WikiDer > Кератин 19

Keratin 19
KRT19
Идентификаторы
ПсевдонимыKRT19, CK19, K19, K1CS, кератин 19
Внешние идентификаторыOMIM: 148020 MGI: 96693 ГомолоГен: 1713 Генные карты: KRT19
Расположение гена (человек)
Хромосома 17 (человек)
Chr.Хромосома 17 (человек)[1]
Хромосома 17 (человек)
Геномное расположение KRT19
Геномное расположение KRT19
Группа17q21.2Начинать41,523,617 бп[1]
Конец41,528,308 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE KRT19 201650 в fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_002276

NM_008471
NM_001313963

RefSeq (белок)

NP_002267

NP_001300892
NP_032497

Расположение (UCSC)Chr 17: 41,52 - 41,53 Мбн / д
PubMed поиск[2][3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Кератин, цитоскелет I типа 19 также известный как цитокератин-19 (СК-19) или же кератин-19 (K19) составляет 40 кДа белок что у людей кодируется KRT19 ген.[4][5] Кератин 19 - это кератин типа I.

Функция

Кератин 19 входит в состав кератин семья. Кератины представляют собой белки промежуточных филаментов, ответственные за структурную целостность эпителиальных клеток и подразделяются на цитокератины и кератины волос.

Кератин 19 - это кератин типа I. Цитокератины типа I состоят из кислых белков, которые расположены парами гетеротипических цепей кератина. В отличие от родственников, этот самый маленький из известных кислотных цитокератин не сочетается с основным цитокератином в эпителиальные клетки. Это специально найдено в перидерма, временно поверхностный слой, покрывающий развивающийся эпидермис. Цитокератины типа I сгруппированы в области хромосомы 17q12-q21.[5]

Использовать как биомаркер

KRT19 также известен как Cyfra 21-1.[6]
Благодаря высокой чувствительности KRT19 является наиболее часто используемым маркером для ОТ-ПЦР-опосредованное обнаружение опухолевых клеток, распространенных в лимфатический узел, периферическая кровь, и Костный мозг из рак молочной железы пациенты. В зависимости от анализов было показано, что KRT19 является как специфическим, так и неспецифическим маркером. К ложным положительным результатам в таких исследованиях ОТ-ПЦР KRT19 относятся: незаконная транскрипция (экспрессия небольших количеств мРНК KRT19 тканями, в которых она не играет реальной физиологической роли), гематологические нарушения (индукция KRT19 в клетках периферической крови посредством цитокины и факторы роста, которые циркулируют в более высоких концентрациях при воспалительных состояниях и нейтропении), наличие псевдогены (были идентифицированы два псевдогена KRT19, KRT19a и KRT19b, которые имеют значительную гомологию последовательностей с мРНК KRT19. Впоследствии попытки обнаружить экспрессию аутентичного KRT19 могут привести к обнаружению одного или обоих этих псевдогенов), загрязнение образца ( введение контаминирующих эпителиальных клеток во время забора периферической крови для последующего анализа RT-PCR).[7] Кроме того, Ck-19 широко применяется в качестве послеоперационного диагностического маркера папиллярной карциномы щитовидной железы.[8]

Кератин 19 часто используется вместе с кератин 8 и кератин 18 дифференцировать клетки эпителиального происхождения от гемопоэтических клеток в тестах, которые подсчитывают циркулирующие опухолевые клетки в крови.[9]

Взаимодействия

Кератин 19 был показан взаимодействовать с Пинин.[10]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000171345 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  3. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ Schweizer J, Bowden PE, Coulombe PA, Langbein L, Lane EB, Magin TM, Maltais L, Omary MB, Parry DA, Rogers MA, Wright MW (июль 2006 г.). «Новая согласованная номенклатура кератинов млекопитающих». Журнал клеточной биологии. 174 (2): 169–74. Дои:10.1083 / jcb.200603161. ЧВК 2064177. PMID 16831889.
  5. ^ а б "Entrez Gene: KRT19 кератин 19".
  6. ^ Наката Б., Такашима Т., Огава И., Исикава Т., Хиракава К. (2004). «Сыворотка CYFRA 21-1 (фрагменты цитокератина-19) является полезным онкомаркером для обнаружения рецидива заболевания и оценки эффективности лечения рака груди». Br J Рак. 91 (5): 873–8. Дои:10.1038 / sj.bjc.6602074. ЧВК 2409884. PMID 15280913.
  7. ^ Lacroix M (декабрь 2006 г.). «Значение, обнаружение и маркеры диссеминированных клеток рака груди». Эндокринный рак. 13 (4): 1033–67. Дои:10.1677 / ERC-06-0001. PMID 17158753.
  8. ^ Dinets A, Pernemalm M, Kjellin H, Sviatoha V, Sofiadis A, Juhlin CC, Zedenius J, Larsson C, Lehtiö J, Höög A (май 2015 г.). «Дифференциальные профили экспрессии белка в жидкости кисты от папиллярной карциномы щитовидной железы и доброкачественных поражений щитовидной железы». PLOS ONE. 10 (5): e0126472. Дои:10.1371 / journal.pone.0126472. ЧВК 4433121. PMID 25978681.
  9. ^ Аллард В.Дж., Матера Дж., Миллер М.К., Реполлет М., Коннелли М.С., Рао С., Тиббе А.Г., Ур Дж. В., Терстаппен Л. В. (октябрь 2004 г.). «Опухолевые клетки циркулируют в периферической крови всех основных карцином, но не у здоровых субъектов или пациентов с незлокачественными заболеваниями». Клинические исследования рака. 10 (20): 6897–904. Дои:10.1158 / 1078-0432.CCR-04-0378. PMID 15501967.
  10. ^ Ши Дж., Сугрю С.П. (май 2000 г.). «Рассечение белковой связи между кератинами и пинином, белком с двойным расположением в комплексе десмосома-промежуточный филамент и в ядре». Журнал биологической химии. 275 (20): 14910–5. Дои:10.1074 / jbc.275.20.14910. PMID 10809736.

дальнейшее чтение