, активируемых митогеном (MAP) (MAPK / ERK, SAPK / JNK, p38), которые связаны с клеточной пролиферацией и дифференцировкой. Различные члены семейства фосфатаз с двойной специфичностью демонстрируют различные субстратные специфичности для различных MAP-киназ, различное тканевое распределение и субклеточную локализацию, а также разные способы индуцирования их экспрессии внеклеточными стимулами. Этот генный продукт инактивирует ERK1 / 2, экспрессируется во множестве тканей с самыми высокими уровнями в поджелудочной железе и головном мозге и локализуется в ядре.[6]

Модельные организмы

Модельные организмы были использованы при изучении функции DUSP5. Условный нокаутирующая мышь линия называется Dusp5tm1a (КОМП) Wtsi был создан на Wellcome Trust Sanger Institute.[7] Самцы и самки животных прошли стандартизованный фенотипический скрининг[8] для определения последствий удаления.[9][10][11][12] Проведены дополнительные проверки: - Углубленное иммунологическое фенотипирование[13]

Dusp5 нокаутный фенотип мыши[8][13]
ХарактеристикаФенотип
ИнсулинНормальный
Гомозиготная жизнеспособность на P14Нормальный
Гомозиготная фертильностьНормальный
Масса телаНормальный
Неврологический осмотрНормальный
Сила захватаНормальный
ДисморфологияНормальный
Косвенная калориметрияНормальный
Тест толерантности к глюкозеНормальный
Слуховой ответ ствола мозгаНормальный
DEXAНормальный
РентгенографияНормальный
Морфология глазаНормальный
Клиническая химияНормальный
Гематология 16 недельНормальный
Лейкоциты периферической крови 16 недельНормальный
Вес сердцаНормальный
Сальмонелла инфекционное заболеваниеНормальный
Иммунофенотипирование селезенкиНормальный
Состав эпидермального иммунитетаНормальный

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000138166 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000034765 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Martell KJ, Kwak S, Hakes DJ, Dixon JE, Трент JM (июль 1994 г.). «Хромосомная локализация четырех человеческих VH1-подобных протеин-тирозинфосфатаз». Геномика. 22 (2): 462–4. Дои:10.1006 / geno.1994.1411. HDL:2027.42/31442. PMID 7806236.
  6. ^ а б «Ген Entrez: фосфатаза 5 с двойной специфичностью DUSP5».
  7. ^ Гердин А.К. (2010). «Программа генетики мыши Сэнгера: характеристика мышей с высокой пропускной способностью». Acta Ophthalmologica. 88: 925–7. Дои:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID 85911512.
  8. ^ а б «Международный консорциум по фенотипированию мышей».
  9. ^ Скарнес В.К., Розен Б., Вест А.П., Кутсуракис М., Бушелл В., Айер В., Мухика А.О., Томас М., Харроу Дж., Кокс Т., Джексон Д., Северин Дж., Биггс П., Фу Дж., Нефедов М., де Йонг П.Дж., Стюарт AF, Брэдли А. (июнь 2011 г.). «Ресурс условного нокаута для полногеномного исследования функции генов мыши». Природа. 474 (7351): 337–42. Дои:10.1038 / природа10163. ЧВК 3572410. PMID 21677750.
  10. ^ Долгин Э (июнь 2011 г.). "Библиотека мыши настроена на нокаут". Природа. 474 (7351): 262–3. Дои:10.1038 / 474262a. PMID 21677718.
  11. ^ Коллинз Ф.С., Россант Дж., Вурст В. (январь 2007 г.). «Мышь по всем причинам». Клетка. 128 (1): 9–13. Дои:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID 17218247. S2CID 18872015.
  12. ^ Уайт Дж. К., Гердин А. К., Карп Н. А., Райдер Э., Бульян М., Басселл Дж. Н., Солсбери Дж., Клэр С., Ингем Нью-Джерси, Подрини С., Хоутон Р., Эстабель Дж., Боттомли Дж. Р., Мелвин Д. Дж., Сантер Д., Адамс, Северная Каролина, Таннахилл Д. , Logan DW, Macarthur DG, Flint J, Mahajan VB, Tsang SH, Smyth I, Watt FM, Skarnes WC, Dougan G, Adams DJ, Ramirez-Solis R, Bradley A, Steel KP (июль 2013 г.). «Полногеномное поколение и систематическое фенотипирование мышей с нокаутом открывает новые роли для многих генов». Клетка. 154 (2): 452–64. Дои:10.1016 / j.cell.2013.06.022. ЧВК 3717207. PMID 23870131.
  13. ^ а б «Консорциум иммунофенотипирования инфекций и иммунитета (3i)».

дальнейшее чтение

внешняя ссылка

  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: Q16690 (Протеинфосфатаза 5 с двойной специфичностью) на PDBe-KB.